RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578501.5

CSNK1D-208, Transcript of casein kinase 1 delta, human

TSL 2

Gene CSNK1D, Length 1,124 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CSNK1D-208	ENST00000578501	TRIM56	Q9BRZ2	755 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
CSNK1D-208	ENST00000578501	HGH1	Q9BTY7	390 aa		13.24	□□□□□ -0.29
CSNK1D-208	ENST00000578501	TWSG1	Q9GZX9	223 aa		13.24	□□□□□ -0.29
CSNK1D-208	ENST00000578501	APMAP	Q9HDC9	416 aa		13.24	□□□□□ -0.29
CSNK1D-208	ENST00000578501	LATS2	Q9NRM7	1088 aa		13.24	□□□□□ -0.29
CSNK1D-208	ENST00000578501	C1GALT1	Q9NS00	363 aa		13.24	□□□□□ -0.29
CSNK1D-208	ENST00000578501	OR6C2	Q9NZP2	312 aa		13.24	□□□□□ -0.29
CSNK1D-208	ENST00000578501	PILRA	Q9UKJ1	303 aa		13.24	□□□□□ -0.29
CSNK1D-208	ENST00000578501	MAD1L1	Q9Y6D9	718 aa		13.24	□□□□□ -0.29
CSNK1D-208	ENST00000578501	FAM169A	Q9Y6X4	670 aa		13.24	□□□□□ -0.29
CSNK1D-208	ENST00000578501	C2orf74	A8MZ97	194 aa		13.23	□□□□□ -0.29
CSNK1D-208	ENST00000578501	BTN3A3	O00478	584 aa		13.23	□□□□□ -0.29
CSNK1D-208	ENST00000578501	BTN3A1	O00481	513 aa		13.23	□□□□□ -0.29
CSNK1D-208	ENST00000578501	EFS	O43281	561 aa		13.23	□□□□□ -0.29
CSNK1D-208	ENST00000578501	S1PR4	O95977	384 aa		13.23	□□□□□ -0.29
CSNK1D-208	ENST00000578501	MSL3P1	P0C860	447 aa		13.23	□□□□□ -0.29
CSNK1D-208	ENST00000578501	PGAM1	P18669	254 aa		13.23	□□□□□ -0.29
CSNK1D-208	ENST00000578501	MAP4	P27816	1152 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
CSNK1D-208	ENST00000578501	PRDX3	P30048	256 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
CSNK1D-208	ENST00000578501	ATP5D	P30049	168 aa		13.23	□□□□□ -0.29
CSNK1D-208	ENST00000578501	CASQ1	P31415	396 aa		13.23	□□□□□ -0.29
CSNK1D-208	ENST00000578501	FMO4	P31512	558 aa		13.23	□□□□□ -0.29
CSNK1D-208	ENST00000578501	SH3BP2	P78314	561 aa		13.23	□□□□□ -0.29
CSNK1D-208	ENST00000578501	ACY1	Q03154	408 aa		13.23	□□□□□ -0.29
CSNK1D-208	ENST00000578501	NFATC3	Q12968	1075 aa		13.23	□□□□□ -0.29
CSNK1D-208	ENST00000578501	THOC5	Q13769	683 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
CSNK1D-208	ENST00000578501	LARP7	Q4G0J3	582 aa	Known RBP eCLIP	13.23	□□□□□ -0.29
CSNK1D-208	ENST00000578501	COLEC12	Q5KU26	742 aa		13.23	□□□□□ -0.29
CSNK1D-208	ENST00000578501	CTSL3P	Q5NE16	218 aa		13.23	□□□□□ -0.29
CSNK1D-208	ENST00000578501	MANEA	Q5SRI9	462 aa		13.23	□□□□□ -0.29
CSNK1D-208	ENST00000578501	ZNF470	Q6ECI4	717 aa		13.23	□□□□□ -0.29
CSNK1D-208	ENST00000578501	HIBCH	Q6NVY1	386 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
CSNK1D-208	ENST00000578501	ATG14	Q6ZNE5	492 aa		13.23	□□□□□ -0.29
CSNK1D-208	ENST00000578501	VRK3	Q8IV63	474 aa		13.23	□□□□□ -0.29
CSNK1D-208	ENST00000578501	SIDT2	Q8NBJ9	832 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
CSNK1D-208	ENST00000578501	GSDMB	Q8TAX9	411 aa		13.23	□□□□□ -0.29
CSNK1D-208	ENST00000578501	EBNA1BP2	Q99848	306 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
CSNK1D-208	ENST00000578501	PITPNM3	Q9BZ71	974 aa		13.23	□□□□□ -0.29
CSNK1D-208	ENST00000578501	PDE7B	Q9NP56	450 aa		13.23	□□□□□ -0.29
CSNK1D-208	ENST00000578501	ICK	Q9UPZ9	632 aa		13.23	□□□□□ -0.29
CSNK1D-208	ENST00000578501	BTRC	Q9Y297	605 aa		13.23	□□□□□ -0.29
CSNK1D-208	ENST00000578501	MGA	Q8IWI9	3026 aa		13.22	□□□□□ -0.29
CSNK1D-208	ENST00000578501	GSAP	A4D1B5	854 aa		13.22	□□□□□ -0.29
CSNK1D-208	ENST00000578501	NDC80	O14777	642 aa		13.22	□□□□□ -0.29
CSNK1D-208	ENST00000578501	TTI1	O43156	1089 aa		13.22	□□□□□ -0.29
CSNK1D-208	ENST00000578501	RAD1	O60671	282 aa		13.22	□□□□□ -0.29
CSNK1D-208	ENST00000578501	STK17B	O94768	372 aa		13.22	□□□□□ -0.29
CSNK1D-208	ENST00000578501	DLGAP3	O95886	979 aa		13.22	□□□□□ -0.29
CSNK1D-208	ENST00000578501	TPBGL	P0DKB5	382 aa		13.22	□□□□□ -0.29
CSNK1D-208	ENST00000578501	PKM	P14618	531 aa	Known RBP	13.22	□□□□□ -0.29
CSNK1D-208	ENST00000578501	FOLR1	P15328	257 aa		13.22	□□□□□ -0.29
CSNK1D-208	ENST00000578501	ARL4D	P49703	201 aa		13.22	□□□□□ -0.29
CSNK1D-208	ENST00000578501	CSE1L	P55060	971 aa	Known RBP	13.22	□□□□□ -0.29
CSNK1D-208	ENST00000578501	DHX9	Q08211	1270 aa	Known RBP	13.22	□□□□□ -0.29
CSNK1D-208	ENST00000578501	GBX1	Q14549	363 aa		13.22	□□□□□ -0.29
CSNK1D-208	ENST00000578501	KYNU	Q16719	465 aa		13.22	□□□□□ -0.29
CSNK1D-208	ENST00000578501	KIAA1614	Q5VZ46	1190 aa		13.22	□□□□□ -0.29
CSNK1D-208	ENST00000578501	UNC5A	Q6ZN44	842 aa		13.22	□□□□□ -0.29
CSNK1D-208	ENST00000578501	PPP1R3B	Q86XI6	285 aa		13.22	□□□□□ -0.29
CSNK1D-208	ENST00000578501	DCUN1D3	Q8IWE4	304 aa		13.22	□□□□□ -0.29
CSNK1D-208	ENST00000578501	CACNA2D3	Q8IZS8	1091 aa		13.22	□□□□□ -0.29
CSNK1D-208	ENST00000578501	NLGN4X	Q8N0W4	816 aa		13.22	□□□□□ -0.29
CSNK1D-208	ENST00000578501	PDIK1L	Q8N165	341 aa		13.22	□□□□□ -0.29
CSNK1D-208	ENST00000578501	SERBP1	Q8NC51	408 aa	Known RBP eCLIP	13.22	□□□□□ -0.29
CSNK1D-208	ENST00000578501	NLGN4Y	Q8NFZ3	816 aa	Predicted RBP	13.22	□□□□□ -0.29
CSNK1D-208	ENST00000578501	OR8K5	Q8NH50	307 aa		13.22	□□□□□ -0.29
CSNK1D-208	ENST00000578501	LRRC39	Q96DD0	335 aa		13.22	□□□□□ -0.29
CSNK1D-208	ENST00000578501	FAM167B	Q9BTA0	163 aa		13.22	□□□□□ -0.29
CSNK1D-208	ENST00000578501	SYTL2	Q9HCH5	934 aa		13.22	□□□□□ -0.29
CSNK1D-208	ENST00000578501	C20orf96	Q9NUD7	363 aa	Predicted RBP	13.22	□□□□□ -0.29
CSNK1D-208	ENST00000578501	ACTR10	Q9NZ32	417 aa		13.22	□□□□□ -0.29
CSNK1D-208	ENST00000578501	IL1RAPL1	Q9NZN1	696 aa		13.22	□□□□□ -0.29
CSNK1D-208	ENST00000578501	KLHL42	Q9P2K6	505 aa		13.22	□□□□□ -0.29
CSNK1D-208	ENST00000578501	CRYL1	Q9Y2S2	319 aa		13.22	□□□□□ -0.29
CSNK1D-208	ENST00000578501	MRFAP1	Q9Y605	127 aa		13.22	□□□□□ -0.29
CSNK1D-208	ENST00000578501	COMMD10	Q9Y6G5	202 aa		13.22	□□□□□ -0.29
CSNK1D-208	ENST00000578501	SDK2	Q58EX2	2172 aa		13.21	□□□□□ -0.29
CSNK1D-208	ENST00000578501	PIPSL	A2A3N6	862 aa		13.21	□□□□□ -0.29
CSNK1D-208	ENST00000578501	TERT	O14746	1132 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.29
CSNK1D-208	ENST00000578501	SEC31A	O94979	1220 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.29
CSNK1D-208	ENST00000578501	SFTPC	P11686	197 aa		13.21	□□□□□ -0.29
CSNK1D-208	ENST00000578501	CDH3	P22223	829 aa		13.21	□□□□□ -0.29
CSNK1D-208	ENST00000578501	RAB28	P51157	221 aa		13.21	□□□□□ -0.29
CSNK1D-208	ENST00000578501	TUBB4B	P68371	445 aa		13.21	□□□□□ -0.29
CSNK1D-208	ENST00000578501	ABHD18	Q0P651	414 aa		13.21	□□□□□ -0.29
CSNK1D-208	ENST00000578501	ABR	Q12979	859 aa		13.21	□□□□□ -0.29
CSNK1D-208	ENST00000578501	CBLB	Q13191	982 aa		13.21	□□□□□ -0.29
CSNK1D-208	ENST00000578501	TUBB3	Q13509	450 aa		13.21	□□□□□ -0.29
CSNK1D-208	ENST00000578501	TUBB2A	Q13885	445 aa		13.21	□□□□□ -0.29
CSNK1D-208	ENST00000578501	KCNAB1	Q14722	419 aa		13.21	□□□□□ -0.29
CSNK1D-208	ENST00000578501	CRYM	Q14894	314 aa		13.21	□□□□□ -0.29
CSNK1D-208	ENST00000578501	MSS51	Q4VC12	460 aa		13.21	□□□□□ -0.29
CSNK1D-208	ENST00000578501	SPANXN3	Q5MJ09	141 aa		13.21	□□□□□ -0.29
CSNK1D-208	ENST00000578501	TMTC4	Q5T4D3	741 aa		13.21	□□□□□ -0.29
CSNK1D-208	ENST00000578501	SYT10	Q6XYQ8	523 aa		13.21	□□□□□ -0.29
CSNK1D-208	ENST00000578501	TIPARP	Q7Z3E1	657 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.29
CSNK1D-208	ENST00000578501	C17orf53	Q8N3J3	647 aa	Predicted RBP	13.21	□□□□□ -0.29
CSNK1D-208	ENST00000578501	IL22RA1	Q8N6P7	574 aa		13.21	□□□□□ -0.29
CSNK1D-208	ENST00000578501	SPATA4	Q8NEY3	305 aa		13.21	□□□□□ -0.29
CSNK1D-208	ENST00000578501	GABPB2	Q8TAK5	448 aa	Predicted RBP	13.21	□□□□□ -0.29

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