RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591547.5

RETREG3-211, Transcript of reticulophagy regulator family member 3, humanhuman

TSL 4

Gene RETREG3, Length 564 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETREG3-211ENST00000591547 FAM151BQ6UXP7 276 aa9.51□□□□□ -0.89
RETREG3-211ENST00000591547 GSTA5Q7RTV2 222 aa9.51□□□□□ -0.89
RETREG3-211ENST00000591547 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
RETREG3-211ENST00000591547 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa9.51□□□□□ -0.89
RETREG3-211ENST00000591547 IPMKQ8NFU5 416 aa9.51□□□□□ -0.89
RETREG3-211ENST00000591547 OR8K5Q8NH50 307 aa9.51□□□□□ -0.89
RETREG3-211ENST00000591547 KIF18AQ8NI77 898 aa9.51□□□□□ -0.89
RETREG3-211ENST00000591547 GRK7Q8WTQ7 553 aa9.51□□□□□ -0.89
RETREG3-211ENST00000591547 LURAP1Q96LR2 239 aa9.51□□□□□ -0.89
RETREG3-211ENST00000591547 RMDN2Q96LZ7 410 aa9.51□□□□□ -0.89
RETREG3-211ENST00000591547 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa9.51□□□□□ -0.89
RETREG3-211ENST00000591547 VPS35Q96QK1 796 aa9.51□□□□□ -0.89
RETREG3-211ENST00000591547 FSD1LQ9BXM9 530 aa9.51□□□□□ -0.89
RETREG3-211ENST00000591547 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa9.51□□□□□ -0.89
RETREG3-211ENST00000591547 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
RETREG3-211ENST00000591547 MAGEE1Q9HCI5 957 aa9.51□□□□□ -0.89
RETREG3-211ENST00000591547 IL26Q9NPH9 171 aa9.51□□□□□ -0.89
RETREG3-211ENST00000591547 P4HTMQ9NXG6 502 aa9.51□□□□□ -0.89
RETREG3-211ENST00000591547 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
RETREG3-211ENST00000591547 COPG2Q9UBF2 871 aa9.51□□□□□ -0.89
RETREG3-211ENST00000591547 FAM153AQ9UHL3 310 aa9.51□□□□□ -0.89
RETREG3-211ENST00000591547 CDC23Q9UJX2 597 aa9.51□□□□□ -0.89
RETREG3-211ENST00000591547 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
RETREG3-211ENST00000591547 POLEQ07864 2286 aa9.51□□□□□ -0.89
RETREG3-211ENST00000591547 ESPNB1AK53 854 aa9.5□□□□□ -0.89
RETREG3-211ENST00000591547 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
RETREG3-211ENST00000591547 DIAPH2O60879 1101 aa9.5□□□□□ -0.89
RETREG3-211ENST00000591547 ANXA9O76027 345 aa9.5□□□□□ -0.89
RETREG3-211ENST00000591547 METTL18O95568 372 aa9.5□□□□□ -0.89
RETREG3-211ENST00000591547 UMODP07911 640 aa9.5□□□□□ -0.89
RETREG3-211ENST00000591547 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa9.5□□□□□ -0.89
RETREG3-211ENST00000591547 HLA-DPA1P20036 260 aa9.5□□□□□ -0.89
RETREG3-211ENST00000591547 STIP1P31948 543 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
RETREG3-211ENST00000591547 FDFT1P37268 417 aa9.5□□□□□ -0.89
RETREG3-211ENST00000591547 VPS41P49754 854 aa9.5□□□□□ -0.89
RETREG3-211ENST00000591547 PER3P56645 1201 aa9.5□□□□□ -0.89
RETREG3-211ENST00000591547 WNT3AP56704 352 aa9.5□□□□□ -0.89
RETREG3-211ENST00000591547 KCNK10P57789 538 aa9.5□□□□□ -0.89
RETREG3-211ENST00000591547 KRTAP10-9P60411 292 aa9.5□□□□□ -0.89
RETREG3-211ENST00000591547 BASP1P80723 227 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
RETREG3-211ENST00000591547 PRPSAP1Q14558 356 aa9.5□□□□□ -0.89
RETREG3-211ENST00000591547 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
RETREG3-211ENST00000591547 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa9.5□□□□□ -0.89
RETREG3-211ENST00000591547 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
RETREG3-211ENST00000591547 METRNLQ641Q3 311 aa9.5□□□□□ -0.89
RETREG3-211ENST00000591547 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa9.5□□□□□ -0.89
RETREG3-211ENST00000591547 TRIM73Q86UV7 250 aa9.5□□□□□ -0.89
RETREG3-211ENST00000591547 KLHL7Q8IXQ5 586 aa9.5□□□□□ -0.89
RETREG3-211ENST00000591547 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
RETREG3-211ENST00000591547 CLEC1AQ8NC01 280 aa9.5□□□□□ -0.89
RETREG3-211ENST00000591547 CATSPER1Q8NEC5 780 aa9.5□□□□□ -0.89
RETREG3-211ENST00000591547 SLCO2A1Q92959 643 aa9.5□□□□□ -0.89
RETREG3-211ENST00000591547 CNDP1Q96KN2 507 aa9.5□□□□□ -0.89
RETREG3-211ENST00000591547 MRGPRX2Q96LB1 330 aa9.5□□□□□ -0.89
RETREG3-211ENST00000591547 TTC25Q96NG3 672 aa9.5□□□□□ -0.89
RETREG3-211ENST00000591547 RUNDC3BQ96NL0 473 aa9.5□□□□□ -0.89
RETREG3-211ENST00000591547 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa9.5□□□□□ -0.89
RETREG3-211ENST00000591547 MESP1Q9BRJ9 268 aa9.5□□□□□ -0.89
RETREG3-211ENST00000591547 FICDQ9BVA6 458 aa9.5□□□□□ -0.89
RETREG3-211ENST00000591547 FANCEQ9HB96 536 aa9.5□□□□□ -0.89
RETREG3-211ENST00000591547 FAM60AQ9NP50 221 aa9.5□□□□□ -0.89
RETREG3-211ENST00000591547 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa9.5□□□□□ -0.89
RETREG3-211ENST00000591547 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
RETREG3-211ENST00000591547 POMT2Q9UKY4 750 aa9.5□□□□□ -0.89
RETREG3-211ENST00000591547 C9J4A7 227 aa9.49□□□□□ -0.89
RETREG3-211ENST00000591547 E7EQ34 232 aa9.49□□□□□ -0.89
RETREG3-211ENST00000591547 BTN3A1O00481 513 aa9.49□□□□□ -0.89
RETREG3-211ENST00000591547 PEX12O00623 359 aa9.49□□□□□ -0.89
RETREG3-211ENST00000591547 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
RETREG3-211ENST00000591547 NDST3O95803 873 aa9.49□□□□□ -0.89
RETREG3-211ENST00000591547 KRT14P02533 472 aa9.49□□□□□ -0.89
RETREG3-211ENST00000591547 ALPPP05187 535 aa9.49□□□□□ -0.89
RETREG3-211ENST00000591547 EDN3P14138 238 aa9.49□□□□□ -0.89
RETREG3-211ENST00000591547 ITGA3P26006 1051 aa9.49□□□□□ -0.89
RETREG3-211ENST00000591547 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
RETREG3-211ENST00000591547 RPL22P35268 128 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
RETREG3-211ENST00000591547 FOLR3P41439 243 aa9.49□□□□□ -0.89
RETREG3-211ENST00000591547 CHRNA4P43681 627 aa9.49□□□□□ -0.89
RETREG3-211ENST00000591547 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
RETREG3-211ENST00000591547 OLIG2Q13516 323 aa9.49□□□□□ -0.89
RETREG3-211ENST00000591547 PTK6Q13882 451 aa9.49□□□□□ -0.89
RETREG3-211ENST00000591547 SSPNQ14714 243 aa9.49□□□□□ -0.89
RETREG3-211ENST00000591547 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
RETREG3-211ENST00000591547 PARP6Q2NL67 630 aa9.49□□□□□ -0.89
RETREG3-211ENST00000591547 GPRC6AQ5T6X5 926 aa9.49□□□□□ -0.89
RETREG3-211ENST00000591547 KCTD11Q693B1 232 aa9.49□□□□□ -0.89
RETREG3-211ENST00000591547 SLC25A41Q8N5S1 370 aa9.49□□□□□ -0.89
RETREG3-211ENST00000591547 PHC3Q8NDX5 983 aa9.49□□□□□ -0.89
RETREG3-211ENST00000591547 SPATA4Q8NEY3 305 aa9.49□□□□□ -0.89
RETREG3-211ENST00000591547 DNAJB14Q8TBM8 379 aa9.49□□□□□ -0.89
RETREG3-211ENST00000591547 FAR1Q8WVX9 515 aa9.49□□□□□ -0.89
RETREG3-211ENST00000591547 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa9.49□□□□□ -0.89
RETREG3-211ENST00000591547 TBL1YQ9BQ87 522 aa9.49□□□□□ -0.89
RETREG3-211ENST00000591547 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
RETREG3-211ENST00000591547 TRIM51Q9BSJ1 452 aa9.49□□□□□ -0.89
RETREG3-211ENST00000591547 XKR8Q9H6D3 395 aa9.49□□□□□ -0.89
RETREG3-211ENST00000591547 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa9.49□□□□□ -0.89
RETREG3-211ENST00000591547 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
RETREG3-211ENST00000591547 RAB6BQ9NRW1 208 aa9.49□□□□□ -0.89
RETREG3-211ENST00000591547 C1GALT1Q9NS00 363 aa9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.2 ms