RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464454.1

CLK1-208, Transcript of CDC like kinase 1, human

TSL 2

Gene CLK1, Length 484 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CLK1-208	ENST00000464454	THNSL1	Q8IYQ7	743 aa		3.87	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	CPSF7	Q8N684	471 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	SLC4A11	Q8NBS3	891 aa		3.87	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	ROBO4	Q8WZ75	1007 aa		3.87	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	LRRC3B	Q96PB8	259 aa		3.87	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	SPAG5	Q96R06	1193 aa		3.87	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	TRMT61B	Q9BVS5	477 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	ACKR4	Q9NPB9	350 aa		3.87	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	FAF1	Q9UNN5	650 aa	Predicted RBP	3.87	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	PADI2	Q9Y2J8	665 aa		3.87	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	IGLV5-45	A0A087WSX0	123 aa		3.86	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454		A0A1W2PPI3	338 aa		3.86	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	FEZF1	A0PJY2	475 aa		3.86	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	HYKK	A2RU49	373 aa		3.86	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	CTSV	O60911	334 aa		3.86	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	GLUL	P15104	373 aa		3.86	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	CBL	P22681	906 aa		3.86	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	SP100	P23497	879 aa	Predicted RBP	3.86	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	SLC6A6	P31641	620 aa		3.86	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	HSPA4	P34932	840 aa		3.86	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	GP5	P40197	560 aa		3.86	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	ASCL1	P50553	236 aa		3.86	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	PRKCZ	Q05513	592 aa		3.86	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	MFAP5	Q13361	173 aa		3.86	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	ZNF273	Q14593	569 aa		3.86	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	KIR2DS3	Q14952	304 aa		3.86	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	HECTD3	Q5T447	861 aa		3.86	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	PRR27	Q6MZM9	219 aa		3.86	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	LINGO4	Q6UY18	593 aa		3.86	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	FAM47E	Q6ZV65	393 aa		3.86	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	DGLUCY	Q7Z3D6	616 aa		3.86	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	GALNTL5	Q7Z4T8	443 aa		3.86	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	FAM114A1	Q8IWE2	563 aa		3.86	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	CEP57L1	Q8IYX8	460 aa		3.86	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	CRYBG2	Q8N1P7	616 aa		3.86	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	IQUB	Q8NA54	791 aa		3.86	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	SLC24A4	Q8NFF2	622 aa		3.86	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	SPATA3	Q8NHX4	192 aa		3.86	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	SETD6	Q8TBK2	473 aa		3.86	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	RNF128	Q8TEB7	428 aa		3.86	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	SGK494	Q96LW2	274 aa		3.86	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	ZNF558	Q96NG5	402 aa		3.86	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	ADPGK	Q9BRR6	497 aa		3.86	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	FAM129A	Q9BZQ8	928 aa		3.86	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	ZWILCH	Q9H900	591 aa		3.86	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	UPF2	Q9HAU5	1272 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	APOBEC3G	Q9HC16	384 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	OLFML3	Q9NRN5	406 aa		3.86	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	SLC38A7	Q9NVC3	462 aa		3.86	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	FRMD4A	Q9P2Q2	1039 aa	Predicted RBP	3.86	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	CPSF3	Q9UKF6	684 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	ABT1	Q9ULW3	272 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	LIPG	Q9Y5X9	500 aa		3.86	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	CLDN4	O14493	209 aa		3.85	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	PTGES	O14684	152 aa		3.85	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	WDR46	O15213	610 aa	Known RBP	3.85	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	PENK	P01210	267 aa	Predicted RBP	3.85	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	ATP5B	P06576	529 aa	Known RBP	3.85	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	PRSS1	P07477	247 aa		3.85	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	SP1	P08047	785 aa		3.85	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	ACP2	P11117	423 aa		3.85	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	TCEA1	P23193	301 aa	Known RBP	3.85	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	IRX6	P78412	446 aa	Predicted RBP	3.85	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	PPARD	Q03181	441 aa		3.85	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	MBTD1	Q05BQ5	628 aa		3.85	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		3.85	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	MFSD12	Q6NUT3	480 aa		3.85	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	SLC26A9	Q7LBE3	791 aa		3.85	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	LRRC8C	Q8TDW0	803 aa		3.85	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	SPSB1	Q96BD6	273 aa		3.85	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	C17orf77	Q96MU5	243 aa		3.85	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	FEV	Q99581	238 aa		3.85	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	KRTAP2-2	Q9BYT5	123 aa		3.85	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	MYNN	Q9NPC7	610 aa		3.85	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	TCF19	Q9Y242	345 aa		3.85	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454		A0A1W2PRB8	838 aa		3.84	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	NEMP2	A6NFY4	417 aa		3.84	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	ANXA2P2	A6NMY6	339 aa		3.84	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	CCDC188	H7C350	402 aa		3.84	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	SLC22A3	O75751	556 aa		3.84	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	WDPCP	O95876	746 aa		3.84	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	IGHV2-70	P01814	119 aa		3.84	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	PAX1	P15863	534 aa		3.84	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	CDC25C	P30307	473 aa		3.84	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	HOXC8	P31273	242 aa		3.84	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	NR2C2	P49116	596 aa		3.84	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	POLR2L	P62875	67 aa	Known RBP	3.84	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	RBP5	P82980	135 aa		3.84	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	SCARB2	Q14108	478 aa		3.84	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	GFI1B	Q5VTD9	330 aa		3.84	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	DCLRE1A	Q6PJP8	1040 aa		3.84	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	SUSD1	Q6UWL2	747 aa		3.84	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	PET117	Q6UWS5	81 aa		3.84	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	PPP1R21	Q6ZMI0	780 aa		3.84	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	USP43	Q70EL4	1123 aa		3.84	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	ZNF329	Q86UD4	541 aa		3.84	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	CCAR2	Q8N163	923 aa	Known RBP	3.84	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	ARHGAP24	Q8N264	748 aa		3.84	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	ZNF611	Q8N823	705 aa		3.84	□□□□□ -1.79

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