RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441587.2

ALMS1-IT1-201, ALMS1 intronic transcript 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ALMS1-IT1, Length 2,107 nt, Biotype sense intronic.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 FAM89AQ96GI7 184 aa5.76□□□□□ -1.49
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 PLA2G12BQ9BX93 195 aa5.76□□□□□ -1.49
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 NDEL1Q9GZM8 345 aa5.76□□□□□ -1.49
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 HDHD2Q9H0R4 259 aa5.76□□□□□ -1.49
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 RAB17Q9H0T7 212 aa5.76□□□□□ -1.49
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 GPR160Q9UJ42 338 aa5.76□□□□□ -1.49
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 PPIL1Q9Y3C6 166 aa5.76□□□□□ -1.49
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 ABCC12Q96J65 1359 aa5.76□□□□□ -1.49
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 MROH7Q68CQ1 1323 aa5.76□□□□□ -1.49
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa5.76□□□□□ -1.49
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa5.75□□□□□ -1.49
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 MEI4A8MW99 385 aa5.75□□□□□ -1.49
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 SLCO1B7G3V0H7 640 aa5.75□□□□□ -1.49
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 KRT6BP04259 564 aa5.75□□□□□ -1.49
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 CRYGCP07315 174 aa5.75□□□□□ -1.49
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 NAGAP17050 411 aa5.75□□□□□ -1.49
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 PTNP21246 168 aa5.75□□□□□ -1.49
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 KRT6CP48668 564 aa5.75□□□□□ -1.49
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 TMED10P49755 219 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 KHKP50053 298 aa5.75□□□□□ -1.49
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 SMSP52788 366 aa5.75□□□□□ -1.49
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 PTTG1IPP53801 180 aa5.75□□□□□ -1.49
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 RAD23BP54727 409 aa5.75□□□□□ -1.49
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 PRMT2P55345 433 aa5.75□□□□□ -1.49
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 GPX6P59796 221 aa5.75□□□□□ -1.49
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 PRKCQQ04759 706 aa5.75□□□□□ -1.49
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 ITGA9Q13797 1035 aa5.75□□□□□ -1.49
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP5.75□□□□□ -1.49
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 TAZQ16635 292 aa5.75□□□□□ -1.49
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 DECR1Q16698 335 aa5.75□□□□□ -1.49
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 PARP6Q2NL67 630 aa5.75□□□□□ -1.49
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 SPATS1Q496A3 300 aa5.75□□□□□ -1.49
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 C18orf63Q68DL7 685 aa5.75□□□□□ -1.49
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 DENND1BQ6P3S1 775 aa5.75□□□□□ -1.49
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 SLC30A10Q6XR72 485 aa5.75□□□□□ -1.49
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 CHST9Q7L1S5 443 aa5.75□□□□□ -1.49
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 NLRX1Q86UT6 975 aa5.75□□□□□ -1.49
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 GPR65Q8IYL9 337 aa5.75□□□□□ -1.49
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 IQCKQ8N0W5 287 aa5.75□□□□□ -1.49
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 LEMD2Q8NC56 503 aa5.75□□□□□ -1.49
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 PLA2G15Q8NCC3 412 aa5.75□□□□□ -1.49
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 SLC17A8Q8NDX2 589 aa5.75□□□□□ -1.49
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 PERPQ96FX8 193 aa5.75□□□□□ -1.49
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa5.75□□□□□ -1.49
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 NSMCE3Q96MG7 304 aa5.75□□□□□ -1.49
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 SSX3Q99909 188 aa5.75□□□□□ -1.49
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 ALKBH4Q9NXW9 302 aa5.75□□□□□ -1.49
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 PTTG2Q9NZH5 202 aa5.75□□□□□ -1.49
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 KCND2Q9NZV8 630 aa5.75□□□□□ -1.49
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 SH3BP4Q9P0V3 963 aa5.75□□□□□ -1.49
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 STAP1Q9ULZ2 295 aa5.75□□□□□ -1.49
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 USP22Q9UPT9 525 aa5.75□□□□□ -1.49
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 LAMA4Q16363 1823 aa5.75□□□□□ -1.49
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 MYH3P11055 1940 aa5.75□□□□□ -1.49
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 ALOX15BO15296 676 aa5.75□□□□□ -1.49
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 SSX5O60225 188 aa5.75□□□□□ -1.49
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 NOBOXO60393 691 aa5.75□□□□□ -1.49
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 SEMA3DO95025 777 aa5.75□□□□□ -1.49
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 TJP3O95049 919 aa5.75□□□□□ -1.49
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 DDAH2O95865 285 aa5.75□□□□□ -1.49
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 LDLRP01130 860 aa5.75□□□□□ -1.49
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 CSF1RP07333 972 aa5.75□□□□□ -1.49
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 ABHD2P08910 425 aa5.75□□□□□ -1.49
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 SPATA31D3P0C874 917 aa5.75□□□□□ -1.49
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 SRCP12931 536 aa5.75□□□□□ -1.49
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 DARSP14868 501 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 FDXRP22570 491 aa5.75□□□□□ -1.49
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 SPAM1P38567 509 aa5.75□□□□□ -1.49
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 PCYT1AP49585 367 aa5.75□□□□□ -1.49
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 P2RX3P56373 397 aa5.75□□□□□ -1.49
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 SKP1P63208 163 aa5.75□□□□□ -1.49
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 KCNJ2P63252 427 aa5.75□□□□□ -1.49
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 ADAM17P78536 824 aa5.75□□□□□ -1.49
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 DUSP8Q13202 625 aa5.75□□□□□ -1.49
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 TUBB3Q13509 450 aa5.75□□□□□ -1.49
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 PCLAFQ15004 111 aa5.75□□□□□ -1.49
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 DPCR1Q3MIW9 517 aa5.75□□□□□ -1.49
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 CRY2Q49AN0 593 aa5.75□□□□□ -1.49
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 TMEM119Q4V9L6 283 aa5.75□□□□□ -1.49
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 LIN52Q52LA3 116 aa5.75□□□□□ -1.49
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 COLEC12Q5KU26 742 aa5.75□□□□□ -1.49
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 MFSD14BQ5SR56 506 aa5.75□□□□□ -1.49
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 SULT1C3Q6IMI6 304 aa5.75□□□□□ -1.49
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 ZNF425Q6IV72 752 aa5.75□□□□□ -1.49
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 KLHL35Q6PF15 583 aa5.75□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35 ms