RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551137.5

CS-223, Transcript of citrate synthase, human

TSL 3

Gene CS, Length 903 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-223	ENST00000551137	HBQ1	P09105	142 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	PRKAR1A	P10644	381 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	PAM	P19021	973 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	PTPN4	P29074	926 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	PKLR	P30613	574 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	RPS15	P62841	145 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	ABR	Q12979	859 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	TRIP13	Q15645	432 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	ZIC1	Q15915	447 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	ANKRD20A4	Q4UJ75	823 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	CTSL3P	Q5NE16	218 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	ANKRD22	Q5VYY1	191 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	PTRHD1	Q6GMV3	140 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	NEPRO	Q6NW34	567 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	SYVN1	Q86TM6	617 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	APLF	Q8IW19	511 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	LMNTD2	Q8IXW0	634 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	KRT222	Q8N1A0	295 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	NAT8L	Q8N9F0	302 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	C19orf47	Q8N9M1	422 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	OR2L8	Q8NGY9	312 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	GRK7	Q8WTQ7	553 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	RAD51AP1	Q96B01	352 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	PDLIM2	Q96JY6	352 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	SERPINB12	Q96P63	405 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	RAB11FIP5	Q9BXF6	653 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	NLN	Q9BYT8	704 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	ACTL8	Q9H568	366 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	FAM60A	Q9NP50	221 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	KLHL42	Q9P2K6	505 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	POLH	Q9Y253	713 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	FARSA	Q9Y285	508 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	AP1M2	Q9Y6Q5	423 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	ASH1L	Q9NR48	2969 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	NBAS	A2RRP1	2371 aa		11.08	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	ZCWPW2	A0A1B0GU75	182 aa		11.08	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137		E7EQ34	232 aa		11.08	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137		J3QKU1	62 aa		11.08	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	RASGRF2	O14827	1237 aa		11.08	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	SUV39H1	O43463	412 aa		11.08	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	PRICKLE3	O43900	615 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	KIF5C	O60282	957 aa		11.08	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	MATN4	O95460	622 aa		11.08	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	S1PR4	O95977	384 aa		11.08	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	CAPN1	P07384	714 aa		11.08	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	FURIN	P09958	794 aa		11.08	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	PVR	P15151	417 aa		11.08	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	CD9	P21926	228 aa		11.08	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	PEBP1	P30086	187 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	CCNF	P41002	786 aa		11.08	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	VPS41	P49754	854 aa		11.08	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	ITGA1	P56199	1179 aa		11.08	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	NFATC3	Q12968	1075 aa		11.08	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	ERV3-1	Q14264	604 aa		11.08	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	UGT8	Q16880	541 aa		11.08	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	DEFB109B	Q30KR1	87 aa		11.08	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	ZNF385C	Q66K41	422 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	C16orf46	Q6P387	395 aa		11.08	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	FAM199X	Q6PEV8	388 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	CES3	Q6UWW8	571 aa		11.08	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	CENPU	Q71F23	418 aa		11.08	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	OTOA	Q7RTW8	1153 aa		11.08	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	HOOK3	Q86VS8	718 aa		11.08	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	CILP2	Q8IUL8	1156 aa		11.08	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	DNAJC22	Q8N4W6	341 aa		11.08	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	LINC01555	Q8NAE3	123 aa		11.08	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	THAP4	Q8WY91	577 aa		11.08	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	MR1	Q95460	341 aa		11.08	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	SIGLEC10	Q96LC7	697 aa		11.08	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	CHST8	Q9H2A9	424 aa		11.08	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	ACTR5	Q9H9F9	607 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	PCMTD2	Q9NV79	361 aa		11.08	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	INTS10	Q9NVR2	710 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	SAMD15	Q9P1V8	674 aa		11.08	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	PCYOX1	Q9UHG3	505 aa		11.08	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	TDRKH	Q9Y2W6	561 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	KLK4	Q9Y5K2	254 aa		11.08	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	UBR5	O95071	2799 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	GOLGA6L10	A0A0M3HER8	536 aa		11.07	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	ZNF749	O43361	778 aa		11.07	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	KATNA1	O75449	491 aa		11.07	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	USP1	O94782	785 aa		11.07	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	C1orf105	O95561	183 aa		11.07	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	TCP1	P17987	556 aa	Known RBP	11.07	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	CYP2A7	P20853	494 aa		11.07	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	GCGR	P47871	477 aa		11.07	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	PMS2	P54278	862 aa		11.07	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	CSE1L	P55060	971 aa	Known RBP	11.07	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	EIF3B	P55884	814 aa	Known RBP	11.07	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	ATP1A1-AS1	Q5TC04	95 aa		11.07	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	PRAMEF17	Q5VTA0	474 aa		11.07	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	RHBDD2	Q6NTF9	364 aa		11.07	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	TCTN3	Q6NUS6	607 aa		11.07	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	TTC23L	Q6PF05	361 aa		11.07	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	TRIM73	Q86UV7	250 aa		11.07	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	PPIL6	Q8IXY8	311 aa		11.07	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	SYTL1	Q8IYJ3	562 aa		11.07	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	GPR135	Q8IZ08	494 aa		11.07	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	AGGF1	Q8N302	714 aa	eCLIP	11.07	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	GSDMB	Q8TAX9	411 aa		11.07	□□□□□ -0.64

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