RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000032198.10

Usp18-201, Transcript of Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Usp18, Length 1,771 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp18-201ENSMUST00000032198 NischQ80TM9 1593 aa27.56■■■□□ 2
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Usp18-201ENSMUST00000032198 Abcc8B2RUS7 1588 aa26.35■■□□□ 1.81
Usp18-201ENSMUST00000032198 ScribQ80U72 1612 aa25.28■■□□□ 1.64
Usp18-201ENSMUST00000032198 Rhox8Q6VSS7 320 aa24.82■■□□□ 1.56
Usp18-201ENSMUST00000032198 Mapk8ip2Q9ERE9 830 aa24.65■■□□□ 1.54
Usp18-201ENSMUST00000032198 Dcaf1Q80TR8 1506 aa24.5■■□□□ 1.51
Usp18-201ENSMUST00000032198 Kdm5dQ62240 1548 aa24.47■■□□□ 1.51
Usp18-201ENSMUST00000032198 NacadQ5SWP3 1504 aa24.41■■□□□ 1.5
Usp18-201ENSMUST00000032198 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa24.13■■□□□ 1.45
Usp18-201ENSMUST00000032198 Rtl1Q7M732 1744 aa24.07■■□□□ 1.44
Usp18-201ENSMUST00000032198 Sycp2Q9CUU3 1500 aa23.94■■□□□ 1.42
Usp18-201ENSMUST00000032198 Ccdc180J3QNE4 1664 aa23.89■■□□□ 1.41
Usp18-201ENSMUST00000032198 Baz1aO88379 1555 aa23.83■■□□□ 1.41
Usp18-201ENSMUST00000032198 BicraF8VPZ9 1578 aa23.64■■□□□ 1.37
Usp18-201ENSMUST00000032198 Crybg2B7ZCC2 1516 aa23.51■■□□□ 1.35
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Usp18-201ENSMUST00000032198 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa22.76■■□□□ 1.23
Usp18-201ENSMUST00000032198 Trim41Q5NCC3 630 aa22.69■■□□□ 1.22
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Usp18-201ENSMUST00000032198 Ercc6F8VPZ5 1481 aa22.4■■□□□ 1.18
Usp18-201ENSMUST00000032198 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa22.39■■□□□ 1.17
Usp18-201ENSMUST00000032198 HrcG5E8J6 738 aa22.35■■□□□ 1.17
Usp18-201ENSMUST00000032198 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa22.34■■□□□ 1.17
Usp18-201ENSMUST00000032198 Wdr62Q3U3T8 1523 aa22.24■■□□□ 1.15
Usp18-201ENSMUST00000032198 Frmpd1A2AKB4 1549 aa22.21■■□□□ 1.15
Usp18-201ENSMUST00000032198 Golga3P55937 1487 aa22.19■■□□□ 1.14
Usp18-201ENSMUST00000032198 Cngb1E1AZ71 1325 aa22.16■■□□□ 1.14
Usp18-201ENSMUST00000032198 Fam135aQ6NS59 1506 aa22.15■■□□□ 1.14
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Usp18-201ENSMUST00000032198 Top2bQ64511 1612 aa22.03■■□□□ 1.12
Usp18-201ENSMUST00000032198 Unc13aQ4KUS2 1712 aa22.03■■□□□ 1.12
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Usp18-201ENSMUST00000032198 Cep164Q5DU05 1446 aa21.96■■□□□ 1.11
Usp18-201ENSMUST00000032198 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
Usp18-201ENSMUST00000032198 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa21.86■■□□□ 1.09
Usp18-201ENSMUST00000032198 Ubl4bQ9CQ84 188 aa21.82■■□□□ 1.08
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Usp18-201ENSMUST00000032198 Baz1bQ9Z277 1479 aa21.73■■□□□ 1.07
Usp18-201ENSMUST00000032198 Mrc2Q64449 1479 aa21.63■■□□□ 1.05
Usp18-201ENSMUST00000032198 TnnQ80Z71 1560 aa21.6■■□□□ 1.05
Usp18-201ENSMUST00000032198 Lamc3Q9R0B6 1581 aa21.54■■□□□ 1.04
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Usp18-201ENSMUST00000032198 Kif15Q6P9L6 1387 aa21.48■■□□□ 1.03
Usp18-201ENSMUST00000032198 Cux2P70298 1426 aa21.42■■□□□ 1.02
Usp18-201ENSMUST00000032198 Kif21aQ9QXL2 1672 aa21.3■■□□□ 1
Usp18-201ENSMUST00000032198 Camsap1A2AHC3 1581 aa21.29■■□□□ 1
Usp18-201ENSMUST00000032198 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa21.27■■□□□ 1
Usp18-201ENSMUST00000032198 Ccdc18Q640L5 1455 aa21.24■□□□□ 0.99
Usp18-201ENSMUST00000032198 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa21.23■□□□□ 0.99
Usp18-201ENSMUST00000032198 Il27Q8K3I6 234 aa21.21■□□□□ 0.99
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Usp18-201ENSMUST00000032198 Npm2Q80W85 207 aa21.1■□□□□ 0.97
Usp18-201ENSMUST00000032198 Cep162Q6ZQ06 1403 aa21.09■□□□□ 0.97
Usp18-201ENSMUST00000032198 Grin2bQ01097 1482 aa21.08■□□□□ 0.97
Usp18-201ENSMUST00000032198 NrkQ9R0G8 1455 aa21.07■□□□□ 0.96
Usp18-201ENSMUST00000032198 Shroom4Q1W617 1475 aa21.04■□□□□ 0.96
Usp18-201ENSMUST00000032198 PtprkP35822 1457 aa21.04■□□□□ 0.96
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Usp18-201ENSMUST00000032198 Zeb1Q64318 1117 aa20.79■□□□□ 0.92
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Usp18-201ENSMUST00000032198 Samd9lQ69Z37 1561 aa20.74■□□□□ 0.91
Usp18-201ENSMUST00000032198 Rpgrip1Q9EPQ2 1331 aa20.73■□□□□ 0.91
Usp18-201ENSMUST00000032198 Clip1Q922J3 1391 aa20.7■□□□□ 0.9
Usp18-201ENSMUST00000032198 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP20.7■□□□□ 0.9
Usp18-201ENSMUST00000032198 Ift140E9PY46 1464 aa20.66■□□□□ 0.9
Usp18-201ENSMUST00000032198 SynmQ70IV5 1561 aa20.65■□□□□ 0.9
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