RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503668.1

HULC-201, hepatocellular carcinoma up-regulated long non-coding RNA, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HULC, Length 556 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HULC-201ENST00000503668 LGI2Q8N0V4 545 aa9.2□□□□□ -0.94
HULC-201ENST00000503668 SLC15A4Q8N697 577 aa9.2□□□□□ -0.94
HULC-201ENST00000503668 METTL6Q8TCB7 284 aa9.2□□□□□ -0.94
HULC-201ENST00000503668 UBTD2Q8WUN7 234 aa9.2□□□□□ -0.94
HULC-201ENST00000503668 RORBQ92753 470 aa9.2□□□□□ -0.94
HULC-201ENST00000503668 TANKQ92844 425 aa9.2□□□□□ -0.94
HULC-201ENST00000503668 PSMG2Q969U7 264 aa9.2□□□□□ -0.94
HULC-201ENST00000503668 RMDN1Q96DB5 314 aa9.2□□□□□ -0.94
HULC-201ENST00000503668 ZNF583Q96ND8 569 aa9.2□□□□□ -0.94
HULC-201ENST00000503668 APOL4Q9BPW4 351 aa9.2□□□□□ -0.94
HULC-201ENST00000503668 NEURL2Q9BR09 285 aa9.2□□□□□ -0.94
HULC-201ENST00000503668 SPATA9Q9BWV2 254 aa9.2□□□□□ -0.94
HULC-201ENST00000503668 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
HULC-201ENST00000503668 LHPPQ9H008 270 aa9.2□□□□□ -0.94
HULC-201ENST00000503668 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
HULC-201ENST00000503668 ADNPQ9H2P0 1102 aa9.2□□□□□ -0.94
HULC-201ENST00000503668 TOR3AQ9H497 397 aa9.2□□□□□ -0.94
HULC-201ENST00000503668 DUSP21Q9H596 190 aa9.2□□□□□ -0.94
HULC-201ENST00000503668 RMND5AQ9H871 391 aa9.2□□□□□ -0.94
HULC-201ENST00000503668 SP140LQ9H930 580 aa9.2□□□□□ -0.94
HULC-201ENST00000503668 CPNE5Q9HCH3 593 aa9.2□□□□□ -0.94
HULC-201ENST00000503668 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
HULC-201ENST00000503668 TLR9Q9NR96 1032 aa9.2□□□□□ -0.94
HULC-201ENST00000503668 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
HULC-201ENST00000503668 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
HULC-201ENST00000503668 CD274Q9NZQ7 290 aa9.2□□□□□ -0.94
HULC-201ENST00000503668 SELENONQ9NZV5 590 aa9.2□□□□□ -0.94
HULC-201ENST00000503668 MPP6Q9NZW5 540 aa9.2□□□□□ -0.94
HULC-201ENST00000503668 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa9.2□□□□□ -0.94
HULC-201ENST00000503668 BTRCQ9Y297 605 aa9.2□□□□□ -0.94
HULC-201ENST00000503668 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa9.2□□□□□ -0.94
HULC-201ENST00000503668 DHRS7Q9Y394 339 aa9.2□□□□□ -0.94
HULC-201ENST00000503668 CPQQ9Y646 472 aa9.2□□□□□ -0.94
HULC-201ENST00000503668 CHD5Q8TDI0 1954 aa9.19□□□□□ -0.94
HULC-201ENST00000503668 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa9.19□□□□□ -0.94
HULC-201ENST00000503668 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa9.19□□□□□ -0.94
HULC-201ENST00000503668 A0A1W2PQH9 124 aa9.19□□□□□ -0.94
HULC-201ENST00000503668 OR6C75A6NL08 312 aa9.19□□□□□ -0.94
HULC-201ENST00000503668 H0Y626 953 aa9.19□□□□□ -0.94
HULC-201ENST00000503668 J3KR12 359 aa9.19□□□□□ -0.94
HULC-201ENST00000503668 M0R3G1 203 aa9.19□□□□□ -0.94
HULC-201ENST00000503668 TAF4O00268 1085 aa9.19□□□□□ -0.94
HULC-201ENST00000503668 BTN3A1O00481 513 aa9.19□□□□□ -0.94
HULC-201ENST00000503668 DLL1O00548 723 aa9.19□□□□□ -0.94
HULC-201ENST00000503668 E2F3O00716 465 aa9.19□□□□□ -0.94
HULC-201ENST00000503668 WNT9AO14904 365 aa9.19□□□□□ -0.94
HULC-201ENST00000503668 SYN3O14994 580 aa9.19□□□□□ -0.94
HULC-201ENST00000503668 MAGEB3O15480 346 aa9.19□□□□□ -0.94
HULC-201ENST00000503668 PRMT3O60678 531 aa9.19□□□□□ -0.94
HULC-201ENST00000503668 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
HULC-201ENST00000503668 TRIM16O95361 564 aa9.19□□□□□ -0.94
HULC-201ENST00000503668 GLUD1P00367 558 aa9.19□□□□□ -0.94
HULC-201ENST00000503668 MT-CO1P00395 513 aa9.19□□□□□ -0.94
HULC-201ENST00000503668 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
HULC-201ENST00000503668 PRPS2P11908 318 aa9.19□□□□□ -0.94
HULC-201ENST00000503668 ACVR2AP27037 513 aa9.19□□□□□ -0.94
HULC-201ENST00000503668 UGT2B10P36537 528 aa9.19□□□□□ -0.94
HULC-201ENST00000503668 MAGEA2P43356 314 aa9.19□□□□□ -0.94
HULC-201ENST00000503668 TMED10P49755 219 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
HULC-201ENST00000503668 ST13P50502 369 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
HULC-201ENST00000503668 ISL1P61371 349 aa9.19□□□□□ -0.94
HULC-201ENST00000503668 NKX3-2P78367 333 aa9.19□□□□□ -0.94
HULC-201ENST00000503668 CYP4F3Q08477 520 aa9.19□□□□□ -0.94
HULC-201ENST00000503668 ABHD18Q0P651 414 aa9.19□□□□□ -0.94
HULC-201ENST00000503668 ITGADQ13349 1161 aa9.19□□□□□ -0.94
HULC-201ENST00000503668 BFSP2Q13515 415 aa9.19□□□□□ -0.94
HULC-201ENST00000503668 DSC3Q14574 896 aa9.19□□□□□ -0.94
HULC-201ENST00000503668 TSNQ15631 228 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
HULC-201ENST00000503668 MAPKAPK3Q16644 382 aa9.19□□□□□ -0.94
HULC-201ENST00000503668 TTLL9Q3SXZ7 439 aa9.19□□□□□ -0.94
HULC-201ENST00000503668 TIGD2Q4W5G0 525 aa9.19□□□□□ -0.94
HULC-201ENST00000503668 RUNDC3AQ59EK9 446 aa9.19□□□□□ -0.94
HULC-201ENST00000503668 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
HULC-201ENST00000503668 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
HULC-201ENST00000503668 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
HULC-201ENST00000503668 ZNF783Q6ZMS7 281 aa9.19□□□□□ -0.94
HULC-201ENST00000503668 Q6ZSR9 355 aa9.19□□□□□ -0.94
HULC-201ENST00000503668 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
HULC-201ENST00000503668 KDELC2Q7Z4H8 507 aa9.19□□□□□ -0.94
HULC-201ENST00000503668 IGFN1Q86VF2 1251 aa9.19□□□□□ -0.94
HULC-201ENST00000503668 OFCC1Q8IZS5 231 aa9.19□□□□□ -0.94
HULC-201ENST00000503668 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa9.19□□□□□ -0.94
HULC-201ENST00000503668 ARL10Q8N8L6 244 aa9.19□□□□□ -0.94
HULC-201ENST00000503668 C3orf58Q8NDZ4 430 aa9.19□□□□□ -0.94
HULC-201ENST00000503668 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
HULC-201ENST00000503668 OR7A2PQ8NGA2 310 aa9.19□□□□□ -0.94
HULC-201ENST00000503668 SCAMP5Q8TAC9 235 aa9.19□□□□□ -0.94
HULC-201ENST00000503668 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa9.19□□□□□ -0.94
HULC-201ENST00000503668 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
HULC-201ENST00000503668 SLC22A17Q8WUG5 538 aa9.19□□□□□ -0.94
HULC-201ENST00000503668 SLC13A3Q8WWT9 602 aa9.19□□□□□ -0.94
HULC-201ENST00000503668 EXT2Q93063 718 aa9.19□□□□□ -0.94
HULC-201ENST00000503668 SLC47A1Q96FL8 570 aa9.19□□□□□ -0.94
HULC-201ENST00000503668 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
HULC-201ENST00000503668 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
HULC-201ENST00000503668 SPATA17Q96L03 361 aa9.19□□□□□ -0.94
HULC-201ENST00000503668 NSMCE3Q96MG7 304 aa9.19□□□□□ -0.94
HULC-201ENST00000503668 DACH2Q96NX9 599 aa9.19□□□□□ -0.94
HULC-201ENST00000503668 SEPHS2Q99611 448 aa9.19□□□□□ -0.94
HULC-201ENST00000503668 GPR21Q99679 349 aa9.19□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.6 ms