RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000061706.6

E130311K13Rik-201, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene E130311K13Rik, Length 1,640 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa46,92■■■■■ 5,1
E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 NischQ80TM9 1593 aa46,34■■■■■ 5,01
E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 Abcc9P70170 1546 aa44,83■■■■■ 4,77
E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 Abcc8B2RUS7 1588 aa44,81■■■■■ 4,76
E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 ScribQ80U72 1612 aa43,19■■■■■ 4,5
E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 NacadQ5SWP3 1504 aa41,85■■■■■ 4,29
E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 Kdm5dQ62240 1548 aa41,77■■■■■ 4,28
E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 Dcaf1Q80TR8 1506 aa41,23■■■■■ 4,19
E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 Sycp2Q9CUU3 1500 aa41,04■■■■■ 4,16
E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 BicraF8VPZ9 1578 aa40,47■■■■■ 4,07
E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa40,37■■■■■ 4,05
E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 Rhox8Q6VSS7 320 aa40,05■■■■■ 4
E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 Baz1aO88379 1555 aa39,81■■■■□ 3,96
E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 Ccdc180J3QNE4 1664 aa39,78■■■■□ 3,96
E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 Crybg2B7ZCC2 1516 aa39,7■■■■□ 3,95
E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa39,39■■■■□ 3,9
E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP39,34■■■■□ 3,89
E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP39,24■■■■□ 3,87
E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP38,99■■■■□ 3,83
E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP38,98■■■■□ 3,83
E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 Smarca2Q6DIC0 1577 aa38,64■■■■□ 3,78
E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP38,63■■■■□ 3,77
E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa38,55■■■■□ 3,76
E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 Ercc6F8VPZ5 1481 aa38,48■■■■□ 3,75
E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa38,42■■■■□ 3,74
E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa38,37■■■■□ 3,73
E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 Fam135aQ6NS59 1506 aa38,11■■■■□ 3,69
E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 Wdr62Q3U3T8 1523 aa38,1■■■■□ 3,69
E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 Frmpd1A2AKB4 1549 aa38,07■■■■□ 3,68
E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 Rtl1Q7M732 1744 aa37,97■■■■□ 3,67
E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP37,88■■■■□ 3,65
E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 CftrP26361 1476 aa37,68■■■■□ 3,62
E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 Baz1bQ9Z277 1479 aa37,68■■■■□ 3,62
E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa37,6■■■■□ 3,61
E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 Synj1Q8CHC4 1574 aa37,58■■■■□ 3,61
E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP37,57■■■■□ 3,61
E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 Ubl4bQ9CQ84 188 aa37,54■■■■□ 3,6
E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa37,51■■■■□ 3,6
E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 Unc13aQ4KUS2 1712 aa37,49■■■■□ 3,59
E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 Mrc2Q64449 1479 aa37,23■■■■□ 3,55
E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP37,02■■■■□ 3,52
E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 Trim41Q5NCC3 630 aa36,96■■■■□ 3,51
E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP36,78■■■■□ 3,48
E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 Kif15Q6P9L6 1387 aa36,71■■■■□ 3,47
E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 Cux2P70298 1426 aa36,69■■■■□ 3,46
E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 Lamc3Q9R0B6 1581 aa36,57■■■■□ 3,44
E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa36,39■■■■□ 3,42
E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 Kif21aQ9QXL2 1672 aa36,36■■■■□ 3,41
E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP36,32■■■■□ 3,4
E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 Golga3P55937 1487 aa36,25■■■■□ 3,39
E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 Top2bQ64511 1612 aa36,2■■■■□ 3,39
E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 Cep164Q5DU05 1446 aa36,18■■■■□ 3,38
E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 TnnQ80Z71 1560 aa36,15■■■■□ 3,38
E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 Cngb1E1AZ71 1325 aa36,1■■■■□ 3,37
E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 Ccdc18Q640L5 1455 aa36,03■■■■□ 3,36
E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 Il27Q8K3I6 234 aa35,97■■■■□ 3,35
E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP35,92■■■■□ 3,34
E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 Camsap1A2AHC3 1581 aa35,89■■■■□ 3,34
E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP35,87■■■■□ 3,33
E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP35,87■■■■□ 3,33
E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 Fmn1Q05860 1466 aa35,84■■■■□ 3,33
E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP35,84■■■■□ 3,33
E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 Plb1Q3TTY0 1478 aa35,79■■■■□ 3,32
E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 Crocc2F6XLV1 1638 aa35,71■■■■□ 3,31
E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP35,65■■■■□ 3,3
E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 Dnajc5P60904 198 aa35,64■■■■□ 3,3
E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 Duox2A2AQ99 1517 aa35,48■■■■□ 3,27
E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 Ift140E9PY46 1464 aa35,48■■■■□ 3,27
E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 Shroom2A2ALU4 1481 aa35,46■■■■□ 3,27
E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 Grin2bQ01097 1482 aa35,43■■■■□ 3,26
E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 Rusc2Q80U22 1514 aa35,33■■■■□ 3,25
E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa35,28■■■■□ 3,24
E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 Disp1Q3TDN0 1521 aa35,24■■■■□ 3,23
E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 Efcab5A0JP43 1406 aa35,23■■■■□ 3,23
E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 Samd9lQ69Z37 1561 aa35,17■■■■□ 3,22
E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP35,14■■■■□ 3,22
E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 Pabpn1Q8CCS6 302 aaKnown RBP35,14■■■■□ 3,22
E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 Nup160Q9Z0W3 1402 aaKnown RBP35,07■■■■□ 3,21
E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 Chic1Q8CBW7 227 aa35,06■■■■□ 3,2
E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 NrkQ9R0G8 1455 aa35,05■■■■□ 3,2
E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 Pbrm1Q8BSQ9 1634 aaKnown RBP35,05■■■■□ 3,2
E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 Cc2d2bA0A286YDU8 1405 aa35,03■■■■□ 3,2
E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 Setd1bQ8CFT2 1985 aa35,01■■■■□ 3,2
E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 Col17a1Q07563 1470 aa34,96■■■■□ 3,19
E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 Rad54l2Q99NG0 1466 aa34,96■■■■□ 3,19
E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP34,9■■■■□ 3,18
E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 Grin2aP35436 1464 aa34,87■■■■□ 3,17
E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 Shroom4Q1W617 1475 aa34,87■■■■□ 3,17
E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 Magi3Q9EQJ9 1476 aa34,87■■■■□ 3,17
E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 PtprkP35822 1457 aa34,85■■■■□ 3,17
E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP34,77■■■■□ 3,16
E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 SynmQ70IV5 1561 aa34,69■■■■□ 3,14
E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 Fgd6Q69ZL1 1399 aa34,66■■■■□ 3,14
E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 Pla2r1Q62028 1487 aa34,66■■■■□ 3,14
E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 Zcchc11B2RX14 1644 aaKnown RBP34,63■■■■□ 3,14
E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 Gpatch8A2A6A1 1505 aa34,62■■■■□ 3,13
E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 Zeb1Q64318 1117 aa34,55■■■■□ 3,12
E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 Mroh2bQ7M6Y6 1581 aa34,43■■■■□ 3,1
E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 Npm2Q80W85 207 aa34,42■■■■□ 3,1
E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 AknaQ80VW7 1404 aa34,39■■■■□ 3,1
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 10,7 ms