RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469307.4

PGAP2-215, Transcript of post-GPI attachment to proteins 2, human

TSL 3

Gene PGAP2, Length 798 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PGAP2-215	ENST00000469307	SNX1	Q13596	522 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	IL10RA	Q13651	578 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	KCNJ11	Q14654	390 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	CYP1B1	Q16678	543 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	LCN10	Q6JVE6	187 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	PRUNE1	Q86TP1	453 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	VRK3	Q8IV63	474 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	DCUN1D3	Q8IWE4	304 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	SYTL1	Q8IYJ3	562 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	DNAJC22	Q8N4W6	341 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	TAB3	Q8N5C8	712 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	LINC01555	Q8NAE3	123 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	OR6P1	Q8NGX9	317 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	PROKR1	Q8TCW9	393 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	MR1	Q95460	341 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	SLC22A18	Q96BI1	424 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	ZNF285	Q96NJ3	590 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	C17orf62	Q9BQA9	187 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	EPN3	Q9H201	632 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	XKR8	Q9H6D3	395 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	ACTR5	Q9H9F9	607 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	FAM60A	Q9NP50	221 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	SPHK1	Q9NYA1	384 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	TCFL5	Q9UL49	500 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	SOX13	Q9UN79	622 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	MAN2B2	Q9Y2E5	1009 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	NEU2	Q9Y3R4	380 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	SPTAN1	Q13813	2472 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	NAV2	Q8IVL1	2488 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	CCDC78	A2IDD5	438 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	CDC14C	A4D256	554 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	KPNA5	O15131	536 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	KLF7	O75840	302 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	S1PR4	O95977	384 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	APOA4	P06727	396 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	CD63	P08962	238 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	MLN	P12872	115 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	PVR	P15151	417 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	CYP2A7	P20853	494 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	NCF4	Q15080	339 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	SYTL3	Q4VX76	610 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	PRAMEF17	Q5VTA0	474 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	KIAA0930	Q6ICG6	404 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	TMEM135	Q86UB9	458 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	HPS6	Q86YV9	775 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	OR2L8	Q8NGY9	312 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	LKAAEAR1	Q8TD35	194 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	LPGAT1	Q92604	370 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	NACC2	Q96BF6	587 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	BIRC8	Q96P09	236 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	IP6K3	Q96PC2	410 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	GBP5	Q96PP8	586 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	PANX3	Q96QZ0	392 aa		11.91	□□□□□ -0.5
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PGAP2-215	ENST00000469307	KLHL42	Q9P2K6	505 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	TLK1	Q9UKI8	766 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	SRPK3	Q9UPE1	567 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	TP53TG5	Q9Y2B4	290 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	PPP2R2C	Q9Y2T4	447 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	MRFAP1	Q9Y605	127 aa		11.91	□□□□□ -0.5
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PGAP2-215	ENST00000469307		H3BMM5	538 aa		11.9	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	RASGRF2	O14827	1237 aa		11.9	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	ZNF749	O43361	778 aa		11.9	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	HCRTR1	O43613	425 aa		11.9	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	ERG	P11308	486 aa		11.9	□□□□□ -0.5
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PGAP2-215	ENST00000469307	MAGEA3	P43357	314 aa		11.9	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	RPS18	P62269	152 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	RNF187	Q5TA31	235 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	YOD1	Q5VVQ6	348 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5
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PGAP2-215	ENST00000469307	GPR135	Q8IZ08	494 aa		11.9	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	ENDOV	Q8N8Q3	282 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	TMEM102	Q8N9M5	508 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5
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PGAP2-215	ENST00000469307	MCU	Q8NE86	351 aa		11.9	□□□□□ -0.5
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PGAP2-215	ENST00000469307	ANAPC5	Q9UJX4	755 aa		11.9	□□□□□ -0.5
PGAP2-215	ENST00000469307	JRKL	Q9Y4A0	524 aa		11.9	□□□□□ -0.5
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PGAP2-215	ENST00000469307	MAGEB16	A2A368	324 aa		11.89	□□□□□ -0.51
PGAP2-215	ENST00000469307	FITM1	A5D6W6	292 aa		11.89	□□□□□ -0.51
PGAP2-215	ENST00000469307	TARM1	B6A8C7	271 aa		11.89	□□□□□ -0.51
PGAP2-215	ENST00000469307		K7EM74	188 aa		11.89	□□□□□ -0.51
PGAP2-215	ENST00000469307	ZSCAN9	O15535	394 aa	Predicted RBP	11.89	□□□□□ -0.51
PGAP2-215	ENST00000469307	MATN4	O95460	622 aa		11.89	□□□□□ -0.51
PGAP2-215	ENST00000469307	C1orf105	O95561	183 aa		11.89	□□□□□ -0.51
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PGAP2-215	ENST00000469307	NMBR	P28336	390 aa		11.89	□□□□□ -0.51
PGAP2-215	ENST00000469307	CCNF	P41002	786 aa		11.89	□□□□□ -0.51
PGAP2-215	ENST00000469307	KCNJ1	P48048	391 aa		11.89	□□□□□ -0.51
PGAP2-215	ENST00000469307	SOX8	P57073	446 aa		11.89	□□□□□ -0.51
PGAP2-215	ENST00000469307	SESN2	P58004	480 aa	Predicted RBP	11.89	□□□□□ -0.51
PGAP2-215	ENST00000469307	BASP1	P80723	227 aa	Known RBP	11.89	□□□□□ -0.51
PGAP2-215	ENST00000469307	HSPA14	Q0VDF9	509 aa		11.89	□□□□□ -0.51
PGAP2-215	ENST00000469307	TMED2	Q15363	201 aa		11.89	□□□□□ -0.51

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