RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567479.1

KIFC3-231, Transcript of kinesin family member C3, human

TSL 4

Gene KIFC3, Length 534 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KIFC3-231	ENST00000567479	ISM1	B1AKI9	464 aa		9.09	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	TMEM150C	B9EJG8	249 aa		9.09	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479		E7EQ34	232 aa		9.09	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	KPNA5	O15131	536 aa		9.09	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	GPC4	O75487	556 aa		9.09	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	ZIC2	O95409	532 aa	Predicted RBP	9.09	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	RPN2	P04844	631 aa		9.09	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	CHRM5	P08912	532 aa	Predicted RBP	9.09	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	FURIN	P09958	794 aa		9.09	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	TPBGL	P0DKB5	382 aa		9.09	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	UGT2B7	P16662	529 aa		9.09	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	TPSB2	P20231	275 aa		9.09	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	CYP2A7	P20853	494 aa		9.09	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	MGAT1	P26572	445 aa		9.09	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	NMBR	P28336	390 aa		9.09	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	TERF1	P54274	439 aa		9.09	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	KCNC4	Q03721	635 aa		9.09	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	GPS2	Q13227	327 aa		9.09	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	TRIP13	Q15645	432 aa	Predicted RBP	9.09	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	TPSAB1	Q15661	275 aa		9.09	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	PLEKHS1	Q5SXH7	462 aa		9.09	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	TTC23L	Q6PF05	361 aa		9.09	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	SPESP1	Q6UW49	350 aa		9.09	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF517	Q6ZMY9	492 aa	Predicted RBP	9.09	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	CDHR3	Q6ZTQ4	885 aa		9.09	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	SYVN1	Q86TM6	617 aa		9.09	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	VRK3	Q8IV63	474 aa		9.09	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	GPR135	Q8IZ08	494 aa		9.09	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	SLC22A15	Q8IZD6	547 aa		9.09	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	KRT222	Q8N1A0	295 aa		9.09	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	RASGEF1C	Q8N431	466 aa		9.09	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	CFAP61	Q8NHU2	1237 aa		9.09	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	GSDMB	Q8TAX9	411 aa		9.09	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	THAP4	Q8WY91	577 aa		9.09	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	MAGOHB	Q96A72	148 aa	Known RBP	9.09	□□□□□ -0.95
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KIFC3-231	ENST00000567479	PANX3	Q96QZ0	392 aa		9.09	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	OR2A14	Q96R47	310 aa		9.09	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	RUFY1	Q96T51	708 aa		9.09	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	KIFC1	Q9BW19	673 aa		9.09	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	CHST8	Q9H2A9	424 aa		9.09	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	ACTL8	Q9H568	366 aa		9.09	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	MRM3	Q9HC36	420 aa	Known RBP	9.09	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	TREX1	Q9NSU2	369 aa		9.09	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	SPHK1	Q9NYA1	384 aa		9.09	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	MARCH4	Q9P2E8	410 aa	Predicted RBP	9.09	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	TTC7A	Q9ULT0	858 aa	Predicted RBP	9.09	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	PLAGL1	Q9UM63	463 aa		9.09	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	CDYL	Q9Y232	598 aa		9.09	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	JRKL	Q9Y4A0	524 aa		9.09	□□□□□ -0.95
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KIFC3-231	ENST00000567479	TCRBV7S3A2	A0A539	114 aa		9.08	□□□□□ -0.96
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KIFC3-231	ENST00000567479	PYCARD-AS1	I3L0S3	204 aa		9.08	□□□□□ -0.96
KIFC3-231	ENST00000567479	PFDN6	O15212	129 aa		9.08	□□□□□ -0.96
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF749	O43361	778 aa		9.08	□□□□□ -0.96
KIFC3-231	ENST00000567479	SLCO2B1	O94956	709 aa		9.08	□□□□□ -0.96
KIFC3-231	ENST00000567479	VAPB	O95292	243 aa		9.08	□□□□□ -0.96
KIFC3-231	ENST00000567479	WISP1	O95388	367 aa		9.08	□□□□□ -0.96
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KIFC3-231	ENST00000567479	HBQ1	P09105	142 aa		9.08	□□□□□ -0.96
KIFC3-231	ENST00000567479	RAB40AL	P0C0E4	278 aa		9.08	□□□□□ -0.96
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KIFC3-231	ENST00000567479	AOAH	P28039	575 aa		9.08	□□□□□ -0.96
KIFC3-231	ENST00000567479	VPS41	P49754	854 aa		9.08	□□□□□ -0.96
KIFC3-231	ENST00000567479	ITGA1	P56199	1179 aa		9.08	□□□□□ -0.96
KIFC3-231	ENST00000567479	RPS18	P62269	152 aa	Known RBP	9.08	□□□□□ -0.96
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KIFC3-231	ENST00000567479	KIR2DS3	Q14952	304 aa		9.08	□□□□□ -0.96
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KIFC3-231	ENST00000567479	KYNU	Q16719	465 aa		9.08	□□□□□ -0.96
KIFC3-231	ENST00000567479	UGT8	Q16880	541 aa		9.08	□□□□□ -0.96
KIFC3-231	ENST00000567479	KCTD19	Q17RG1	926 aa	Predicted RBP	9.08	□□□□□ -0.96
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF789	Q5FWF6	425 aa		9.08	□□□□□ -0.96
KIFC3-231	ENST00000567479	IZUMO3	Q5VZ72	239 aa		9.08	□□□□□ -0.96
KIFC3-231	ENST00000567479	MRNIP	Q6NTE8	343 aa		9.08	□□□□□ -0.96
KIFC3-231	ENST00000567479	CES3	Q6UWW8	571 aa		9.08	□□□□□ -0.96
KIFC3-231	ENST00000567479	TMEM135	Q86UB9	458 aa		9.08	□□□□□ -0.96
KIFC3-231	ENST00000567479	LRRC6	Q86X45	466 aa		9.08	□□□□□ -0.96
KIFC3-231	ENST00000567479	DSEL	Q8IZU8	1212 aa		9.08	□□□□□ -0.96
KIFC3-231	ENST00000567479	MPP5	Q8N3R9	675 aa		9.08	□□□□□ -0.96
KIFC3-231	ENST00000567479	OTUD6B	Q8N6M0	293 aa		9.08	□□□□□ -0.96
KIFC3-231	ENST00000567479	C19orf47	Q8N9M1	422 aa	Known RBP	9.08	□□□□□ -0.96
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KIFC3-231	ENST00000567479	SLC22A18	Q96BI1	424 aa		9.08	□□□□□ -0.96
KIFC3-231	ENST00000567479	MFSD3	Q96ES6	412 aa		9.08	□□□□□ -0.96
KIFC3-231	ENST00000567479	MS4A14	Q96JA4	679 aa		9.08	□□□□□ -0.96
KIFC3-231	ENST00000567479	TCF12	Q99081	682 aa		9.08	□□□□□ -0.96
KIFC3-231	ENST00000567479	NAP1L3	Q99457	506 aa	Predicted RBP	9.08	□□□□□ -0.96
KIFC3-231	ENST00000567479	P2RY12	Q9H244	342 aa		9.08	□□□□□ -0.96
KIFC3-231	ENST00000567479	ACTR5	Q9H9F9	607 aa	Predicted RBP	9.08	□□□□□ -0.96
KIFC3-231	ENST00000567479	FAM60A	Q9NP50	221 aa		9.08	□□□□□ -0.96
KIFC3-231	ENST00000567479	PCMTD2	Q9NV79	361 aa		9.08	□□□□□ -0.96
KIFC3-231	ENST00000567479	SYBU	Q9NX95	663 aa		9.08	□□□□□ -0.96
KIFC3-231	ENST00000567479	GNPTG	Q9UJJ9	305 aa		9.08	□□□□□ -0.96
KIFC3-231	ENST00000567479	SOX13	Q9UN79	622 aa		9.08	□□□□□ -0.96
KIFC3-231	ENST00000567479	MAN2B2	Q9Y2E5	1009 aa		9.08	□□□□□ -0.96
KIFC3-231	ENST00000567479	PIEZO2	Q9H5I5	2752 aa		9.08	□□□□□ -0.96
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF106	Q9H2Y7	1883 aa	Known RBP	9.08	□□□□□ -0.96

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