RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403258.1

ACTBP8-201, Transcript of actin, beta pseudogene 8, humanhuman

BASIC

Gene ACTBP8, Length 1,108 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP8-201ENST00000403258 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
ACTBP8-201ENST00000403258 NUDT17P0C025 328 aa14.78□□□□□ -0.04
ACTBP8-201ENST00000403258 ANKRD34CP0C6C1 535 aa14.78□□□□□ -0.04
ACTBP8-201ENST00000403258 SLC35E2BP0CK96 405 aa14.78□□□□□ -0.04
ACTBP8-201ENST00000403258 HSD17B2P37059 387 aa14.78□□□□□ -0.04
ACTBP8-201ENST00000403258 MAGEA12P43365 314 aa14.78□□□□□ -0.04
ACTBP8-201ENST00000403258 ARHGAP19Q14CB8 494 aa14.78□□□□□ -0.04
ACTBP8-201ENST00000403258 RASA2Q15283 850 aa14.78□□□□□ -0.04
ACTBP8-201ENST00000403258 ANKS6Q68DC2 871 aa14.78□□□□□ -0.04
ACTBP8-201ENST00000403258 ARMC6Q6NXE6 501 aa14.78□□□□□ -0.04
ACTBP8-201ENST00000403258 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
ACTBP8-201ENST00000403258 CMC1Q7Z7K0 106 aa14.78□□□□□ -0.04
ACTBP8-201ENST00000403258 SPNS2Q8IVW8 549 aa14.78□□□□□ -0.04
ACTBP8-201ENST00000403258 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa14.78□□□□□ -0.04
ACTBP8-201ENST00000403258 OR9A1PQ8NGU1 263 aa14.78□□□□□ -0.04
ACTBP8-201ENST00000403258 OR2L8Q8NGY9 312 aa14.78□□□□□ -0.04
ACTBP8-201ENST00000403258 HMGCLL1Q8TB92 370 aa14.78□□□□□ -0.04
ACTBP8-201ENST00000403258 MTBPQ96DY7 904 aa14.78□□□□□ -0.04
ACTBP8-201ENST00000403258 SNX15Q9NRS6 342 aa14.78□□□□□ -0.04
ACTBP8-201ENST00000403258 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
ACTBP8-201ENST00000403258 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
ACTBP8-201ENST00000403258 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa14.78□□□□□ -0.04
ACTBP8-201ENST00000403258 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
ACTBP8-201ENST00000403258 PCM1Q15154 2024 aa14.78□□□□□ -0.04
ACTBP8-201ENST00000403258 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa14.77□□□□□ -0.04
ACTBP8-201ENST00000403258 ANKRD12Q6UB98 2062 aa14.77□□□□□ -0.04
ACTBP8-201ENST00000403258 A0A087X1B8 175 aa14.77□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa14.77□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 TLCD2A6NGC4 264 aa14.77□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 ZNF839A8K0R7 811 aa14.77□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 C2orf74A8MZ97 194 aa14.77□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 BTN3A3O00478 584 aa14.77□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 CCDC166P0CW27 439 aa14.77□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 GFERP55789 205 aa14.77□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 AP1S2P56377 157 aa14.77□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 CLDN6P56747 220 aa14.77□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 ATP6V0D1P61421 351 aa14.77□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 SHC2P98077 582 aa14.77□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP14.77□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 CYP2A13Q16696 494 aa14.77□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 CCSMST1Q4G0I0 132 aa14.77□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 SBSNQ6UWP8 590 aa14.77□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 RAPH1Q70E73 1250 aa14.77□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 PRSS42Q7Z5A4 293 aa14.77□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa14.77□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa14.77□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 TDRPQ86YL5 185 aa14.77□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 MCOLN3Q8TDD5 553 aa14.77□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 ANKRD49Q8WVL7 239 aa14.77□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 SLC22A18Q96BI1 424 aa14.77□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 CCDC74BQ96LY2 380 aa14.77□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 SCNM1Q9BWG6 230 aa14.77□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 STRADBQ9C0K7 418 aa14.77□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 SEMA6CQ9H3T2 930 aa14.77□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 XKR8Q9H6D3 395 aa14.77□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 PARVBQ9HBI1 364 aa14.77□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 TMEM9Q9P0T7 183 aa14.77□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 SEMA5BQ9P283 1151 aa14.77□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa14.77□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa14.77□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 POMT2Q9UKY4 750 aa14.77□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 PLAGL1Q9UM63 463 aa14.77□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 PDE10AQ9Y233 779 aa14.77□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 DCHS1Q96JQ0 3298 aa14.77□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 CCDC187A0A096LP49 1063 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 CCDC189A1A4V9 331 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 PIPSLA2A3N6 862 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 CCDC151A5D8V7 595 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 TRIM49D1C9J1S8 452 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 ERLIN1O75477 346 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 FKBP9O95302 570 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 SHBGP04278 402 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 C2P06681 752 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 CD1DP15813 335 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 HIST1H2ADP20671 130 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 TYK2P29597 1187 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 KIR2DS3Q14952 304 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 PPP1R3AQ16821 1122 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 PHF19Q5T6S3 580 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 IRGCQ6NXR0 463 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 LINC01555Q8NAE3 123 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 DENND1AQ8TEH3 1009 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 DLG3Q92796 817 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 CCDC138Q96M89 665 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 TGM7Q96PF1 710 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 PKP4Q99569 1192 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 HIST1H2AJQ99878 128 aa14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 76.1 ms