RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362832.1

RNU6-170P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 170, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-170P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-170P-201ENST00000362832 HOXD1Q9GZZ0 328 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 CPVLQ9H3G5 476 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 EPB41L5Q9HCM4 733 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 NLRC4Q9NPP4 1024 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP0.29□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 P4HTMQ9NXG6 502 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP0.29□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 MPP6Q9NZW5 540 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZNF319Q9P2F9 582 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 GAGE2DQ9UEU5 116 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 Q9UF83 564 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 HAO1Q9UJM8 370 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 OSGIN1Q9UJX0 560 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP0.29□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 CAPN7Q9Y6W3 813 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 MAU2Q9Y6X3 613 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 PTCH1Q13635 1447 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa0.28□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa0.28□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 ELOVL7A1L3X0 281 aa0.28□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 TMEM8BA6NDV4 472 aa0.28□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 NPIPB9F8W1W9 429 aa0.28□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 H3BQ06 376 aaPredicted RBP0.28□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP0.28□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 CAND2O75155 1236 aa0.28□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 GLRA3O75311 464 aa0.28□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 CDK2AP2O75956 126 aa0.28□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 DDHD2O94830 711 aa0.28□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 VENTXO95231 258 aa0.28□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP0.28□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP0.28□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 CD5P06127 495 aa0.28□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 PCP11498 1178 aaKnown RBP0.28□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 ANPEPP15144 967 aa0.28□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 SELEP16581 610 aa0.28□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 SERPINB3P29508 390 aa0.28□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 GGT5P36269 586 aa0.28□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 ELK3P41970 407 aa0.28□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 F2RL1P55085 397 aa0.28□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 TAS2R40P59535 323 aa0.28□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP0.28□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP0.28□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP0.28□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 GCNT1Q02742 428 aa0.28□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 PICALMQ13492 652 aa0.28□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 CDH18Q13634 790 aa0.28□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 ITGA7Q13683 1181 aa0.28□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 CAMK1Q14012 370 aa0.28□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 HERC3Q15034 1050 aa0.28□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZNF146Q15072 292 aa0.28□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 TAB1Q15750 504 aa0.28□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 NFIL3Q16649 462 aa0.28□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 MEP1AQ16819 746 aa0.28□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 ADCK5Q3MIX3 580 aa0.28□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 CCDC38Q502W7 563 aa0.28□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP0.28□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 LINC00242Q5T6M2 205 aa0.28□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 GRTP1Q5TC63 336 aa0.28□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 MARC1Q5VT66 337 aa0.28□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 GARNL3Q5VVW2 1013 aa0.28□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 ATG16L1Q676U5 607 aa0.28□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 LEMD1Q68G75 181 aa0.28□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 SEPT14Q6ZU15 432 aa0.28□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 LYPD1Q8N2G4 141 aa0.28□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 C4orf32Q8N8J7 132 aa0.28□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 TRIML1Q8N9V2 468 aa0.28□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 OR13C3Q8NGS6 347 aa0.28□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 OR52N5Q8NH56 324 aa0.28□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 GSDMBQ8TAX9 411 aa0.28□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 RNF128Q8TEB7 428 aa0.28□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP0.28□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 ITLN1Q8WWA0 313 aa0.28□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 KIF1BPQ96EK5 621 aa0.28□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP0.28□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 TMEM68Q96MH6 324 aa0.28□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 SPAG5Q96R06 1193 aa0.28□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 TBX15Q96SF7 602 aa0.28□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP0.28□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 NUP85Q9BW27 656 aa0.28□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 OCR1Q9BZK8 76 aa0.28□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 S1PR5Q9H228 398 aa0.28□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP0.28□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 PLSCR3Q9NRY6 295 aa0.28□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 FGF21Q9NSA1 209 aa0.28□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP0.28□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 MTMR10Q9NXD2 777 aa0.28□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP0.28□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 NPAP1Q9NZP6 1156 aa0.28□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP0.28□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP0.28□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP0.28□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 MKLN1Q9UL63 735 aa0.28□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 MTUS1Q9ULD2 1270 aa0.28□□□□□ -2.36
RNU6-170P-201ENST00000362832 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa0.28□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 NACAE9PAV3 2078 aa0.28□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa0.28□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 ITGB4P16144 1822 aa0.27□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa0.27□□□□□ -2.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.2 ms