RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367364.5

PTPRC-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 1,017 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-202ENST00000367364 CLTAP09496 248 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 CCDC159P0C7I6 412 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 FDPSP14324 419 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 PFKFB1P16118 471 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 XBP1P17861 261 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 TCP1P17987 556 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 S100A1P23297 94 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 PRKAR2BP31323 418 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 HALP42357 657 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 GPC3P51654 580 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 CLCNKAP51800 687 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 MTTPP55157 894 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 ACVR2BQ13705 512 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 NDUFA5Q16718 116 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 SNAI3Q3KNW1 292 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 USP41Q3LFD5 358 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 PARP10Q53GL7 1025 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 RESP18Q5W5W9 173 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF790Q6PG37 636 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 WDR59Q6PJI9 974 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 CYP26C1Q6V0L0 522 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 ZBED8Q8IZ13 594 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 CNTROBQ8N137 903 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 NUP93Q8N1F7 819 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 BBS5Q8N3I7 341 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 ESX1Q8N693 406 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 NAT14Q8WUY8 206 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 DNAJC9Q8WXX5 260 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 C3orf49Q96BT1 292 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 EID2BQ96D98 161 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 OLFM3Q96PB7 478 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 SH3GL1Q99961 368 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 SYT17Q9BSW7 474 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 GBA3Q9H227 469 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 RABEP2Q9H5N1 569 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 LZTFL1Q9NQ48 299 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 ITM2BQ9Y287 266 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 A3GALT2U3KPV4 340 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 LAMB1P07942 1786 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 MYH3P11055 1940 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 LRP5O75197 1615 aa3.52□□□□□ -1.85
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PTPRC-202ENST00000367364 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
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PTPRC-202ENST00000367364 HSPB2A8KAH6 182 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 A8MUI8 341 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 KLRF2D3W0D1 207 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 HIP1O00291 1037 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 CIDEAO60543 219 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 ATP5HO75947 161 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
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PTPRC-202ENST00000367364 GSTT2P0CG29 244 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 GSTT2BP0CG30 244 aa3.51□□□□□ -1.85
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PTPRC-202ENST00000367364 TSPY10P0CW01 314 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
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PTPRC-202ENST00000367364 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 GTF2H1P32780 548 aa3.51□□□□□ -1.85
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PTPRC-202ENST00000367364 RGS2P41220 211 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 ACADSBP45954 432 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 ISL1P61371 349 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 AP2B1P63010 937 aa3.51□□□□□ -1.85
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PTPRC-202ENST00000367364 RCN1Q15293 331 aa3.51□□□□□ -1.85
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PTPRC-202ENST00000367364 MMEL1Q495T6 779 aa3.51□□□□□ -1.85
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PTPRC-202ENST00000367364 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa3.51□□□□□ -1.85
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PTPRC-202ENST00000367364 IFT20Q8IY31 132 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 ARL10Q8N8L6 244 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 UCMAQ8WVF2 138 aa3.51□□□□□ -1.85
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