RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365430.1

RNU6-487P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 487, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-487P, Length 104 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-487P-201ENST00000365430 CNIH4Q9P003 139 aa2.45□□□□□ -2.02
RNU6-487P-201ENST00000365430 GAGE2DQ9UEU5 116 aa2.45□□□□□ -2.02
RNU6-487P-201ENST00000365430 JRKLQ9Y4A0 524 aa2.45□□□□□ -2.02
RNU6-487P-201ENST00000365430 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa2.45□□□□□ -2.02
RNU6-487P-201ENST00000365430 CGNL1Q0VF96 1302 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-487P-201ENST00000365430 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-487P-201ENST00000365430 A0A087WV48 116 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-487P-201ENST00000365430 PLSCR5A0PG75 271 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-487P-201ENST00000365430 HTR3EA5X5Y0 456 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-487P-201ENST00000365430 MAGEA13PA6NCF6 341 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-487P-201ENST00000365430 C5orf52A6NGY3 159 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-487P-201ENST00000365430 DUXAA6NLW8 204 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-487P-201ENST00000365430 SMTNL1A8MU46 457 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-487P-201ENST00000365430 PRSS46E5RG02 174 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-487P-201ENST00000365430 FPGTO14772 594 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-487P-201ENST00000365430 CTDSPLO15194 276 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-487P-201ENST00000365430 TSPAN1O60635 241 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-487P-201ENST00000365430 CTSVO60911 334 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-487P-201ENST00000365430 BAG4O95429 457 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
RNU6-487P-201ENST00000365430 NTN1O95631 604 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-487P-201ENST00000365430 LDLRP01130 860 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-487P-201ENST00000365430 IGHV2-70P01814 119 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-487P-201ENST00000365430 RLN1P04808 185 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-487P-201ENST00000365430 H1F0P07305 194 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
RNU6-487P-201ENST00000365430 DLATP10515 647 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
RNU6-487P-201ENST00000365430 CSF2RAP15509 400 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-487P-201ENST00000365430 MSH3P20585 1137 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-487P-201ENST00000365430 ATP5DP30049 168 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-487P-201ENST00000365430 AHRP35869 848 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-487P-201ENST00000365430 SLC9A3P48764 834 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-487P-201ENST00000365430 PEX5P50542 639 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-487P-201ENST00000365430 ZNF132P52740 706 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-487P-201ENST00000365430 LIMK1P53667 647 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-487P-201ENST00000365430 FOLH1Q04609 750 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-487P-201ENST00000365430 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-487P-201ENST00000365430 AP1B1Q10567 949 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-487P-201ENST00000365430 MFAP5Q13361 173 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-487P-201ENST00000365430 TNK1Q13470 666 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-487P-201ENST00000365430 CUL3Q13618 768 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-487P-201ENST00000365430 SQLEQ14534 574 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-487P-201ENST00000365430 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP2.44□□□□□ -2.02
RNU6-487P-201ENST00000365430 MEP1BQ16820 701 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-487P-201ENST00000365430 UGT3A2Q3SY77 523 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-487P-201ENST00000365430 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-487P-201ENST00000365430 LRRC73Q5JTD7 316 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-487P-201ENST00000365430 ELFN2Q5R3F8 820 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-487P-201ENST00000365430 SHEQ5VZ18 495 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-487P-201ENST00000365430 TMEM270Q6UE05 265 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-487P-201ENST00000365430 BTNL8Q6UX41 500 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-487P-201ENST00000365430 PACS1Q6VY07 963 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-487P-201ENST00000365430 ZNF852Q6ZMS4 543 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-487P-201ENST00000365430 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP2.44□□□□□ -2.02
RNU6-487P-201ENST00000365430 ZNF575Q86XF7 245 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-487P-201ENST00000365430 TUSC5Q8IXB3 177 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-487P-201ENST00000365430 CDK20Q8IZL9 346 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-487P-201ENST00000365430 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
RNU6-487P-201ENST00000365430 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-487P-201ENST00000365430 GRHL3Q8TE85 626 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-487P-201ENST00000365430 GRK7Q8WTQ7 553 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-487P-201ENST00000365430 SECTM1Q8WVN6 248 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-487P-201ENST00000365430 IRGQQ8WZA9 623 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-487P-201ENST00000365430 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
RNU6-487P-201ENST00000365430 FAM162AQ96A26 154 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-487P-201ENST00000365430 VOPP1Q96AW1 172 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-487P-201ENST00000365430 CDCA5Q96FF9 252 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-487P-201ENST00000365430 BICD1Q96G01 975 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-487P-201ENST00000365430 C17orf77Q96MU5 243 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-487P-201ENST00000365430 LRRC3BQ96PB8 259 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-487P-201ENST00000365430 NEURL2Q9BR09 285 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-487P-201ENST00000365430 ZPBPQ9BS86 351 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-487P-201ENST00000365430 BTBD10Q9BSF8 475 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-487P-201ENST00000365430 INPP5KQ9BT40 448 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-487P-201ENST00000365430 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
RNU6-487P-201ENST00000365430 FUT8Q9BYC5 575 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-487P-201ENST00000365430 FN3KQ9H479 309 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-487P-201ENST00000365430 Q9H8V8 135 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-487P-201ENST00000365430 UBTD1Q9HAC8 227 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-487P-201ENST00000365430 CDH20Q9HBT6 801 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-487P-201ENST00000365430 GKN1Q9NS71 199 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-487P-201ENST00000365430 IL17BQ9UHF5 180 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-487P-201ENST00000365430 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP2.44□□□□□ -2.02
RNU6-487P-201ENST00000365430 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-487P-201ENST00000365430 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-487P-201ENST00000365430 CKAP5Q14008 2032 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-487P-201ENST00000365430 EVPLQ92817 2033 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-487P-201ENST00000365430 A0A1W2PRB8 838 aa2.43□□□□□ -2.02
RNU6-487P-201ENST00000365430 ANKRD66B4E2M5 251 aa2.43□□□□□ -2.02
RNU6-487P-201ENST00000365430 PLOD2O00469 737 aa2.43□□□□□ -2.02
RNU6-487P-201ENST00000365430 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP2.43□□□□□ -2.02
RNU6-487P-201ENST00000365430 XPNPEP2O43895 674 aa2.43□□□□□ -2.02
RNU6-487P-201ENST00000365430 FCGR3BO75015 233 aa2.43□□□□□ -2.02
RNU6-487P-201ENST00000365430 ATP6AP2O75787 350 aa2.43□□□□□ -2.02
RNU6-487P-201ENST00000365430 MOCS3O95396 460 aa2.43□□□□□ -2.02
RNU6-487P-201ENST00000365430 BAG3O95817 575 aa2.43□□□□□ -2.02
RNU6-487P-201ENST00000365430 PLGP00747 810 aaPredicted RBP2.43□□□□□ -2.02
RNU6-487P-201ENST00000365430 INHBAP08476 426 aa2.43□□□□□ -2.02
RNU6-487P-201ENST00000365430 PLA2G4BP0C869 781 aa2.43□□□□□ -2.02
RNU6-487P-201ENST00000365430 STAG3L1P0CL83 205 aa2.43□□□□□ -2.02
RNU6-487P-201ENST00000365430 DARSP14868 501 aaKnown RBP2.43□□□□□ -2.02
RNU6-487P-201ENST00000365430 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP2.43□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.2 ms