RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496892.5

POLR1A-210, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 4

Gene POLR1A, Length 546 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-210ENST00000496892 ZNF358Q9NW07 568 aa13.76□□□□□ -0.21
POLR1A-210ENST00000496892 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa13.76□□□□□ -0.21
POLR1A-210ENST00000496892 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP13.76□□□□□ -0.21
POLR1A-210ENST00000496892 XPR1Q9UBH6 696 aa13.76□□□□□ -0.21
POLR1A-210ENST00000496892 KLF15Q9UIH9 416 aa13.76□□□□□ -0.21
POLR1A-210ENST00000496892 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa13.76□□□□□ -0.21
POLR1A-210ENST00000496892 PRSS21Q9Y6M0 314 aa13.76□□□□□ -0.21
POLR1A-210ENST00000496892 BSNQ9UPA5 3926 aa13.76□□□□□ -0.21
POLR1A-210ENST00000496892 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa13.75□□□□□ -0.21
POLR1A-210ENST00000496892 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP13.75□□□□□ -0.21
POLR1A-210ENST00000496892 POM121BA6NF01 834 aa13.75□□□□□ -0.21
POLR1A-210ENST00000496892 IQCF5A8MTL0 148 aa13.75□□□□□ -0.21
POLR1A-210ENST00000496892 GPR89AB7ZAQ6 455 aa13.75□□□□□ -0.21
POLR1A-210ENST00000496892 G3V2L1 256 aa13.75□□□□□ -0.21
POLR1A-210ENST00000496892 NDUFAB1O14561 156 aa13.75□□□□□ -0.21
POLR1A-210ENST00000496892 TERTO14746 1132 aaKnown RBP13.75□□□□□ -0.21
POLR1A-210ENST00000496892 CASC3O15234 703 aaKnown RBP13.75□□□□□ -0.21
POLR1A-210ENST00000496892 INPP4BO15327 924 aa13.75□□□□□ -0.21
POLR1A-210ENST00000496892 EFSO43281 561 aa13.75□□□□□ -0.21
POLR1A-210ENST00000496892 CDK14O94921 469 aa13.75□□□□□ -0.21
POLR1A-210ENST00000496892 CSF2P04141 144 aa13.75□□□□□ -0.21
POLR1A-210ENST00000496892 SERPINE1P05121 402 aa13.75□□□□□ -0.21
POLR1A-210ENST00000496892 GPR89BP0CG08 455 aa13.75□□□□□ -0.21
POLR1A-210ENST00000496892 NME1P15531 152 aaKnown RBP13.75□□□□□ -0.21
POLR1A-210ENST00000496892 CA5AP35218 305 aa13.75□□□□□ -0.21
POLR1A-210ENST00000496892 SEC24CP53992 1094 aa13.75□□□□□ -0.21
POLR1A-210ENST00000496892 NAA20P61599 178 aa13.75□□□□□ -0.21
POLR1A-210ENST00000496892 B4GALNT1Q00973 533 aa13.75□□□□□ -0.21
POLR1A-210ENST00000496892 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP13.75□□□□□ -0.21
POLR1A-210ENST00000496892 PCLAFQ15004 111 aa13.75□□□□□ -0.21
POLR1A-210ENST00000496892 WSCD2Q2TBF2 565 aa13.75□□□□□ -0.21
POLR1A-210ENST00000496892 DEFB133Q30KQ1 61 aa13.75□□□□□ -0.21
POLR1A-210ENST00000496892 LINC00303Q3SY05 128 aa13.75□□□□□ -0.21
POLR1A-210ENST00000496892 TMEM259Q4ZIN3 620 aa13.75□□□□□ -0.21
POLR1A-210ENST00000496892 PERM1Q5SV97 790 aa13.75□□□□□ -0.21
POLR1A-210ENST00000496892 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa13.75□□□□□ -0.21
POLR1A-210ENST00000496892 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa13.75□□□□□ -0.21
POLR1A-210ENST00000496892 LIPMQ5VYY2 423 aa13.75□□□□□ -0.21
POLR1A-210ENST00000496892 LURAP1LQ8IV03 231 aa13.75□□□□□ -0.21
POLR1A-210ENST00000496892 C10orf107Q8IVU9 208 aa13.75□□□□□ -0.21
POLR1A-210ENST00000496892 MYO1HQ8N1T3 1032 aa13.75□□□□□ -0.21
POLR1A-210ENST00000496892 SPATA6LQ8N4H0 392 aa13.75□□□□□ -0.21
POLR1A-210ENST00000496892 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP13.75□□□□□ -0.21
POLR1A-210ENST00000496892 FAM174AQ8TBP5 190 aa13.75□□□□□ -0.21
POLR1A-210ENST00000496892 ASZ1Q8WWH4 475 aa13.75□□□□□ -0.21
POLR1A-210ENST00000496892 FAM136AQ96C01 138 aa13.75□□□□□ -0.21
POLR1A-210ENST00000496892 LINGO1Q96FE5 620 aa13.75□□□□□ -0.21
POLR1A-210ENST00000496892 CCM2Q9BSQ5 444 aa13.75□□□□□ -0.21
POLR1A-210ENST00000496892 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP13.75□□□□□ -0.21
POLR1A-210ENST00000496892 THAP1Q9NVV9 213 aa13.75□□□□□ -0.21
POLR1A-210ENST00000496892 WDR70Q9NW82 654 aa13.75□□□□□ -0.21
POLR1A-210ENST00000496892 OXSMQ9NWU1 459 aa13.75□□□□□ -0.21
POLR1A-210ENST00000496892 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP13.75□□□□□ -0.21
POLR1A-210ENST00000496892 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP13.75□□□□□ -0.21
POLR1A-210ENST00000496892 GPR34Q9UPC5 381 aa13.75□□□□□ -0.21
POLR1A-210ENST00000496892 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa13.75□□□□□ -0.21
POLR1A-210ENST00000496892 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa13.74□□□□□ -0.21
POLR1A-210ENST00000496892 KLHL33A6NCF5 533 aa13.74□□□□□ -0.21
POLR1A-210ENST00000496892 TMEM114B3SHH9 223 aa13.74□□□□□ -0.21
POLR1A-210ENST00000496892 TARM1B6A8C7 271 aa13.74□□□□□ -0.21
POLR1A-210ENST00000496892 H3BM21 787 aa13.74□□□□□ -0.21
POLR1A-210ENST00000496892 RAD51BO15315 384 aa13.74□□□□□ -0.21
POLR1A-210ENST00000496892 AQP9O43315 295 aa13.74□□□□□ -0.21
POLR1A-210ENST00000496892 KERAO60938 352 aa13.74□□□□□ -0.21
POLR1A-210ENST00000496892 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP13.74□□□□□ -0.21
POLR1A-210ENST00000496892 BGNP21810 368 aa13.74□□□□□ -0.21
POLR1A-210ENST00000496892 AOAHP28039 575 aa13.74□□□□□ -0.21
POLR1A-210ENST00000496892 SERPINB5P36952 375 aa13.74□□□□□ -0.21
POLR1A-210ENST00000496892 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP13.74□□□□□ -0.21
POLR1A-210ENST00000496892 MAPK9P45984 424 aa13.74□□□□□ -0.21
POLR1A-210ENST00000496892 PDX1P52945 283 aa13.74□□□□□ -0.21
POLR1A-210ENST00000496892 PGGT1BP53609 377 aa13.74□□□□□ -0.21
POLR1A-210ENST00000496892 DNAJB13P59910 316 aa13.74□□□□□ -0.21
POLR1A-210ENST00000496892 NFKB2Q00653 900 aa13.74□□□□□ -0.21
POLR1A-210ENST00000496892 FGL2Q14314 439 aa13.74□□□□□ -0.21
POLR1A-210ENST00000496892 NR0B2Q15466 257 aa13.74□□□□□ -0.21
POLR1A-210ENST00000496892 BCL7AQ4VC05 210 aa13.74□□□□□ -0.21
POLR1A-210ENST00000496892 COLEC12Q5KU26 742 aa13.74□□□□□ -0.21
POLR1A-210ENST00000496892 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP13.74□□□□□ -0.21
POLR1A-210ENST00000496892 DET1Q7L5Y6 550 aa13.74□□□□□ -0.21
POLR1A-210ENST00000496892 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa13.74□□□□□ -0.21
POLR1A-210ENST00000496892 PARGQ86W56 976 aa13.74□□□□□ -0.21
POLR1A-210ENST00000496892 CPNE9Q8IYJ1 553 aa13.74□□□□□ -0.21
POLR1A-210ENST00000496892 LRRC34Q8IZ02 419 aa13.74□□□□□ -0.21
POLR1A-210ENST00000496892 TMEM151AQ8N4L1 468 aa13.74□□□□□ -0.21
POLR1A-210ENST00000496892 DENND6BQ8NEG7 585 aa13.74□□□□□ -0.21
POLR1A-210ENST00000496892 LMX1AQ8TE12 382 aa13.74□□□□□ -0.21
POLR1A-210ENST00000496892 PPP4R1Q8TF05 950 aa13.74□□□□□ -0.21
POLR1A-210ENST00000496892 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa13.74□□□□□ -0.21
POLR1A-210ENST00000496892 SGF29Q96ES7 293 aa13.74□□□□□ -0.21
POLR1A-210ENST00000496892 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP13.74□□□□□ -0.21
POLR1A-210ENST00000496892 MECRQ9BV79 373 aa13.74□□□□□ -0.21
POLR1A-210ENST00000496892 ALG9Q9H6U8 611 aa13.74□□□□□ -0.21
POLR1A-210ENST00000496892 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP13.74□□□□□ -0.21
POLR1A-210ENST00000496892 RNF112Q9ULX5 631 aa13.74□□□□□ -0.21
POLR1A-210ENST00000496892 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP13.74□□□□□ -0.21
POLR1A-210ENST00000496892 COL12A1Q99715 3063 aa13.73□□□□□ -0.21
POLR1A-210ENST00000496892 CCDC187A0A096LP49 1063 aa13.73□□□□□ -0.21
POLR1A-210ENST00000496892 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
POLR1A-210ENST00000496892 BTN3A1O00481 513 aa13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.5 ms