RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000458938.2

U3.44-201, humanhuman

BASIC

Gene U3, Length 192 nt, Biotype snoRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3.44-201ENST00000458938 TPPP3Q9BW30 176 aa3.56□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 CEP41Q9BYV8 373 aa3.56□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 TM6SF2Q9BZW4 377 aa3.56□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa3.56□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 SLC5A7Q9GZV3 580 aa3.56□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 ADAM19Q9H013 955 aa3.56□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 KCNH6Q9H252 994 aa3.56□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 NEUROG2Q9H2A3 272 aa3.56□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 MUC13Q9H3R2 512 aa3.56□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 HOMER3Q9NSC5 361 aa3.56□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 NUDT15Q9NV35 164 aa3.56□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP3.56□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 PLA2G3Q9NZ20 509 aa3.56□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 COQ3Q9NZJ6 369 aa3.56□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 WHRNQ9P202 907 aa3.56□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 REV1Q9UBZ9 1251 aa3.56□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 SERGEFQ9UGK8 458 aa3.56□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 SLC25A13Q9UJS0 675 aa3.56□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 ADAM30Q9UKF2 790 aa3.56□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 DNPEPQ9ULA0 475 aa3.56□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 SLC8A2Q9UPR5 921 aa3.56□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 HIF3AQ9Y2N7 669 aa3.56□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 NEU2Q9Y3R4 380 aa3.56□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa3.56□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 CLDN16Q9Y5I7 305 aa3.56□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa3.56□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa3.56□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 MYO16Q9Y6X6 1858 aa3.56□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 HELZP42694 1942 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 TRAV34A0A0B4J273 112 aa3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 A0A0U1RQS6 177 aa3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 A0A1W2PRV1 198 aa3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 TSPAN11A1L157 253 aa3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 SH3D21A4FU49 640 aa3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 FAM47DPA6NHR8 397 aa3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 HMX3A6NHT5 357 aa3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 SLC22A31A6NKX4 558 aa3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 EFCAB8A8MWE9 144 aa3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 HACD1B0YJ81 288 aa3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 H7C0C1 242 aa3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 ERVH48-1M5A8F1 160 aa3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 KRIT1O00522 736 aa3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 E2F3O00716 465 aa3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 CES2O00748 559 aa3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 ALOX15BO15296 676 aa3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 MID1O15344 667 aa3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 SPINT1O43278 529 aa3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 BNIP3LO60238 219 aa3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 IL1BP01584 269 aa3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 EPOP01588 193 aa3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 APOA1P02647 267 aa3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 TK1P04183 234 aa3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 HLA-DQB2P05538 268 aa3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 KRT8P05787 483 aa3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 CSF1P09603 554 aa3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 TSHRP16473 764 aa3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 TCP1P17987 556 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 C5AR1P21730 350 aa3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 BCKDHBP21953 392 aa3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 PTAFRP25105 342 aa3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 ARNTP27540 789 aa3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 ACSL1P33121 698 aa3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 RPL22P35268 128 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 ADRA1AP35348 466 aa3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 PTGS2P35354 604 aa3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 COILP38432 576 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 SPAM1P38567 509 aa3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 CETN2P41208 172 aa3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 PTGIRP43119 386 aa3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 MMP13P45452 471 aa3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 KHKP50053 298 aa3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 PRRX1P54821 245 aa3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 RAB15P59190 212 aa3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 DSTNP60981 165 aa3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 RHOAP61586 193 aa3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 SPIBQ01892 262 aa3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 DSC2Q02487 901 aa3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 HSPA14Q0VDF9 509 aa3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 TRAF2Q12933 501 aa3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 PMS2P11Q13670 270 aa3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 CST6Q15828 149 aa3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 CDKN3Q16667 212 aa3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 CYP1B1Q16678 543 aa3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 UGP2Q16851 508 aa3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 MAJINQ3KP22 176 aa3.55□□□□□ -1.84
U3.44-201ENST00000458938 POM121L1PQ3SYA9 428 aa3.55□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.5 ms