RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467435.1

HDLBP-231, Transcript of high density lipoprotein binding protein, human

TSL 2

Gene HDLBP, Length 639 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDLBP-231	ENST00000467435	DGKE	P52429	567 aa		11.97	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	PFN3	P60673	137 aa		11.97	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	PRKCQ	Q04759	706 aa		11.97	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	CYLC2	Q14093	348 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	PTK2B	Q14289	1009 aa		11.97	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	TMEM31	Q5JXX7	168 aa		11.97	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	FBXW10	Q5XX13	1052 aa		11.97	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	CYB5D1	Q6P9G0	228 aa		11.97	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	AGTRAP	Q6RW13	159 aa		11.97	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	GK5	Q6ZS86	529 aa		11.97	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	RNF165	Q6ZSG1	346 aa		11.97	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	SPATA19	Q7Z5L4	167 aa		11.97	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	THOC6	Q86W42	341 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	HOMEZ	Q8IX15	550 aa		11.97	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	ARHGAP24	Q8N264	748 aa		11.97	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	PGBD3	Q8N328	593 aa		11.97	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	HMGCLL1	Q8TB92	370 aa		11.97	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	MED8	Q96G25	268 aa		11.97	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	TIMM29	Q9BSF4	260 aa		11.97	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	RTKN	Q9BST9	563 aa		11.97	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	ZDHHC5	Q9C0B5	715 aa		11.97	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	C1orf21	Q9H246	121 aa		11.97	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	SGK2	Q9HBY8	427 aa		11.97	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	TM7SF3	Q9NS93	570 aa		11.97	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	USP36	Q9P275	1121 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	SLC23A2	Q9UGH3	650 aa		11.97	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	ZNHIT2	Q9UHR6	403 aa		11.97	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	SLC22A14	Q9Y267	594 aa		11.97	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	SLC17A4	Q9Y2C5	497 aa		11.97	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	KCNE1B	A0A087WTH5	132 aa		11.96	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435		A8MUI8	341 aa		11.96	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	PSMD12	O00232	456 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	MANBA	O00462	879 aa		11.96	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	FPGT	O14772	594 aa		11.96	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	PEX11A	O75192	247 aa		11.96	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	SEMA4F	O95754	770 aa		11.96	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	SLC16A8	O95907	504 aa		11.96	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	CEACAM5	P06731	702 aa		11.96	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	SLC35G4	P0C7Q5	338 aa		11.96	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	CD1E	P15812	388 aa		11.96	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	HNRNPA2B1	P22626	353 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	CPOX	P36551	454 aa		11.96	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	NUDT2	P50583	147 aa		11.96	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	KIAA1024L	P59773	190 aa		11.96	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	IRX1	P78414	480 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	SLC25A3	Q00325	362 aa		11.96	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	TFF2	Q03403	129 aa		11.96	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	DMPK	Q09013	629 aa		11.96	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	NAE1	Q13564	534 aa		11.96	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	ABRAXAS2	Q15018	415 aa		11.96	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	NR6A1	Q15406	480 aa		11.96	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	ZRSR2	Q15696	482 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	GSTA3	Q16772	222 aa		11.96	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	ATP6AP1L	Q52LC2	224 aa		11.96	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	AGK	Q53H12	422 aa		11.96	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	GALNT13	Q8IUC8	556 aa		11.96	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	PPFIBP2	Q8ND30	876 aa		11.96	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	OR9A1P	Q8NGU1	263 aa		11.96	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	OR56A3	Q8NH54	315 aa		11.96	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	MAGEC3	Q8TD91	643 aa		11.96	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	RCN3	Q96D15	328 aa		11.96	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	MAGEB10	Q96LZ2	347 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	HBEGF	Q99075	208 aa		11.96	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	AIG1	Q9NVV5	245 aa		11.96	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	MOSPD1	Q9UJG1	213 aa		11.96	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	ASF1A	Q9Y294	204 aa		11.96	□□□□□ -0.49
HDLBP-231	ENST00000467435	F5	P12259	2224 aa		11.95	□□□□□ -0.5
HDLBP-231	ENST00000467435	CHURC1-FNTB	B4DL54	471 aa		11.95	□□□□□ -0.5
HDLBP-231	ENST00000467435	SLC28A1	O00337	649 aa		11.95	□□□□□ -0.5
HDLBP-231	ENST00000467435	IFRD1	O00458	451 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
HDLBP-231	ENST00000467435	RGS14	O43566	566 aa		11.95	□□□□□ -0.5
HDLBP-231	ENST00000467435	IGLV3-19	P01714	112 aa		11.95	□□□□□ -0.5
HDLBP-231	ENST00000467435	KRT6A	P02538	564 aa		11.95	□□□□□ -0.5
HDLBP-231	ENST00000467435	KRT6B	P04259	564 aa		11.95	□□□□□ -0.5
HDLBP-231	ENST00000467435	RPN2	P04844	631 aa		11.95	□□□□□ -0.5
HDLBP-231	ENST00000467435	IDO1	P14902	403 aa		11.95	□□□□□ -0.5
HDLBP-231	ENST00000467435	ITGAX	P20702	1163 aa		11.95	□□□□□ -0.5
HDLBP-231	ENST00000467435	GPX3	P22352	226 aa		11.95	□□□□□ -0.5
HDLBP-231	ENST00000467435	PGM1	P36871	562 aa		11.95	□□□□□ -0.5
HDLBP-231	ENST00000467435	HAL	P42357	657 aa		11.95	□□□□□ -0.5
HDLBP-231	ENST00000467435	GNPDA1	P46926	289 aa		11.95	□□□□□ -0.5
HDLBP-231	ENST00000467435	KRT6C	P48668	564 aa		11.95	□□□□□ -0.5
HDLBP-231	ENST00000467435	CLDN2	P57739	230 aa		11.95	□□□□□ -0.5
HDLBP-231	ENST00000467435	TBPL1	P62380	186 aa		11.95	□□□□□ -0.5
HDLBP-231	ENST00000467435	ERVK-8	P63133	956 aa		11.95	□□□□□ -0.5
HDLBP-231	ENST00000467435	CHIT1	Q13231	466 aa		11.95	□□□□□ -0.5
HDLBP-231	ENST00000467435	NFATC4	Q14934	902 aa		11.95	□□□□□ -0.5
HDLBP-231	ENST00000467435	UBXN2B	Q14CS0	331 aa		11.95	□□□□□ -0.5
HDLBP-231	ENST00000467435	CPSF6	Q16630	551 aa	Known RBP eCLIP	11.95	□□□□□ -0.5
HDLBP-231	ENST00000467435	METRNL	Q641Q3	311 aa		11.95	□□□□□ -0.5
HDLBP-231	ENST00000467435	ANO7	Q6IWH7	933 aa		11.95	□□□□□ -0.5
HDLBP-231	ENST00000467435	SYT13	Q7L8C5	426 aa		11.95	□□□□□ -0.5
HDLBP-231	ENST00000467435	CHST15	Q7LFX5	561 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
HDLBP-231	ENST00000467435	DCUN1D3	Q8IWE4	304 aa		11.95	□□□□□ -0.5
HDLBP-231	ENST00000467435	SYTL1	Q8IYJ3	562 aa		11.95	□□□□□ -0.5
HDLBP-231	ENST00000467435	ZNF687	Q8N1G0	1237 aa		11.95	□□□□□ -0.5
HDLBP-231	ENST00000467435	MIER2	Q8N344	545 aa		11.95	□□□□□ -0.5
HDLBP-231	ENST00000467435	SYNPO	Q8N3V7	929 aa		11.95	□□□□□ -0.5
HDLBP-231	ENST00000467435	SFRP1	Q8N474	314 aa		11.95	□□□□□ -0.5
HDLBP-231	ENST00000467435	DEFB123	Q8N688	67 aa		11.95	□□□□□ -0.5

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