RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588713.1

LIG3-211, Transcript of DNA ligase 3, humanhuman

TSL 2

Gene LIG3, Length 467 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIG3-211ENST00000588713 ETV5P41161 510 aa4.09□□□□□ -1.75
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LIG3-211ENST00000588713 NEK2P51955 445 aa4.09□□□□□ -1.75
LIG3-211ENST00000588713 NDST2P52849 883 aa4.09□□□□□ -1.75
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LIG3-211ENST00000588713 ATP6V0D1P61421 351 aa4.09□□□□□ -1.75
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LIG3-211ENST00000588713 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa4.09□□□□□ -1.75
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LIG3-211ENST00000588713 WDR41Q9HAD4 459 aa4.09□□□□□ -1.75
LIG3-211ENST00000588713 PARVBQ9HBI1 364 aa4.09□□□□□ -1.75
LIG3-211ENST00000588713 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
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LIG3-211ENST00000588713 SHANK1Q9Y566 2161 aa4.09□□□□□ -1.76
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LIG3-211ENST00000588713 ZNF839A8K0R7 811 aa4.08□□□□□ -1.76
LIG3-211ENST00000588713 BBIP1A8MTZ0 92 aa4.08□□□□□ -1.76
LIG3-211ENST00000588713 HACD1B0YJ81 288 aa4.08□□□□□ -1.76
LIG3-211ENST00000588713 C9orf172C9J069 976 aa4.08□□□□□ -1.76
LIG3-211ENST00000588713 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP4.08□□□□□ -1.76
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