RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471880.5

SSR4-208, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, human

TSL 5

Gene SSR4, Length 785 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSR4-208	ENST00000471880	D2HGDH	Q8N465	521 aa		14.33	□□□□□ -0.12
SSR4-208	ENST00000471880	ZBTB2	Q8N680	514 aa		14.33	□□□□□ -0.12
SSR4-208	ENST00000471880	CALML6	Q8TD86	181 aa		14.33	□□□□□ -0.12
SSR4-208	ENST00000471880	CLIP3	Q96DZ5	547 aa		14.33	□□□□□ -0.12
SSR4-208	ENST00000471880	SIGLEC10	Q96LC7	697 aa		14.33	□□□□□ -0.12
SSR4-208	ENST00000471880	EFHD1	Q9BUP0	239 aa		14.33	□□□□□ -0.12
SSR4-208	ENST00000471880	INTS10	Q9NVR2	710 aa	Known RBP	14.33	□□□□□ -0.12
SSR4-208	ENST00000471880	SPHK1	Q9NYA1	384 aa		14.33	□□□□□ -0.12
SSR4-208	ENST00000471880	CROT	Q9UKG9	612 aa		14.33	□□□□□ -0.12
SSR4-208	ENST00000471880	CDYL	Q9Y232	598 aa		14.33	□□□□□ -0.12
SSR4-208	ENST00000471880	MRPS18B	Q9Y676	258 aa	Known RBP	14.33	□□□□□ -0.12
SSR4-208	ENST00000471880	NFS1	Q9Y697	457 aa		14.33	□□□□□ -0.12
SSR4-208	ENST00000471880	FER1L5	A0AVI2	2057 aa		14.32	□□□□□ -0.12
SSR4-208	ENST00000471880	CPNE3	O75131	537 aa	Known RBP	14.32	□□□□□ -0.12
SSR4-208	ENST00000471880	STAT5A	P42229	794 aa		14.32	□□□□□ -0.12
SSR4-208	ENST00000471880	RAB28	P51157	221 aa		14.32	□□□□□ -0.12
SSR4-208	ENST00000471880	MRPS25	P82663	173 aa	Known RBP	14.32	□□□□□ -0.12
SSR4-208	ENST00000471880	MPP1	Q00013	466 aa		14.32	□□□□□ -0.12
SSR4-208	ENST00000471880	COL9A2	Q14055	689 aa	Predicted RBP	14.32	□□□□□ -0.12
SSR4-208	ENST00000471880	PLEKHS1	Q5SXH7	462 aa		14.32	□□□□□ -0.12
SSR4-208	ENST00000471880	ARMC3	Q5W041	872 aa		14.32	□□□□□ -0.12
SSR4-208	ENST00000471880	SYT10	Q6XYQ8	523 aa		14.32	□□□□□ -0.12
SSR4-208	ENST00000471880	SYDE1	Q6ZW31	735 aa	Predicted RBP	14.32	□□□□□ -0.12
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM135	Q86UB9	458 aa		14.32	□□□□□ -0.12
SSR4-208	ENST00000471880	BPHL	Q86WA6	291 aa	Predicted RBP	14.32	□□□□□ -0.12
SSR4-208	ENST00000471880	FAM20C	Q8IXL6	584 aa		14.32	□□□□□ -0.12
SSR4-208	ENST00000471880	PDIK1L	Q8N165	341 aa		14.32	□□□□□ -0.12
SSR4-208	ENST00000471880	CARF	Q8N187	725 aa		14.32	□□□□□ -0.12
SSR4-208	ENST00000471880	AGGF1	Q8N302	714 aa	eCLIP	14.32	□□□□□ -0.12
SSR4-208	ENST00000471880	GABPB2	Q8TAK5	448 aa	Predicted RBP	14.32	□□□□□ -0.12
SSR4-208	ENST00000471880	SNRNP27	Q8WVK2	155 aa	Known RBP	14.32	□□□□□ -0.12
SSR4-208	ENST00000471880	STARD8	Q92502	1023 aa		14.32	□□□□□ -0.12
SSR4-208	ENST00000471880	MR1	Q95460	341 aa		14.32	□□□□□ -0.12
SSR4-208	ENST00000471880	SNF8	Q96H20	258 aa		14.32	□□□□□ -0.12
SSR4-208	ENST00000471880	PWWP2A	Q96N64	755 aa		14.32	□□□□□ -0.12
SSR4-208	ENST00000471880	BIRC8	Q96P09	236 aa		14.32	□□□□□ -0.12
SSR4-208	ENST00000471880	TRAPPC9	Q96Q05	1148 aa		14.32	□□□□□ -0.12
SSR4-208	ENST00000471880	FAM167B	Q9BTA0	163 aa		14.32	□□□□□ -0.12
SSR4-208	ENST00000471880	OR6C2	Q9NZP2	312 aa		14.32	□□□□□ -0.12
SSR4-208	ENST00000471880	SEMA5B	Q9P283	1151 aa		14.32	□□□□□ -0.12
SSR4-208	ENST00000471880	IL17B	Q9UHF5	180 aa		14.32	□□□□□ -0.12
SSR4-208	ENST00000471880	PADI1	Q9ULC6	663 aa		14.32	□□□□□ -0.12
SSR4-208	ENST00000471880	CHMP2B	Q9UQN3	213 aa		14.32	□□□□□ -0.12
SSR4-208	ENST00000471880	BTRC	Q9Y297	605 aa		14.32	□□□□□ -0.12
SSR4-208	ENST00000471880	PCDHB3	Q9Y5E6	796 aa		14.32	□□□□□ -0.12
SSR4-208	ENST00000471880	TLN1	Q9Y490	2541 aa	Known RBP	14.31	□□□□□ -0.12
SSR4-208	ENST00000471880		A0A0J9YY10	115 aa		14.31	□□□□□ -0.12
SSR4-208	ENST00000471880	ZCWPW2	A0A1B0GU75	182 aa		14.31	□□□□□ -0.12
SSR4-208	ENST00000471880	KRT87P	A6NCN2	255 aa		14.31	□□□□□ -0.12
SSR4-208	ENST00000471880	EFCAB8	A8MWE9	144 aa		14.31	□□□□□ -0.12
SSR4-208	ENST00000471880	NKX2-8	O15522	239 aa		14.31	□□□□□ -0.12
SSR4-208	ENST00000471880	C1QL1	O75973	258 aa		14.31	□□□□□ -0.12
SSR4-208	ENST00000471880	SLCO2B1	O94956	709 aa		14.31	□□□□□ -0.12
SSR4-208	ENST00000471880	ERVK-10	P10266	1014 aa		14.31	□□□□□ -0.12
SSR4-208	ENST00000471880	TCN2	P20062	427 aa		14.31	□□□□□ -0.12
SSR4-208	ENST00000471880	PKLR	P30613	574 aa		14.31	□□□□□ -0.12
SSR4-208	ENST00000471880	MAGEA3	P43357	314 aa		14.31	□□□□□ -0.12
SSR4-208	ENST00000471880	ITGA8	P53708	1063 aa		14.31	□□□□□ -0.12
SSR4-208	ENST00000471880	CUL1	Q13616	776 aa		14.31	□□□□□ -0.12
SSR4-208	ENST00000471880	CRYM	Q14894	314 aa		14.31	□□□□□ -0.12
SSR4-208	ENST00000471880	MORF4L2	Q15014	288 aa		14.31	□□□□□ -0.12
SSR4-208	ENST00000471880	SF1	Q15637	639 aa	Known RBP	14.31	□□□□□ -0.12
SSR4-208	ENST00000471880	TTLL9	Q3SXZ7	439 aa		14.31	□□□□□ -0.12
SSR4-208	ENST00000471880	PRAMEF17	Q5VTA0	474 aa		14.31	□□□□□ -0.12
SSR4-208	ENST00000471880	FAM199X	Q6PEV8	388 aa	Predicted RBP	14.31	□□□□□ -0.12
SSR4-208	ENST00000471880	GPR135	Q8IZ08	494 aa		14.31	□□□□□ -0.12
SSR4-208	ENST00000471880	C19orf47	Q8N9M1	422 aa	Known RBP	14.31	□□□□□ -0.12
SSR4-208	ENST00000471880	MAGEC3	Q8TD91	643 aa		14.31	□□□□□ -0.12
SSR4-208	ENST00000471880	TTC9	Q92623	222 aa		14.31	□□□□□ -0.12
SSR4-208	ENST00000471880	SLCO2A1	Q92959	643 aa		14.31	□□□□□ -0.12
SSR4-208	ENST00000471880	RAD51AP1	Q96B01	352 aa		14.31	□□□□□ -0.12
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF501	Q96CX3	271 aa	Predicted RBP	14.31	□□□□□ -0.12
SSR4-208	ENST00000471880	OR2A14	Q96R47	310 aa		14.31	□□□□□ -0.12
SSR4-208	ENST00000471880	SPRY4	Q9C004	299 aa		14.31	□□□□□ -0.12
SSR4-208	ENST00000471880	LATS2	Q9NRM7	1088 aa		14.31	□□□□□ -0.12
SSR4-208	ENST00000471880	ABCF3	Q9NUQ8	709 aa		14.31	□□□□□ -0.12
SSR4-208	ENST00000471880	GALP	Q9UBC7	116 aa		14.31	□□□□□ -0.12
SSR4-208	ENST00000471880	RNF14	Q9UBS8	474 aa		14.31	□□□□□ -0.12
SSR4-208	ENST00000471880	SERTAD3	Q9UJW9	196 aa		14.31	□□□□□ -0.12
SSR4-208	ENST00000471880	FBXO5	Q9UKT4	447 aa		14.31	□□□□□ -0.12
SSR4-208	ENST00000471880	KLHL20	Q9Y2M5	609 aa		14.31	□□□□□ -0.12
SSR4-208	ENST00000471880	MRFAP1	Q9Y605	127 aa		14.31	□□□□□ -0.12
SSR4-208	ENST00000471880	SEC16A	O15027	2179 aa		14.31	□□□□□ -0.12
SSR4-208	ENST00000471880		E7EQ34	232 aa		14.3	□□□□□ -0.12
SSR4-208	ENST00000471880	RASGRF2	O14827	1237 aa		14.3	□□□□□ -0.12
SSR4-208	ENST00000471880	SYF2	O95926	243 aa	Known RBP	14.3	□□□□□ -0.12
SSR4-208	ENST00000471880	S1PR4	O95977	384 aa		14.3	□□□□□ -0.12
SSR4-208	ENST00000471880	KLK3	P07288	261 aa	Predicted RBP	14.3	□□□□□ -0.12
SSR4-208	ENST00000471880	TPBGL	P0DKB5	382 aa		14.3	□□□□□ -0.12
SSR4-208	ENST00000471880	CD9	P21926	228 aa		14.3	□□□□□ -0.12
SSR4-208	ENST00000471880	CARS	P49589	748 aa	Known RBP	14.3	□□□□□ -0.12
SSR4-208	ENST00000471880	ARL4C	P56559	192 aa		14.3	□□□□□ -0.12
SSR4-208	ENST00000471880	C2orf54	Q08AI8	447 aa		14.3	□□□□□ -0.12
SSR4-208	ENST00000471880	DNASE1L3	Q13609	305 aa		14.3	□□□□□ -0.12
SSR4-208	ENST00000471880	MAP7	Q14244	749 aa		14.3	□□□□□ -0.12
SSR4-208	ENST00000471880	ERV3-1	Q14264	604 aa		14.3	□□□□□ -0.12
SSR4-208	ENST00000471880	KIR2DS3	Q14952	304 aa		14.3	□□□□□ -0.12
SSR4-208	ENST00000471880	TBR1	Q16650	682 aa		14.3	□□□□□ -0.12
SSR4-208	ENST00000471880	HIF1A	Q16665	826 aa		14.3	□□□□□ -0.12
SSR4-208	ENST00000471880	KYNU	Q16719	465 aa		14.3	□□□□□ -0.12

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