RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539804.1

PITX3-202, Transcript of paired like homeodomain 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PITX3, Length 1,187 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3-202ENST00000539804 CRELD1Q96HD1 420 aa23.46■■□□□ 1.35
PITX3-202ENST00000539804 XKR8Q9H6D3 395 aa23.46■■□□□ 1.35
PITX3-202ENST00000539804 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa23.46■■□□□ 1.35
PITX3-202ENST00000539804 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa23.45■■□□□ 1.35
PITX3-202ENST00000539804 A0A0J9YY10 115 aa23.45■■□□□ 1.34
PITX3-202ENST00000539804 ISM1B1AKI9 464 aa23.45■■□□□ 1.34
PITX3-202ENST00000539804 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
PITX3-202ENST00000539804 VPS26AO75436 327 aa23.45■■□□□ 1.34
PITX3-202ENST00000539804 CD9P21926 228 aa23.45■■□□□ 1.34
PITX3-202ENST00000539804 PKLRP30613 574 aa23.45■■□□□ 1.34
PITX3-202ENST00000539804 STAT5AP42229 794 aa23.45■■□□□ 1.34
PITX3-202ENST00000539804 SLC1A2P43004 574 aa23.45■■□□□ 1.34
PITX3-202ENST00000539804 ITGA8P53708 1063 aa23.45■■□□□ 1.34
PITX3-202ENST00000539804 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
PITX3-202ENST00000539804 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
PITX3-202ENST00000539804 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
PITX3-202ENST00000539804 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa23.45■■□□□ 1.34
PITX3-202ENST00000539804 SYT10Q6XYQ8 523 aa23.45■■□□□ 1.34
PITX3-202ENST00000539804 TMEM126BQ8IUX1 230 aa23.45■■□□□ 1.34
PITX3-202ENST00000539804 VRK3Q8IV63 474 aa23.45■■□□□ 1.34
PITX3-202ENST00000539804 OR2L8Q8NGY9 312 aa23.45■■□□□ 1.34
PITX3-202ENST00000539804 SLC45A3Q96JT2 553 aa23.45■■□□□ 1.34
PITX3-202ENST00000539804 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa23.45■■□□□ 1.34
PITX3-202ENST00000539804 SPATA7Q9P0W8 599 aa23.45■■□□□ 1.34
PITX3-202ENST00000539804 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
PITX3-202ENST00000539804 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
PITX3-202ENST00000539804 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
PITX3-202ENST00000539804 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa23.45■■□□□ 1.34
PITX3-202ENST00000539804 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa23.44■■□□□ 1.34
PITX3-202ENST00000539804 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa23.44■■□□□ 1.34
PITX3-202ENST00000539804 SDK2Q58EX2 2172 aa23.44■■□□□ 1.34
PITX3-202ENST00000539804 C21orf140B9A014 251 aa23.44■■□□□ 1.34
PITX3-202ENST00000539804 NIPSNAP2O75323 286 aa23.44■■□□□ 1.34
PITX3-202ENST00000539804 CATP04040 527 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
PITX3-202ENST00000539804 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
PITX3-202ENST00000539804 UGT2B7P16662 529 aa23.44■■□□□ 1.34
PITX3-202ENST00000539804 CTBP1Q13363 440 aa23.44■■□□□ 1.34
PITX3-202ENST00000539804 GBX1Q14549 363 aa23.44■■□□□ 1.34
PITX3-202ENST00000539804 VASH2Q86V25 355 aa23.44■■□□□ 1.34
PITX3-202ENST00000539804 GPR135Q8IZ08 494 aa23.44■■□□□ 1.34
PITX3-202ENST00000539804 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
PITX3-202ENST00000539804 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
PITX3-202ENST00000539804 DENND1AQ8TEH3 1009 aa23.44■■□□□ 1.34
PITX3-202ENST00000539804 INPP5DQ92835 1189 aa23.44■■□□□ 1.34
PITX3-202ENST00000539804 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
PITX3-202ENST00000539804 ELMO2Q96JJ3 720 aa23.44■■□□□ 1.34
PITX3-202ENST00000539804 LRFN5Q96NI6 719 aa23.44■■□□□ 1.34
PITX3-202ENST00000539804 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa23.44■■□□□ 1.34
PITX3-202ENST00000539804 RAB17Q9H0T7 212 aa23.44■■□□□ 1.34
PITX3-202ENST00000539804 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
PITX3-202ENST00000539804 SCRG1O75711 98 aa23.43■■□□□ 1.34
PITX3-202ENST00000539804 MATN4O95460 622 aa23.43■■□□□ 1.34
PITX3-202ENST00000539804 C1orf105O95561 183 aa23.43■■□□□ 1.34
PITX3-202ENST00000539804 SFTPCP11686 197 aa23.43■■□□□ 1.34
PITX3-202ENST00000539804 LIFP15018 202 aa23.43■■□□□ 1.34
PITX3-202ENST00000539804 CAV1Q03135 178 aa23.43■■□□□ 1.34
PITX3-202ENST00000539804 KCNAB1Q14722 419 aa23.43■■□□□ 1.34
PITX3-202ENST00000539804 DENND6AQ8IWF6 608 aa23.43■■□□□ 1.34
PITX3-202ENST00000539804 CNTN4Q8IWV2 1026 aa23.43■■□□□ 1.34
PITX3-202ENST00000539804 HMGCLL1Q8TB92 370 aa23.43■■□□□ 1.34
PITX3-202ENST00000539804 CERS2Q96G23 380 aa23.43■■□□□ 1.34
PITX3-202ENST00000539804 OR2A14Q96R47 310 aa23.43■■□□□ 1.34
PITX3-202ENST00000539804 ERP44Q9BS26 406 aa23.43■■□□□ 1.34
PITX3-202ENST00000539804 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
PITX3-202ENST00000539804 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
PITX3-202ENST00000539804 TAS2R13Q9NYV9 303 aa23.43■■□□□ 1.34
PITX3-202ENST00000539804 WHRNQ9P202 907 aa23.43■■□□□ 1.34
PITX3-202ENST00000539804 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa23.43■■□□□ 1.34
PITX3-202ENST00000539804 ZFHX4Q86UP3 3567 aa23.42■■□□□ 1.34
PITX3-202ENST00000539804 RECKO95980 971 aa23.42■■□□□ 1.34
PITX3-202ENST00000539804 MPC1LP0DKB6 136 aa23.42■■□□□ 1.34
PITX3-202ENST00000539804 ST6GAL1P15907 406 aa23.42■■□□□ 1.34
PITX3-202ENST00000539804 RGS4P49798 205 aa23.42■■□□□ 1.34
PITX3-202ENST00000539804 CBLBQ13191 982 aa23.42■■□□□ 1.34
PITX3-202ENST00000539804 ARHGAP19Q14CB8 494 aa23.42■■□□□ 1.34
PITX3-202ENST00000539804 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
PITX3-202ENST00000539804 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa23.42■■□□□ 1.34
PITX3-202ENST00000539804 GALNT6Q8NCL4 622 aa23.42■■□□□ 1.34
PITX3-202ENST00000539804 C17orf62Q9BQA9 187 aa23.42■■□□□ 1.34
PITX3-202ENST00000539804 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
PITX3-202ENST00000539804 TRIM51Q9BSJ1 452 aa23.42■■□□□ 1.34
PITX3-202ENST00000539804 GPR87Q9BY21 358 aa23.42■■□□□ 1.34
PITX3-202ENST00000539804 TWSG1Q9GZX9 223 aa23.42■■□□□ 1.34
PITX3-202ENST00000539804 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa23.42■■□□□ 1.34
PITX3-202ENST00000539804 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa23.42■■□□□ 1.34
PITX3-202ENST00000539804 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
PITX3-202ENST00000539804 DHRS7Q9Y394 339 aa23.42■■□□□ 1.34
PITX3-202ENST00000539804 TMEM150CB9EJG8 249 aa23.41■■□□□ 1.34
PITX3-202ENST00000539804 E7EQ34 232 aa23.41■■□□□ 1.34
PITX3-202ENST00000539804 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
PITX3-202ENST00000539804 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP23.41■■□□□ 1.34
PITX3-202ENST00000539804 CYP2A7P20853 494 aa23.41■■□□□ 1.34
PITX3-202ENST00000539804 ELK3P41970 407 aa23.41■■□□□ 1.34
PITX3-202ENST00000539804 CLCN7P51798 805 aa23.41■■□□□ 1.34
PITX3-202ENST00000539804 ITGA1P56199 1179 aa23.41■■□□□ 1.34
PITX3-202ENST00000539804 GPR19Q15760 415 aa23.41■■□□□ 1.34
PITX3-202ENST00000539804 CNSTQ6PJW8 725 aa23.41■■□□□ 1.34
PITX3-202ENST00000539804 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
PITX3-202ENST00000539804 PALM2Q8IXS6 379 aa23.41■■□□□ 1.34
PITX3-202ENST00000539804 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.2 ms