RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 LILRA5A6NI73 299 aa23.53■■□□□ 1.36
CAPNS1-216ENST00000628306 C2orf81A6NN90 581 aa23.53■■□□□ 1.36
CAPNS1-216ENST00000628306 UGT1A9O60656 530 aa23.53■■□□□ 1.36
CAPNS1-216ENST00000628306 RFPL1O75677 317 aa23.53■■□□□ 1.36
CAPNS1-216ENST00000628306 CHN1P15882 459 aa23.53■■□□□ 1.36
CAPNS1-216ENST00000628306 CREB1P16220 341 aa23.53■■□□□ 1.36
CAPNS1-216ENST00000628306 CCNFP41002 786 aa23.53■■□□□ 1.36
CAPNS1-216ENST00000628306 MAPK9P45984 424 aa23.53■■□□□ 1.36
CAPNS1-216ENST00000628306 KLRB1Q12918 225 aa23.53■■□□□ 1.36
CAPNS1-216ENST00000628306 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
CAPNS1-216ENST00000628306 SEPT6Q14141 434 aa23.53■■□□□ 1.36
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC9B2Q86UD5 537 aa23.53■■□□□ 1.36
CAPNS1-216ENST00000628306 GPR150Q8NGU9 434 aa23.53■■□□□ 1.36
CAPNS1-216ENST00000628306 EID2BQ96D98 161 aa23.53■■□□□ 1.36
CAPNS1-216ENST00000628306 SELENOSQ9BQE4 189 aa23.53■■□□□ 1.36
CAPNS1-216ENST00000628306 UGT1A7Q9HAW7 530 aa23.53■■□□□ 1.36
CAPNS1-216ENST00000628306 UGT1A10Q9HAW8 530 aa23.53■■□□□ 1.36
CAPNS1-216ENST00000628306 UGT1A8Q9HAW9 530 aa23.53■■□□□ 1.36
CAPNS1-216ENST00000628306 KCNK9Q9NPC2 374 aa23.53■■□□□ 1.36
CAPNS1-216ENST00000628306 PRDM8Q9NQV8 689 aa23.53■■□□□ 1.36
CAPNS1-216ENST00000628306 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
CAPNS1-216ENST00000628306 KCTD3Q9Y597 815 aa23.53■■□□□ 1.36
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa23.53■■□□□ 1.36
CAPNS1-216ENST00000628306 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa23.52■■□□□ 1.36
CAPNS1-216ENST00000628306 A0A0G2JNG1 304 aa23.52■■□□□ 1.36
CAPNS1-216ENST00000628306 KIR2DS3K7RE56 304 aa23.52■■□□□ 1.36
CAPNS1-216ENST00000628306 TM9SF1O15321 606 aa23.52■■□□□ 1.36
CAPNS1-216ENST00000628306 ZWINTO95229 277 aa23.52■■□□□ 1.36
CAPNS1-216ENST00000628306 SPINT3P49223 89 aa23.52■■□□□ 1.36
CAPNS1-216ENST00000628306 GALNT3Q14435 633 aa23.52■■□□□ 1.36
CAPNS1-216ENST00000628306 KIR2DS5Q14953 304 aa23.52■■□□□ 1.36
CAPNS1-216ENST00000628306 STRA8Q7Z7C7 330 aa23.52■■□□□ 1.36
CAPNS1-216ENST00000628306 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
CAPNS1-216ENST00000628306 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa23.52■■□□□ 1.36
CAPNS1-216ENST00000628306 EPB41L1Q9H4G0 881 aa23.52■■□□□ 1.36
CAPNS1-216ENST00000628306 RMI1Q9H9A7 625 aa23.52■■□□□ 1.36
CAPNS1-216ENST00000628306 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
CAPNS1-216ENST00000628306 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa23.52■■□□□ 1.36
CAPNS1-216ENST00000628306 CROTQ9UKG9 612 aa23.52■■□□□ 1.36
CAPNS1-216ENST00000628306 PSAT1Q9Y617 370 aa23.52■■□□□ 1.36
CAPNS1-216ENST00000628306 BLACEA4D250 179 aa23.52■■□□□ 1.36
CAPNS1-216ENST00000628306 NUAK1O60285 661 aa23.52■■□□□ 1.36
CAPNS1-216ENST00000628306 SNX2O60749 519 aa23.52■■□□□ 1.36
CAPNS1-216ENST00000628306 PDGFAP04085 211 aa23.52■■□□□ 1.36
CAPNS1-216ENST00000628306 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
CAPNS1-216ENST00000628306 CLCNKAP51800 687 aa23.52■■□□□ 1.36
CAPNS1-216ENST00000628306 SH3BP2P78314 561 aa23.52■■□□□ 1.36
CAPNS1-216ENST00000628306 MPP2Q14168 576 aa23.52■■□□□ 1.36
CAPNS1-216ENST00000628306 NDUFAF2Q8N183 169 aa23.52■■□□□ 1.36
CAPNS1-216ENST00000628306 LPCAT1Q8NF37 534 aa23.52■■□□□ 1.36
CAPNS1-216ENST00000628306 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa23.52■■□□□ 1.36
CAPNS1-216ENST00000628306 RHOJQ9H4E5 214 aa23.52■■□□□ 1.36
CAPNS1-216ENST00000628306 UCK1Q9HA47 277 aa23.52■■□□□ 1.36
CAPNS1-216ENST00000628306 ATXN10Q9UBB4 475 aa23.52■■□□□ 1.36
CAPNS1-216ENST00000628306 LPOP22079 712 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
CAPNS1-216ENST00000628306 MAGEA12P43365 314 aa23.51■■□□□ 1.35
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
CAPNS1-216ENST00000628306 MLLT10P55197 1068 aa23.51■■□□□ 1.35
CAPNS1-216ENST00000628306 GNGT1P63211 74 aa23.51■■□□□ 1.35
CAPNS1-216ENST00000628306 GUCY1A3Q02108 690 aa23.51■■□□□ 1.35
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
CAPNS1-216ENST00000628306 TCTN3Q6NUS6 607 aa23.51■■□□□ 1.35
CAPNS1-216ENST00000628306 PLXDC1Q8IUK5 500 aa23.51■■□□□ 1.35
CAPNS1-216ENST00000628306 CABS1Q96KC9 395 aa23.51■■□□□ 1.35
CAPNS1-216ENST00000628306 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
CAPNS1-216ENST00000628306 ULBP3Q9BZM4 244 aa23.51■■□□□ 1.35
CAPNS1-216ENST00000628306 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC23A2Q9UGH3 650 aa23.51■■□□□ 1.35
CAPNS1-216ENST00000628306 FOXO6A8MYZ6 492 aa23.5■■□□□ 1.35
CAPNS1-216ENST00000628306 H7C0S8 307 aa23.5■■□□□ 1.35
CAPNS1-216ENST00000628306 GRID2O43424 1007 aa23.5■■□□□ 1.35
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
CAPNS1-216ENST00000628306 LSP1P33241 339 aa23.5■■□□□ 1.35
CAPNS1-216ENST00000628306 DLSTP36957 453 aa23.5■■□□□ 1.35
CAPNS1-216ENST00000628306 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
CAPNS1-216ENST00000628306 EPHB1P54762 984 aa23.5■■□□□ 1.35
CAPNS1-216ENST00000628306 INSCQ1MX18 579 aa23.5■■□□□ 1.35
CAPNS1-216ENST00000628306 MROH9Q5TGP6 573 aa23.5■■□□□ 1.35
CAPNS1-216ENST00000628306 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa23.5■■□□□ 1.35
CAPNS1-216ENST00000628306 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
CAPNS1-216ENST00000628306 GALNT6Q8NCL4 622 aa23.5■■□□□ 1.35
CAPNS1-216ENST00000628306 HDAC10Q969S8 669 aa23.5■■□□□ 1.35
CAPNS1-216ENST00000628306 APOPT1Q96IL0 206 aa23.5■■□□□ 1.35
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM83DQ9H4H8 585 aa23.5■■□□□ 1.35
CAPNS1-216ENST00000628306 FBXO5Q9UKT4 447 aa23.5■■□□□ 1.35
CAPNS1-216ENST00000628306 SPO11Q9Y5K1 396 aa23.5■■□□□ 1.35
CAPNS1-216ENST00000628306 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa23.49■■□□□ 1.35
CAPNS1-216ENST00000628306 OR5K4A6NMS3 321 aa23.49■■□□□ 1.35
CAPNS1-216ENST00000628306 AHSGP02765 367 aa23.49■■□□□ 1.35
CAPNS1-216ENST00000628306 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
CAPNS1-216ENST00000628306 CRHR1P34998 444 aa23.49■■□□□ 1.35
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC19A1P41440 591 aa23.49■■□□□ 1.35
CAPNS1-216ENST00000628306 CCT5P48643 541 aa23.49■■□□□ 1.35
CAPNS1-216ENST00000628306 PRAMEP78395 509 aa23.49■■□□□ 1.35
CAPNS1-216ENST00000628306 ERV3-1Q14264 604 aa23.49■■□□□ 1.35
CAPNS1-216ENST00000628306 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM26Q6ZUK4 368 aa23.49■■□□□ 1.35
CAPNS1-216ENST00000628306 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.4 ms