RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000114416.1

Hoxa13-202, Transcript of Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxa13, Length 769 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13-202ENSMUST00000114416 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa33.8■■■■□ 3
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Hoxa13-202ENSMUST00000114416 ScribQ80U72 1612 aa31.12■■■□□ 2.57
Hoxa13-202ENSMUST00000114416 NacadQ5SWP3 1504 aa30.14■■■□□ 2.42
Hoxa13-202ENSMUST00000114416 Kdm5dQ62240 1548 aa30.12■■■□□ 2.41
Hoxa13-202ENSMUST00000114416 Dcaf1Q80TR8 1506 aa29.72■■■□□ 2.35
Hoxa13-202ENSMUST00000114416 Sycp2Q9CUU3 1500 aa29.56■■■□□ 2.32
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Hoxa13-202ENSMUST00000114416 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa29.13■■■□□ 2.25
Hoxa13-202ENSMUST00000114416 Rhox8Q6VSS7 320 aa28.96■■■□□ 2.23
Hoxa13-202ENSMUST00000114416 Baz1aO88379 1555 aa28.72■■■□□ 2.19
Hoxa13-202ENSMUST00000114416 Ccdc180J3QNE4 1664 aa28.62■■■□□ 2.17
Hoxa13-202ENSMUST00000114416 Crybg2B7ZCC2 1516 aa28.59■■■□□ 2.17
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Hoxa13-202ENSMUST00000114416 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa28.3■■■□□ 2.12
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Hoxa13-202ENSMUST00000114416 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP28.05■■■□□ 2.08
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Hoxa13-202ENSMUST00000114416 Ercc6F8VPZ5 1481 aa27.71■■■□□ 2.03
Hoxa13-202ENSMUST00000114416 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa27.69■■■□□ 2.02
Hoxa13-202ENSMUST00000114416 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa27.59■■■□□ 2.01
Hoxa13-202ENSMUST00000114416 Wdr62Q3U3T8 1523 aa27.45■■□□□ 1.98
Hoxa13-202ENSMUST00000114416 Fam135aQ6NS59 1506 aa27.43■■□□□ 1.98
Hoxa13-202ENSMUST00000114416 Frmpd1A2AKB4 1549 aa27.42■■□□□ 1.98
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Hoxa13-202ENSMUST00000114416 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa27.11■■□□□ 1.93
Hoxa13-202ENSMUST00000114416 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa27.11■■□□□ 1.93
Hoxa13-202ENSMUST00000114416 Baz1bQ9Z277 1479 aa27.08■■□□□ 1.93
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Hoxa13-202ENSMUST00000114416 Unc13aQ4KUS2 1712 aa26.96■■□□□ 1.91
Hoxa13-202ENSMUST00000114416 Mrc2Q64449 1479 aa26.8■■□□□ 1.88
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Hoxa13-202ENSMUST00000114416 Kif15Q6P9L6 1387 aa26.47■■□□□ 1.83
Hoxa13-202ENSMUST00000114416 Mapk8ip2Q9ERE9 830 aa26.46■■□□□ 1.83
Hoxa13-202ENSMUST00000114416 Cux2P70298 1426 aa26.45■■□□□ 1.82
Hoxa13-202ENSMUST00000114416 Lamc3Q9R0B6 1581 aa26.36■■□□□ 1.81
Hoxa13-202ENSMUST00000114416 Golga3P55937 1487 aa26.19■■□□□ 1.78
Hoxa13-202ENSMUST00000114416 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa26.18■■□□□ 1.78
Hoxa13-202ENSMUST00000114416 Kif21aQ9QXL2 1672 aa26.18■■□□□ 1.78
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Hoxa13-202ENSMUST00000114416 Top2bQ64511 1612 aa26.13■■□□□ 1.77
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Hoxa13-202ENSMUST00000114416 TnnQ80Z71 1560 aa26.08■■□□□ 1.77
Hoxa13-202ENSMUST00000114416 Cep164Q5DU05 1446 aa26.06■■□□□ 1.76
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Hoxa13-202ENSMUST00000114416 Il27Q8K3I6 234 aa25.94■■□□□ 1.74
Hoxa13-202ENSMUST00000114416 Camsap1A2AHC3 1581 aa25.9■■□□□ 1.74
Hoxa13-202ENSMUST00000114416 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.74
Hoxa13-202ENSMUST00000114416 Fmn1Q05860 1466 aa25.88■■□□□ 1.73
Hoxa13-202ENSMUST00000114416 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
Hoxa13-202ENSMUST00000114416 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
Hoxa13-202ENSMUST00000114416 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
Hoxa13-202ENSMUST00000114416 Plb1Q3TTY0 1478 aa25.79■■□□□ 1.72
Hoxa13-202ENSMUST00000114416 Crocc2F6XLV1 1638 aa25.73■■□□□ 1.71
Hoxa13-202ENSMUST00000114416 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
Hoxa13-202ENSMUST00000114416 Duox2A2AQ99 1517 aa25.58■■□□□ 1.68
Hoxa13-202ENSMUST00000114416 Grin2bQ01097 1482 aa25.56■■□□□ 1.68
Hoxa13-202ENSMUST00000114416 Ift140E9PY46 1464 aa25.55■■□□□ 1.68
Hoxa13-202ENSMUST00000114416 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa25.53■■□□□ 1.68
Hoxa13-202ENSMUST00000114416 Dnajc5P60904 198 aa25.51■■□□□ 1.67
Hoxa13-202ENSMUST00000114416 Shroom2A2ALU4 1481 aa25.48■■□□□ 1.67
Hoxa13-202ENSMUST00000114416 Rusc2Q80U22 1514 aa25.45■■□□□ 1.66
Hoxa13-202ENSMUST00000114416 Disp1Q3TDN0 1521 aa25.4■■□□□ 1.66
Hoxa13-202ENSMUST00000114416 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
Hoxa13-202ENSMUST00000114416 Efcab5A0JP43 1406 aa25.38■■□□□ 1.65
Hoxa13-202ENSMUST00000114416 Samd9lQ69Z37 1561 aa25.38■■□□□ 1.65
Hoxa13-202ENSMUST00000114416 Nup160Q9Z0W3 1402 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
Hoxa13-202ENSMUST00000114416 NrkQ9R0G8 1455 aa25.28■■□□□ 1.64
Hoxa13-202ENSMUST00000114416 Pabpn1Q8CCS6 302 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
Hoxa13-202ENSMUST00000114416 Rad54l2Q99NG0 1466 aa25.22■■□□□ 1.63
Hoxa13-202ENSMUST00000114416 Cc2d2bA0A286YDU8 1405 aa25.22■■□□□ 1.63
Hoxa13-202ENSMUST00000114416 Pbrm1Q8BSQ9 1634 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
Hoxa13-202ENSMUST00000114416 PtprkP35822 1457 aa25.18■■□□□ 1.62
Hoxa13-202ENSMUST00000114416 Shroom4Q1W617 1475 aa25.18■■□□□ 1.62
Hoxa13-202ENSMUST00000114416 Magi3Q9EQJ9 1476 aa25.15■■□□□ 1.62
Hoxa13-202ENSMUST00000114416 Grin2aP35436 1464 aa25.15■■□□□ 1.62
Hoxa13-202ENSMUST00000114416 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
Hoxa13-202ENSMUST00000114416 Col17a1Q07563 1470 aa25.12■■□□□ 1.61
Hoxa13-202ENSMUST00000114416 Setd1bQ8CFT2 1985 aa25.11■■□□□ 1.61
Hoxa13-202ENSMUST00000114416 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
Hoxa13-202ENSMUST00000114416 SynmQ70IV5 1561 aa25.02■■□□□ 1.6
Hoxa13-202ENSMUST00000114416 Pla2r1Q62028 1487 aa25.01■■□□□ 1.59
Hoxa13-202ENSMUST00000114416 Gpatch8A2A6A1 1505 aa24.96■■□□□ 1.59
Hoxa13-202ENSMUST00000114416 Fgd6Q69ZL1 1399 aa24.96■■□□□ 1.59
Hoxa13-202ENSMUST00000114416 Zeb1Q64318 1117 aa24.94■■□□□ 1.58
Hoxa13-202ENSMUST00000114416 Zcchc11B2RX14 1644 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
Hoxa13-202ENSMUST00000114416 Npm2Q80W85 207 aa24.86■■□□□ 1.57
Hoxa13-202ENSMUST00000114416 Mroh2bQ7M6Y6 1581 aa24.84■■□□□ 1.57
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