RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460289.5

PTPN4-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 4, humanhuman

TSL 4

Gene PTPN4, Length 577 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN4-208ENST00000460289 SLC39A10Q9ULF5 831 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPN4-208ENST00000460289 FAM169AQ9Y6X4 670 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPN4-208ENST00000460289 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
PTPN4-208ENST00000460289 TMEM150CB9EJG8 249 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPN4-208ENST00000460289 E5RI56 91 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPN4-208ENST00000460289 S1PR4O95977 384 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPN4-208ENST00000460289 SFTPCP11686 197 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPN4-208ENST00000460289 PVRP15151 417 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPN4-208ENST00000460289 TCN2P20062 427 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPN4-208ENST00000460289 CD9P21926 228 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPN4-208ENST00000460289 PKLRP30613 574 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPN4-208ENST00000460289 CCNFP41002 786 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPN4-208ENST00000460289 BORAQ6PGQ7 559 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPN4-208ENST00000460289 KLHL7Q8IXQ5 586 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPN4-208ENST00000460289 RAB42Q8N4Z0 105 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPN4-208ENST00000460289 MAGEC3Q8TD91 643 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPN4-208ENST00000460289 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPN4-208ENST00000460289 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPN4-208ENST00000460289 KLHL25Q9H0H3 589 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPN4-208ENST00000460289 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
PTPN4-208ENST00000460289 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPN4-208ENST00000460289 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPN4-208ENST00000460289 A0A0J9YY10 115 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPN4-208ENST00000460289 C21orf140B9A014 251 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPN4-208ENST00000460289 CCDC188H7C350 402 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPN4-208ENST00000460289 NIPSNAP2O75323 286 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPN4-208ENST00000460289 KATNA1O75449 491 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPN4-208ENST00000460289 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
PTPN4-208ENST00000460289 PGAM1P18669 254 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPN4-208ENST00000460289 F8A1P23610 371 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPN4-208ENST00000460289 ATP5DP30049 168 aa22.21■■□□□ 1.15
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PTPN4-208ENST00000460289 GRB7Q14451 532 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPN4-208ENST00000460289 SLC5A12Q1EHB4 618 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPN4-208ENST00000460289 IZUMO3Q5VZ72 239 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPN4-208ENST00000460289 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPN4-208ENST00000460289 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP22.21■■□□□ 1.15
PTPN4-208ENST00000460289 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
PTPN4-208ENST00000460289 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP22.21■■□□□ 1.15
PTPN4-208ENST00000460289 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPN4-208ENST00000460289 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
PTPN4-208ENST00000460289 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
PTPN4-208ENST00000460289 LRFN5Q96NI6 719 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPN4-208ENST00000460289 NAT9Q9BTE0 207 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPN4-208ENST00000460289 CCDC68Q9H2F9 335 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPN4-208ENST00000460289 SMAPO00193 183 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPN4-208ENST00000460289 TERTO14746 1132 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
PTPN4-208ENST00000460289 RASGRF2O14827 1237 aa22.2■■□□□ 1.14
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PTPN4-208ENST00000460289 C1QL1O75973 258 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPN4-208ENST00000460289 C1orf105O95561 183 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPN4-208ENST00000460289 TTC4O95801 387 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPN4-208ENST00000460289 CDC20Q12834 499 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPN4-208ENST00000460289 CTBP1Q13363 440 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPN4-208ENST00000460289 DNASE1L3Q13609 305 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPN4-208ENST00000460289 ZNF789Q5FWF6 425 aa22.2■■□□□ 1.14
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PTPN4-208ENST00000460289 GPR135Q8IZ08 494 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPN4-208ENST00000460289 ZNF843Q8N446 348 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPN4-208ENST00000460289 ZBTB2Q8N680 514 aa22.2■■□□□ 1.14
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PTPN4-208ENST00000460289 OR2L8Q8NGY9 312 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPN4-208ENST00000460289 OR1L3Q8NH93 324 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPN4-208ENST00000460289 FAM167BQ9BTA0 163 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPN4-208ENST00000460289 MENTQ9BUN1 341 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPN4-208ENST00000460289 GPR87Q9BY21 358 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPN4-208ENST00000460289 COMMD10Q9Y6G5 202 aa22.2■■□□□ 1.14
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PTPN4-208ENST00000460289 RECKO95980 971 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPN4-208ENST00000460289 PRKAR1AP10644 381 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPN4-208ENST00000460289 CYP2A7P20853 494 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPN4-208ENST00000460289 IVDP26440 423 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPN4-208ENST00000460289 ITGA1P56199 1179 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPN4-208ENST00000460289 GBX1Q14549 363 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPN4-208ENST00000460289 MORF4L2Q15014 288 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPN4-208ENST00000460289 C16orf46Q6P387 395 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPN4-208ENST00000460289 DENND6AQ8IWF6 608 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPN4-208ENST00000460289 LINC01555Q8NAE3 123 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPN4-208ENST00000460289 CT55Q8WUE5 264 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPN4-208ENST00000460289 FAM136AQ96C01 138 aa22.19■■□□□ 1.14
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PTPN4-208ENST00000460289 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa22.19■■□□□ 1.14
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PTPN4-208ENST00000460289 NFS1Q9Y697 457 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPN4-208ENST00000460289 E7EQ34 232 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPN4-208ENST00000460289 MATN4O95460 622 aa22.18■■□□□ 1.14
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PTPN4-208ENST00000460289 SLC1A2P43004 574 aa22.18■■□□□ 1.14
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PTPN4-208ENST00000460289 RPS15P62841 145 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
PTPN4-208ENST00000460289 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
PTPN4-208ENST00000460289 TTLL9Q3SXZ7 439 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPN4-208ENST00000460289 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPN4-208ENST00000460289 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
PTPN4-208ENST00000460289 CNSTQ6PJW8 725 aa22.18■■□□□ 1.14
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