RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607882.5

RABGEF1-209, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 2,654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-209ENST00000607882 THTPAQ9BU02 230 aa12.27□□□□□ -0.44
RABGEF1-209ENST00000607882 WWP1Q9H0M0 922 aa12.27□□□□□ -0.44
RABGEF1-209ENST00000607882 TBC1D29Q9UFV1 150 aa12.27□□□□□ -0.44
RABGEF1-209ENST00000607882 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa12.27□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 HGFP14210 728 aa12.27□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 FUT4P22083 530 aa12.27□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 AKT1P31749 480 aa12.27□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 CCNFP41002 786 aa12.27□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 BLKP51451 505 aa12.27□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 DPTQ07507 201 aa12.27□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP12.27□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 NFATC2Q13469 925 aa12.27□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP12.27□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 PYCR3Q53H96 274 aa12.27□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa12.27□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 IRGCQ6NXR0 463 aa12.27□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF534Q76KX8 674 aa12.27□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 CRLF3Q8IUI8 442 aa12.27□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 UNC5BQ8IZJ1 945 aa12.27□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 CLDN19Q8N6F1 224 aa12.27□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 PPFIBP2Q8ND30 876 aa12.27□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa12.27□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 GLYATL1Q969I3 302 aa12.27□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 RTP4Q96DX8 246 aa12.27□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 CCDC3Q9BQI4 270 aa12.27□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 BOCQ9BWV1 1114 aa12.27□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 SLC17A6Q9P2U8 582 aa12.27□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa12.27□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP12.27□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 PKP3Q9Y446 797 aa12.27□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 TRABD2BA6NFA1 517 aa12.26□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 OR52A4PA6NMU1 304 aa12.26□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 FGF1P05230 155 aa12.26□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 CKMT1AP12532 417 aa12.26□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 HLA-DPA1P20036 260 aa12.26□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 KELP23276 732 aa12.26□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 MAPK9P45984 424 aa12.26□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 OR1D5P58170 312 aa12.26□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 FAM91A1Q658Y4 838 aa12.26□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa12.26□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa12.26□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa12.26□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP12.26□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF547Q8IVP9 402 aa12.26□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 NAGSQ8N159 534 aa12.26□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 RCBTB1Q8NDN9 531 aa12.26□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 CFAP61Q8NHU2 1237 aa12.26□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 FAM81AQ8TBF8 368 aa12.26□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 BTN2A2Q8WVV5 523 aa12.26□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 OR2M4Q96R27 311 aa12.26□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 TRIM4Q9C037 500 aa12.26□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 ASB8Q9H765 288 aa12.26□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 KLHL3Q9UH77 587 aa12.26□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 RNF215Q9Y6U7 377 aa12.26□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 LRP4O75096 1905 aa12.26□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa12.26□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 RAP1GDS1P52306 607 aa12.26□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP12.26□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 LRP8Q14114 963 aa12.26□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 INSCQ1MX18 579 aa12.26□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 SNAP47Q5SQN1 464 aa12.26□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa12.26□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 RNF220Q5VTB9 566 aa12.26□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 KCTD11Q693B1 232 aa12.26□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa12.26□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 SCUBE1Q8IWY4 988 aa12.26□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 ULK2Q8IYT8 1036 aa12.26□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa12.26□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 SIGLEC10Q96LC7 697 aa12.26□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 TBATAQ96M53 351 aa12.26□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 SH3GL1Q99961 368 aa12.26□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP12.26□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 LRIT1Q9P2V4 623 aa12.26□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 SLC7A8Q9UHI5 535 aa12.26□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 DGKBQ9Y6T7 804 aa12.26□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 YKT6O15498 198 aa12.25□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 MAP3K7O43318 606 aa12.25□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 GRID2O43424 1007 aa12.25□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 NOBOXO60393 691 aa12.25□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 SMIM24O75264 130 aa12.25□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP12.25□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 BPGMP07738 259 aa12.25□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP12.25□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP12.25□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa12.25□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 C16orf46Q6P387 395 aa12.25□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 TAS2R42Q7RTR8 314 aa12.25□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 GLRX5Q86SX6 157 aa12.25□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 GKN2Q86XP6 184 aa12.25□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa12.25□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 COX14Q96I36 57 aa12.25□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 PANX3Q96QZ0 392 aa12.25□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP12.25□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 TAGLN3Q9UI15 199 aa12.25□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP12.25□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 TIMM22Q9Y584 194 aa12.25□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 PDZK1P1A8MUH7 402 aa12.25□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 PPM1DO15297 605 aa12.25□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 LDB2O43679 373 aa12.25□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP12.25□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.7 ms