RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511747.5

SH3BP2-221, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,351 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-221ENST00000511747 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
SH3BP2-221ENST00000511747 CENPSQ8N2Z9 138 aa26.5■■□□□ 1.83
SH3BP2-221ENST00000511747 NAT16Q8N8M0 369 aa26.5■■□□□ 1.83
SH3BP2-221ENST00000511747 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
SH3BP2-221ENST00000511747 WBP2Q969T9 261 aa26.5■■□□□ 1.83
SH3BP2-221ENST00000511747 GNPTGQ9UJJ9 305 aa26.5■■□□□ 1.83
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SH3BP2-221ENST00000511747 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP26.5■■□□□ 1.83
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SH3BP2-221ENST00000511747 ADAM12O43184 909 aa26.49■■□□□ 1.83
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SH3BP2-221ENST00000511747 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
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SH3BP2-221ENST00000511747 C1orf109Q9NX04 203 aa26.48■■□□□ 1.83
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SH3BP2-221ENST00000511747 ZBTB2Q8N680 514 aa26.47■■□□□ 1.83
SH3BP2-221ENST00000511747 USP7Q93009 1102 aa26.47■■□□□ 1.83
SH3BP2-221ENST00000511747 CEP295NLQ96MC4 621 aa26.47■■□□□ 1.83
SH3BP2-221ENST00000511747 LATS2Q9NRM7 1088 aa26.47■■□□□ 1.83
SH3BP2-221ENST00000511747 ASIC5Q9NY37 505 aa26.47■■□□□ 1.83
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