RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578093.1

PTPRM-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 464 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-206ENST00000578093 CAPN1P07384 714 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRM-206ENST00000578093 MMP2P08253 660 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRM-206ENST00000578093 CD48P09326 243 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRM-206ENST00000578093 PIRTP0C851 137 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRM-206ENST00000578093 ZNF30P17039 623 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRM-206ENST00000578093 NELFEP18615 380 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
PTPRM-206ENST00000578093 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
PTPRM-206ENST00000578093 PTPN4P29074 926 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRM-206ENST00000578093 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
PTPRM-206ENST00000578093 MMP13P45452 471 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRM-206ENST00000578093 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
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PTPRM-206ENST00000578093 ITGA1P56199 1179 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRM-206ENST00000578093 NIPAL4Q0D2K0 466 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRM-206ENST00000578093 MAMLD1Q13495 774 aa3.85□□□□□ -1.79
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PTPRM-206ENST00000578093 ATP1A4Q13733 1029 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRM-206ENST00000578093 GALNT3Q14435 633 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRM-206ENST00000578093 IL11RAQ14626 422 aa3.85□□□□□ -1.79
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PTPRM-206ENST00000578093 INSCQ1MX18 579 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRM-206ENST00000578093 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
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PTPRM-206ENST00000578093 ACAD10Q6JQN1 1059 aa3.85□□□□□ -1.79
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PTPRM-206ENST00000578093 DCUN1D2Q6PH85 259 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRM-206ENST00000578093 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
PTPRM-206ENST00000578093 C11orf96Q7Z7L8 435 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRM-206ENST00000578093 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRM-206ENST00000578093 SYVN1Q86TM6 617 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRM-206ENST00000578093 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRM-206ENST00000578093 ZNF547Q8IVP9 402 aa3.85□□□□□ -1.79
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PTPRM-206ENST00000578093 TTC30BQ8N4P2 665 aa3.85□□□□□ -1.79
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PTPRM-206ENST00000578093 GPR26Q8NDV2 337 aa3.85□□□□□ -1.79
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PTPRM-206ENST00000578093 SLC41A2Q96JW4 573 aa3.85□□□□□ -1.79
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PTPRM-206ENST00000578093 IPPKQ9H8X2 491 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRM-206ENST00000578093 UCK1Q9HA47 277 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRM-206ENST00000578093 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
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PTPRM-206ENST00000578093 CATSPERZQ9NTU4 200 aa3.85□□□□□ -1.79
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PTPRM-206ENST00000578093 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa3.84□□□□□ -1.79
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PTPRM-206ENST00000578093 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa3.84□□□□□ -1.79
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PTPRM-206ENST00000578093 TMEM191CA6NGB0 347 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRM-206ENST00000578093 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.79
PTPRM-206ENST00000578093 CHUKO15111 745 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRM-206ENST00000578093 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP3.84□□□□□ -1.79
PTPRM-206ENST00000578093 PRPSAP2O60256 369 aa3.84□□□□□ -1.79
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