RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466636.1

SRPRB-202, Transcript of SRP receptor subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene SRPRB, Length 917 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRB-202ENST00000466636 TIMM22Q9Y584 194 aa9.31□□□□□ -0.92
SRPRB-202ENST00000466636 OR1A2Q9Y585 309 aa9.31□□□□□ -0.92
SRPRB-202ENST00000466636 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa9.31□□□□□ -0.92
SRPRB-202ENST00000466636 KRBA1A5PL33 1030 aa9.3□□□□□ -0.92
SRPRB-202ENST00000466636 KRT87PA6NCN2 255 aa9.3□□□□□ -0.92
SRPRB-202ENST00000466636 PRR19A6NJB7 356 aa9.3□□□□□ -0.92
SRPRB-202ENST00000466636 KMOO15229 486 aa9.3□□□□□ -0.92
SRPRB-202ENST00000466636 SLC22A2O15244 555 aa9.3□□□□□ -0.92
SRPRB-202ENST00000466636 SLC31A1O15431 190 aa9.3□□□□□ -0.92
SRPRB-202ENST00000466636 DCXO43602 365 aa9.3□□□□□ -0.92
SRPRB-202ENST00000466636 C1orf105O95561 183 aa9.3□□□□□ -0.92
SRPRB-202ENST00000466636 FUCA1P04066 466 aa9.3□□□□□ -0.92
SRPRB-202ENST00000466636 CEACAM5P06731 702 aa9.3□□□□□ -0.92
SRPRB-202ENST00000466636 ENO1P06733 434 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
SRPRB-202ENST00000466636 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
SRPRB-202ENST00000466636 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
SRPRB-202ENST00000466636 CALB2P22676 271 aa9.3□□□□□ -0.92
SRPRB-202ENST00000466636 ACADLP28330 430 aa9.3□□□□□ -0.92
SRPRB-202ENST00000466636 PRDX6P30041 224 aa9.3□□□□□ -0.92
SRPRB-202ENST00000466636 PIK3CGP48736 1102 aa9.3□□□□□ -0.92
SRPRB-202ENST00000466636 DGKEP52429 567 aa9.3□□□□□ -0.92
SRPRB-202ENST00000466636 STARD6P59095 220 aa9.3□□□□□ -0.92
SRPRB-202ENST00000466636 KIAA1024LP59773 190 aa9.3□□□□□ -0.92
SRPRB-202ENST00000466636 DMPKQ09013 629 aa9.3□□□□□ -0.92
SRPRB-202ENST00000466636 RPA4Q13156 261 aa9.3□□□□□ -0.92
SRPRB-202ENST00000466636 GAS6Q14393 721 aa9.3□□□□□ -0.92
SRPRB-202ENST00000466636 NFE2L1Q14494 772 aa9.3□□□□□ -0.92
SRPRB-202ENST00000466636 NAA25Q14CX7 972 aa9.3□□□□□ -0.92
SRPRB-202ENST00000466636 PTCHD3Q3KNS1 767 aa9.3□□□□□ -0.92
SRPRB-202ENST00000466636 XKR7Q5GH72 579 aa9.3□□□□□ -0.92
SRPRB-202ENST00000466636 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
SRPRB-202ENST00000466636 TMEM31Q5JXX7 168 aa9.3□□□□□ -0.92
SRPRB-202ENST00000466636 TMEM198Q66K66 360 aa9.3□□□□□ -0.92
SRPRB-202ENST00000466636 NXNQ6DKJ4 435 aa9.3□□□□□ -0.92
SRPRB-202ENST00000466636 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP9.3□□□□□ -0.922e-6■□□□□ 10
SRPRB-202ENST00000466636 AMZ2Q86W34 360 aa9.3□□□□□ -0.92
SRPRB-202ENST00000466636 KIF2BQ8N4N8 673 aa9.3□□□□□ -0.92
SRPRB-202ENST00000466636 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa9.3□□□□□ -0.92
SRPRB-202ENST00000466636 CDYL2Q8N8U2 506 aa9.3□□□□□ -0.92
SRPRB-202ENST00000466636 FLCNQ8NFG4 579 aa9.3□□□□□ -0.92
SRPRB-202ENST00000466636 OR4F6Q8NGB9 312 aa9.3□□□□□ -0.92
SRPRB-202ENST00000466636 CFAP61Q8NHU2 1237 aa9.3□□□□□ -0.92
SRPRB-202ENST00000466636 HMGB4Q8WW32 186 aa9.3□□□□□ -0.92
SRPRB-202ENST00000466636 KLHL29Q96CT2 875 aa9.3□□□□□ -0.92
SRPRB-202ENST00000466636 CCDC138Q96M89 665 aa9.3□□□□□ -0.92
SRPRB-202ENST00000466636 CATSPER2Q96P56 530 aa9.3□□□□□ -0.92
SRPRB-202ENST00000466636 CDK15Q96Q40 435 aa9.3□□□□□ -0.92
SRPRB-202ENST00000466636 HS3ST6Q96QI5 342 aa9.3□□□□□ -0.92
SRPRB-202ENST00000466636 PKP4Q99569 1192 aa9.3□□□□□ -0.92
SRPRB-202ENST00000466636 APOOQ9BUR5 198 aa9.3□□□□□ -0.92
SRPRB-202ENST00000466636 NTMT1Q9BV86 223 aa9.3□□□□□ -0.92
SRPRB-202ENST00000466636 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa9.3□□□□□ -0.92
SRPRB-202ENST00000466636 BTBD1Q9H0C5 482 aa9.3□□□□□ -0.92
SRPRB-202ENST00000466636 OR52A5Q9H2C5 316 aa9.3□□□□□ -0.92
SRPRB-202ENST00000466636 SLC32A1Q9H598 525 aa9.3□□□□□ -0.92
SRPRB-202ENST00000466636 RMI1Q9H9A7 625 aa9.3□□□□□ -0.92
SRPRB-202ENST00000466636 SGK2Q9HBY8 427 aa9.3□□□□□ -0.92
SRPRB-202ENST00000466636 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
SRPRB-202ENST00000466636 LTB4R2Q9NPC1 389 aa9.3□□□□□ -0.92
SRPRB-202ENST00000466636 TM7SF3Q9NS93 570 aa9.3□□□□□ -0.92
SRPRB-202ENST00000466636 C2orf42Q9NWW7 574 aa9.3□□□□□ -0.92
SRPRB-202ENST00000466636 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
SRPRB-202ENST00000466636 WNT16Q9UBV4 365 aa9.3□□□□□ -0.92
SRPRB-202ENST00000466636 TAGLN3Q9UI15 199 aa9.3□□□□□ -0.92
SRPRB-202ENST00000466636 BTRCQ9Y297 605 aa9.3□□□□□ -0.92
SRPRB-202ENST00000466636 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
SRPRB-202ENST00000466636 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa9.3□□□□□ -0.92
SRPRB-202ENST00000466636 CAPN7Q9Y6W3 813 aa9.3□□□□□ -0.92
SRPRB-202ENST00000466636 KLHL33A6NCF5 533 aa9.29□□□□□ -0.92
SRPRB-202ENST00000466636 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
SRPRB-202ENST00000466636 CFAP73A6NFT4 308 aa9.29□□□□□ -0.92
SRPRB-202ENST00000466636 LRRC72A6NJI9 287 aa9.29□□□□□ -0.92
SRPRB-202ENST00000466636 MYO1CO00159 1063 aa9.29□□□□□ -0.92
SRPRB-202ENST00000466636 GIPC1O14908 333 aa9.29□□□□□ -0.92
SRPRB-202ENST00000466636 LATO43561 262 aa9.29□□□□□ -0.92
SRPRB-202ENST00000466636 CRCPO75575 148 aa9.29□□□□□ -0.92
SRPRB-202ENST00000466636 SEMA4FO95754 770 aa9.29□□□□□ -0.92
SRPRB-202ENST00000466636 CAPN1P07384 714 aa9.29□□□□□ -0.92
SRPRB-202ENST00000466636 EBLN1P0CF75 366 aa9.29□□□□□ -0.92
SRPRB-202ENST00000466636 PRR35P0CG20 571 aa9.29□□□□□ -0.92
SRPRB-202ENST00000466636 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
SRPRB-202ENST00000466636 EPB42P16452 691 aa9.29□□□□□ -0.92
SRPRB-202ENST00000466636 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
SRPRB-202ENST00000466636 PIK3R1P27986 724 aa9.29□□□□□ -0.92
SRPRB-202ENST00000466636 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
SRPRB-202ENST00000466636 HTR6P50406 440 aa9.29□□□□□ -0.92
SRPRB-202ENST00000466636 ATP4BP51164 291 aa9.29□□□□□ -0.92
SRPRB-202ENST00000466636 CCNG1P51959 295 aa9.29□□□□□ -0.92
SRPRB-202ENST00000466636 PFN3P60673 137 aa9.29□□□□□ -0.92
SRPRB-202ENST00000466636 KCNJ2P63252 427 aa9.29□□□□□ -0.92
SRPRB-202ENST00000466636 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
SRPRB-202ENST00000466636 METRNLQ641Q3 311 aa9.29□□□□□ -0.92
SRPRB-202ENST00000466636 UNC5DQ6UXZ4 953 aa9.29□□□□□ -0.92
SRPRB-202ENST00000466636 RINLQ6ZS11 566 aa9.29□□□□□ -0.92
SRPRB-202ENST00000466636 RNF165Q6ZSG1 346 aa9.29□□□□□ -0.92
SRPRB-202ENST00000466636 MILR1Q7Z6M3 343 aa9.29□□□□□ -0.92
SRPRB-202ENST00000466636 PDZD3Q86UT5 571 aa9.29□□□□□ -0.92
SRPRB-202ENST00000466636 DDIASQ8IXT1 998 aa9.29□□□□□ -0.92
SRPRB-202ENST00000466636 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa9.29□□□□□ -0.92
SRPRB-202ENST00000466636 OR56A3Q8NH54 315 aa9.29□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.4 ms