RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587914.1

EFTUD2-208, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 562 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-208ENST00000587914 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
EFTUD2-208ENST00000587914 SUFUQ9UMX1 484 aa7.05□□□□□ -1.28
EFTUD2-208ENST00000587914 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
EFTUD2-208ENST00000587914 CCL27Q9Y4X3 112 aa7.05□□□□□ -1.28
EFTUD2-208ENST00000587914 TIMM22Q9Y584 194 aa7.05□□□□□ -1.28
EFTUD2-208ENST00000587914 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa7.05□□□□□ -1.28
EFTUD2-208ENST00000587914 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa7.05□□□□□ -1.28
EFTUD2-208ENST00000587914 AP4B1Q9Y6B7 739 aa7.05□□□□□ -1.28
EFTUD2-208ENST00000587914 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa7.05□□□□□ -1.28
EFTUD2-208ENST00000587914 LTBP2Q14767 1821 aa7.05□□□□□ -1.28
EFTUD2-208ENST00000587914 MICAL3Q7RTP6 2002 aa7.05□□□□□ -1.28
EFTUD2-208ENST00000587914 A0A1B0GTL3 188 aa7.04□□□□□ -1.28
EFTUD2-208ENST00000587914 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
EFTUD2-208ENST00000587914 TXNDC9O14530 226 aa7.04□□□□□ -1.28
EFTUD2-208ENST00000587914 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
EFTUD2-208ENST00000587914 ANKRD28O15084 1053 aa7.04□□□□□ -1.28
EFTUD2-208ENST00000587914 ARPC2O15144 300 aa7.04□□□□□ -1.28
EFTUD2-208ENST00000587914 PDPK1O15530 556 aa7.04□□□□□ -1.28
EFTUD2-208ENST00000587914 TAPBPO15533 448 aa7.04□□□□□ -1.28
EFTUD2-208ENST00000587914 GDF9O60383 454 aa7.04□□□□□ -1.28
EFTUD2-208ENST00000587914 MMP20O60882 483 aa7.04□□□□□ -1.28
EFTUD2-208ENST00000587914 TULP3O75386 442 aa7.04□□□□□ -1.28
EFTUD2-208ENST00000587914 STK16O75716 305 aa7.04□□□□□ -1.28
EFTUD2-208ENST00000587914 TRIM16O95361 564 aa7.04□□□□□ -1.28
EFTUD2-208ENST00000587914 KRT6AP02538 564 aa7.04□□□□□ -1.28
EFTUD2-208ENST00000587914 KRT6BP04259 564 aa7.04□□□□□ -1.28
EFTUD2-208ENST00000587914 IL6P05231 212 aa7.04□□□□□ -1.28
EFTUD2-208ENST00000587914 ANXA5P08758 320 aa7.04□□□□□ -1.28
EFTUD2-208ENST00000587914 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP7.04□□□□□ -1.28
EFTUD2-208ENST00000587914 FAM58BPP0C7Q3 252 aa7.04□□□□□ -1.28
EFTUD2-208ENST00000587914 LINC00271P0C7V0 271 aa7.04□□□□□ -1.28
EFTUD2-208ENST00000587914 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
EFTUD2-208ENST00000587914 ARSAP15289 507 aa7.04□□□□□ -1.28
EFTUD2-208ENST00000587914 PTPN2P17706 415 aa7.04□□□□□ -1.28
EFTUD2-208ENST00000587914 ATP6V1B2P21281 511 aa7.04□□□□□ -1.28
EFTUD2-208ENST00000587914 PRPH2P23942 346 aa7.04□□□□□ -1.28
EFTUD2-208ENST00000587914 FASP25445 335 aa7.04□□□□□ -1.28
EFTUD2-208ENST00000587914 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
EFTUD2-208ENST00000587914 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
EFTUD2-208ENST00000587914 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
EFTUD2-208ENST00000587914 RPL5P46777 297 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
EFTUD2-208ENST00000587914 GNPDA1P46926 289 aa7.04□□□□□ -1.28
EFTUD2-208ENST00000587914 KRT6CP48668 564 aa7.04□□□□□ -1.28
EFTUD2-208ENST00000587914 GSK3BP49841 420 aa7.04□□□□□ -1.28
EFTUD2-208ENST00000587914 AP1S2P56377 157 aa7.04□□□□□ -1.28
EFTUD2-208ENST00000587914 UFM1P61960 85 aa7.04□□□□□ -1.28
EFTUD2-208ENST00000587914 PRR20EP86478 221 aa7.04□□□□□ -1.28
EFTUD2-208ENST00000587914 PRR20CP86479 221 aa7.04□□□□□ -1.28
EFTUD2-208ENST00000587914 PRR20DP86480 221 aa7.04□□□□□ -1.28
EFTUD2-208ENST00000587914 PRR20BP86481 221 aa7.04□□□□□ -1.28
EFTUD2-208ENST00000587914 PRR20AP86496 221 aa7.04□□□□□ -1.28
EFTUD2-208ENST00000587914 ECT2LQ008S8 904 aa7.04□□□□□ -1.28
EFTUD2-208ENST00000587914 UBE3AQ05086 875 aa7.04□□□□□ -1.28
EFTUD2-208ENST00000587914 LIPEQ05469 1076 aa7.04□□□□□ -1.28
EFTUD2-208ENST00000587914 CCINQ13939 588 aa7.04□□□□□ -1.28
EFTUD2-208ENST00000587914 AP5B1Q2VPB7 878 aa7.04□□□□□ -1.28
EFTUD2-208ENST00000587914 FUT11Q495W5 492 aa7.04□□□□□ -1.28
EFTUD2-208ENST00000587914 LIN52Q52LA3 116 aa7.04□□□□□ -1.28
EFTUD2-208ENST00000587914 CACHD1Q5VU97 1274 aa7.04□□□□□ -1.28
EFTUD2-208ENST00000587914 LRRC66Q68CR7 880 aa7.04□□□□□ -1.28
EFTUD2-208ENST00000587914 CYP20A1Q6UW02 462 aa7.04□□□□□ -1.28
EFTUD2-208ENST00000587914 IL27RAQ6UWB1 636 aa7.04□□□□□ -1.28
EFTUD2-208ENST00000587914 LAYNQ6UX15 382 aa7.04□□□□□ -1.28
EFTUD2-208ENST00000587914 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa7.04□□□□□ -1.28
EFTUD2-208ENST00000587914 NLRP8Q86W28 1048 aa7.04□□□□□ -1.28
EFTUD2-208ENST00000587914 CMTM8Q8IZV2 173 aa7.04□□□□□ -1.28
EFTUD2-208ENST00000587914 PGBD3Q8N328 593 aa7.04□□□□□ -1.28
EFTUD2-208ENST00000587914 SFRP1Q8N474 314 aa7.04□□□□□ -1.28
EFTUD2-208ENST00000587914 FAM156AQ8NDB6 213 aa7.04□□□□□ -1.28
EFTUD2-208ENST00000587914 TRPV3Q8NET8 790 aa7.04□□□□□ -1.28
EFTUD2-208ENST00000587914 OR52B6Q8NGF0 335 aa7.04□□□□□ -1.28
EFTUD2-208ENST00000587914 OR52E4Q8NGH9 312 aa7.04□□□□□ -1.28
EFTUD2-208ENST00000587914 OR2T11Q8NH01 316 aa7.04□□□□□ -1.28
EFTUD2-208ENST00000587914 PROKR1Q8TCW9 393 aa7.04□□□□□ -1.28
EFTUD2-208ENST00000587914 ZFAND2BQ8WV99 257 aa7.04□□□□□ -1.28
EFTUD2-208ENST00000587914 OSCP1Q8WVF1 389 aa7.04□□□□□ -1.28
EFTUD2-208ENST00000587914 AUTS2Q8WXX7 1259 aa7.04□□□□□ -1.28
EFTUD2-208ENST00000587914 NCSTNQ92542 709 aa7.04□□□□□ -1.28
EFTUD2-208ENST00000587914 USP7Q93009 1102 aa7.04□□□□□ -1.28
EFTUD2-208ENST00000587914 VOPP1Q96AW1 172 aa7.04□□□□□ -1.28
EFTUD2-208ENST00000587914 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
EFTUD2-208ENST00000587914 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
EFTUD2-208ENST00000587914 CCDC115Q96NT0 180 aa7.04□□□□□ -1.28
EFTUD2-208ENST00000587914 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
EFTUD2-208ENST00000587914 ACOX2Q99424 681 aa7.04□□□□□ -1.28
EFTUD2-208ENST00000587914 TSC22D3Q99576 134 aa7.04□□□□□ -1.28
EFTUD2-208ENST00000587914 EGFL8Q99944 293 aa7.04□□□□□ -1.28
EFTUD2-208ENST00000587914 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
EFTUD2-208ENST00000587914 FAM83CQ9BQN1 747 aa7.04□□□□□ -1.28
EFTUD2-208ENST00000587914 C17orf80Q9BSJ5 609 aa7.04□□□□□ -1.28
EFTUD2-208ENST00000587914 HAUS8Q9BT25 410 aa7.04□□□□□ -1.28
EFTUD2-208ENST00000587914 C9orf16Q9BUW7 83 aa7.04□□□□□ -1.28
EFTUD2-208ENST00000587914 OSBPL6Q9BZF3 934 aa7.04□□□□□ -1.28
EFTUD2-208ENST00000587914 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa7.04□□□□□ -1.28
EFTUD2-208ENST00000587914 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
EFTUD2-208ENST00000587914 IL23AQ9NPF7 189 aa7.04□□□□□ -1.28
EFTUD2-208ENST00000587914 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa7.04□□□□□ -1.28
EFTUD2-208ENST00000587914 DZANK1Q9NVP4 752 aa7.04□□□□□ -1.28
EFTUD2-208ENST00000587914 WWOXQ9NZC7 414 aa7.04□□□□□ -1.28
EFTUD2-208ENST00000587914 DKK3Q9UBP4 350 aa7.04□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.4 ms