RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000043884.5

Lrrn3-201, Transcript of Leucine-rich repeat neuronal protein 3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Lrrn3, Length 3,865 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Abcc8B2RUS7 1588 aa10.24□□□□□ -0.77
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 ScribQ80U72 1612 aa9.76□□□□□ -0.85
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Rhox8Q6VSS7 320 aa9.66□□□□□ -0.86
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Kdm5dQ62240 1548 aa9.52□□□□□ -0.88
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 NacadQ5SWP3 1504 aa9.51□□□□□ -0.89
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Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa9.34□□□□□ -0.91
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Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Baz1aO88379 1555 aa9.19□□□□□ -0.94
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Lrrn3-201ENSMUST00000043884 BicraF8VPZ9 1578 aa9.13□□□□□ -0.95
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Ccdc180J3QNE4 1664 aa9.08□□□□□ -0.96
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Crybg2B7ZCC2 1516 aa9.05□□□□□ -0.96
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa8.99□□□□□ -0.97
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Rtl1Q7M732 1744 aa8.94□□□□□ -0.98
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Smarca2Q6DIC0 1577 aa8.92□□□□□ -0.98
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Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa8.89□□□□□ -0.99
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Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Chic1Q8CBW7 227 aa8.8□□□□□ -1
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Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa8.77□□□□□ -1.01
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Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Ercc6F8VPZ5 1481 aa8.76□□□□□ -1.01
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Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Rpgrip1Q9EPQ2 1331 aa8.73□□□□□ -1.01
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Synj1Q8CHC4 1574 aa8.7□□□□□ -1.02
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Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Cngb1E1AZ71 1325 aa8.66□□□□□ -1.02
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa8.66□□□□□ -1.02
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Frmpd1A2AKB4 1549 aa8.64□□□□□ -1.03
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Wdr62Q3U3T8 1523 aa8.64□□□□□ -1.03
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa8.63□□□□□ -1.03
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Ubl4bQ9CQ84 188 aa8.61□□□□□ -1.03
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Fam135aQ6NS59 1506 aa8.53□□□□□ -1.04
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Baz1bQ9Z277 1479 aa8.53□□□□□ -1.04
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Golga3P55937 1487 aa8.5□□□□□ -1.05
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Kif15Q6P9L6 1387 aa8.49□□□□□ -1.05
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Las1lA2BE28 776 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Il27Q8K3I6 234 aa8.48□□□□□ -1.05
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Unc13aQ4KUS2 1712 aa8.48□□□□□ -1.05
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Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Cux2P70298 1426 aa8.42□□□□□ -1.06
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Mrc2Q64449 1479 aa8.41□□□□□ -1.06
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Ehmt2Q9Z148 1263 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Top2bQ64511 1612 aa8.39□□□□□ -1.07
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Lamc3Q9R0B6 1581 aa8.36□□□□□ -1.07
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Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Fmn1Q05860 1466 aa8.36□□□□□ -1.07
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa8.35□□□□□ -1.07
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Ccdc18Q640L5 1455 aa8.34□□□□□ -1.07
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Pcgf6Q99NA9 353 aa8.33□□□□□ -1.08
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Cep164Q5DU05 1446 aa8.33□□□□□ -1.08
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Gab3Q8BSM5 595 aa8.32□□□□□ -1.08
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 HrcG5E8J6 738 aa8.31□□□□□ -1.08
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 CenpbP27790 599 aa8.31□□□□□ -1.08
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 TnnQ80Z71 1560 aa8.29□□□□□ -1.08
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Mapk8ip2Q9ERE9 830 aa8.28□□□□□ -1.08
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Camsap1A2AHC3 1581 aa8.27□□□□□ -1.09
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Npm2Q80W85 207 aa8.26□□□□□ -1.09
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Kif21aQ9QXL2 1672 aa8.26□□□□□ -1.09
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Zeb1Q64318 1117 aa8.25□□□□□ -1.09
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Amer1Q7TS75 1132 aa8.22□□□□□ -1.09
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Myt1Q8CFC2 1127 aa8.21□□□□□ -1.1
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Acin1Q9JIX8 1338 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa8.19□□□□□ -1.1
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Grin2bQ01097 1482 aa8.18□□□□□ -1.1
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Plb1Q3TTY0 1478 aa8.18□□□□□ -1.1
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Crocc2F6XLV1 1638 aa8.17□□□□□ -1.1
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Duox2A2AQ99 1517 aa8.17□□□□□ -1.1
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Phf23Q8BSN5 401 aa8.17□□□□□ -1.1
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Myt1lP97500 1187 aa8.16□□□□□ -1.1
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 PtprkP35822 1457 aa8.13□□□□□ -1.11
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Efcab5A0JP43 1406 aa8.12□□□□□ -1.11
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Shroom4Q1W617 1475 aa8.11□□□□□ -1.11
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 NrkQ9R0G8 1455 aa8.11□□□□□ -1.11
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Rad54l2Q99NG0 1466 aa8.1□□□□□ -1.11
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Samd9lQ69Z37 1561 aa8.09□□□□□ -1.11
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Ift140E9PY46 1464 aa8.08□□□□□ -1.12
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa8.08□□□□□ -1.12
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Neurod1Q60867 357 aa8.06□□□□□ -1.12
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Disp1Q3TDN0 1521 aa8.04□□□□□ -1.12
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Supt5hO55201 1082 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Cep162Q6ZQ06 1403 aa8.03□□□□□ -1.12
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Grin2aP35436 1464 aa8.01□□□□□ -1.13
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