RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000140653.1

D5Ertd579e-204, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene D5Ertd579e, Length 2,014 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa39.66■■■■□ 3.94
D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 NischQ80TM9 1593 aa39.66■■■■□ 3.94
D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 Abcc9P70170 1546 aa38.49■■■■□ 3.75
D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 Abcc8B2RUS7 1588 aa38.02■■■■□ 3.68
D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 ScribQ80U72 1612 aa36.05■■■■□ 3.36
D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 Rhox8Q6VSS7 320 aa35.38■■■■□ 3.25
D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 Dcaf1Q80TR8 1506 aa35.27■■■■□ 3.24
D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 Kdm5dQ62240 1548 aa35.11■■■■□ 3.21
D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 NacadQ5SWP3 1504 aa35■■■■□ 3.19
D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa34.66■■■■□ 3.14
D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 Rtl1Q7M732 1744 aa34.61■■■■□ 3.13
D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 Ccdc180J3QNE4 1664 aa34.31■■■■□ 3.08
D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 Sycp2Q9CUU3 1500 aa34.28■■■■□ 3.08
D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 Baz1aO88379 1555 aa34.24■■■■□ 3.07
D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 Crybg2B7ZCC2 1516 aa33.87■■■■□ 3.01
D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 BicraF8VPZ9 1578 aa33.67■■■□□ 2.98
D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP33.58■■■□□ 2.97
D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 Smarca2Q6DIC0 1577 aa33.36■■■□□ 2.93
D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa32.95■■■□□ 2.87
D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa32.86■■■□□ 2.85
D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP32.54■■■□□ 2.8
D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP32.45■■■□□ 2.79
D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP32.42■■■□□ 2.78
D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 Trim41Q5NCC3 630 aa32.42■■■□□ 2.78
D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP32.36■■■□□ 2.77
D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 Synj1Q8CHC4 1574 aa32.34■■■□□ 2.77
D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 CftrP26361 1476 aa32.27■■■□□ 2.76
D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa32.22■■■□□ 2.75
D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa32.18■■■□□ 2.74
D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 HrcG5E8J6 738 aa32.16■■■□□ 2.74
D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 Ercc6F8VPZ5 1481 aa31.78■■■□□ 2.68
D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 Wdr62Q3U3T8 1523 aa31.77■■■□□ 2.68
D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP31.77■■■□□ 2.68
D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP31.77■■■□□ 2.68
D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 Frmpd1A2AKB4 1549 aa31.74■■■□□ 2.67
D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 Golga3P55937 1487 aa31.74■■■□□ 2.67
D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 Cngb1E1AZ71 1325 aa31.63■■■□□ 2.65
D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 Top2bQ64511 1612 aa31.58■■■□□ 2.65
D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 Cep164Q5DU05 1446 aa31.49■■■□□ 2.63
D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 Unc13aQ4KUS2 1712 aa31.39■■■□□ 2.62
D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa31.35■■■□□ 2.61
D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP31.33■■■□□ 2.61
D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP31.26■■■□□ 2.6
D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 Fam135aQ6NS59 1506 aa31.26■■■□□ 2.6
D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa31.23■■■□□ 2.59
D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 Chic1Q8CBW7 227 aa31.19■■■□□ 2.58
D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa31.19■■■□□ 2.58
D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 Fmn1Q05860 1466 aa31.14■■■□□ 2.58
D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 Lamc3Q9R0B6 1581 aa31.06■■■□□ 2.56
D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 TnnQ80Z71 1560 aa31.05■■■□□ 2.56
D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 Kif15Q6P9L6 1387 aa30.97■■■□□ 2.55
D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 Ubl4bQ9CQ84 188 aa30.97■■■□□ 2.55
D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP30.8■■■□□ 2.52
D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 Baz1bQ9Z277 1479 aa30.79■■■□□ 2.52
D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 Gab3Q8BSM5 595 aa30.71■■■□□ 2.51
D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 Cux2P70298 1426 aa30.7■■■□□ 2.51
D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 Ehmt2Q9Z148 1263 aaKnown RBP30.7■■■□□ 2.51
D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 Camsap1A2AHC3 1581 aa30.64■■■□□ 2.5
D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 Ccdc18Q640L5 1455 aa30.56■■■□□ 2.48
D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 Mrc2Q64449 1479 aa30.54■■■□□ 2.48
D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 Il27Q8K3I6 234 aa30.52■■■□□ 2.48
D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 Rpgrip1Q9EPQ2 1331 aa30.51■■■□□ 2.47
D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 Acin1Q9JIX8 1338 aaKnown RBP30.48■■■□□ 2.47
D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP30.43■■■□□ 2.46
D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa30.39■■■□□ 2.46
D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 Grin2bQ01097 1482 aa30.33■■■□□ 2.45
D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP30.27■■■□□ 2.44
D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 NrkQ9R0G8 1455 aa30.25■■■□□ 2.43
D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 Kif21aQ9QXL2 1672 aa30.24■■■□□ 2.43
D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 PtprkP35822 1457 aa30.23■■■□□ 2.43
D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 Shroom4Q1W617 1475 aa30.18■■■□□ 2.42
D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP30.17■■■□□ 2.42
D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP30.14■■■□□ 2.42
D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 Npm2Q80W85 207 aa30.11■■■□□ 2.41
D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 Cep162Q6ZQ06 1403 aa30.11■■■□□ 2.41
D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 Duox2A2AQ99 1517 aa30.08■■■□□ 2.41
D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 Eif4g1Q6NZJ6 1600 aaKnown RBP30.07■■■□□ 2.4
D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 Efcab5A0JP43 1406 aa30.04■■■□□ 2.4
D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 Crocc2F6XLV1 1638 aa30■■■□□ 2.39
D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 Arhgap35Q91YM2 1499 aa29.94■■■□□ 2.38
D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 Samd9lQ69Z37 1561 aa29.88■■■□□ 2.37
D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 Mroh2bQ7M6Y6 1581 aa29.83■■■□□ 2.37
D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 Plb1Q3TTY0 1478 aa29.83■■■□□ 2.37
D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa29.83■■■□□ 2.37
D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 Myt1lP97500 1187 aa29.82■■■□□ 2.36
D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP29.81■■■□□ 2.36
D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 Map3k1P53349 1493 aa29.81■■■□□ 2.36
D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 Zeb1Q64318 1117 aa29.76■■■□□ 2.35
D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 SynmQ70IV5 1561 aa29.69■■■□□ 2.34
D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 Rad54l2Q99NG0 1466 aa29.68■■■□□ 2.34
D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP29.63■■■□□ 2.33
D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 Clip1Q922J3 1391 aa29.61■■■□□ 2.33
D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 Disp1Q3TDN0 1521 aa29.59■■■□□ 2.33
D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 Ift140E9PY46 1464 aa29.58■■■□□ 2.33
D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 Carmil1Q6EDY6 1374 aa29.55■■■□□ 2.32
D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 Magi3Q9EQJ9 1476 aa29.53■■■□□ 2.32
D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 Pla2r1Q62028 1487 aa29.49■■■□□ 2.31
D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 Grin2aP35436 1464 aa29.48■■■□□ 2.31
D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 Setd1bQ8CFT2 1985 aa29.45■■■□□ 2.31
D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 Pbrm1Q8BSQ9 1634 aaKnown RBP29.44■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 11 ms