RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000378156.8

NPHP4-201, Transcript of nephrocystin 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NPHP4, Length 4,994 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP4-201ENST00000378156 INSL5Q9Y5Q6 135 aa14.76□□□□□ -0.05
NPHP4-201ENST00000378156 PCSK2P16519 638 aa14.76□□□□□ -0.05
NPHP4-201ENST00000378156 STARP49675 285 aa14.76□□□□□ -0.05
NPHP4-201ENST00000378156 HERC3Q15034 1050 aa14.76□□□□□ -0.05
NPHP4-201ENST00000378156 UBXN11Q5T124 520 aa14.76□□□□□ -0.05
NPHP4-201ENST00000378156 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
NPHP4-201ENST00000378156 CANT1Q8WVQ1 401 aa14.76□□□□□ -0.05
NPHP4-201ENST00000378156 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
NPHP4-201ENST00000378156 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
NPHP4-201ENST00000378156 EXD2Q9NVH0 621 aa14.76□□□□□ -0.05
NPHP4-201ENST00000378156 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
NPHP4-201ENST00000378156 KCTD3Q9Y597 815 aa14.76□□□□□ -0.05
NPHP4-201ENST00000378156 ZNF487B1APH4 448 aa14.76□□□□□ -0.05
NPHP4-201ENST00000378156 ANKRD66B4E2M5 251 aa14.76□□□□□ -0.05
NPHP4-201ENST00000378156 WNT9AO14904 365 aa14.76□□□□□ -0.05
NPHP4-201ENST00000378156 CNTN5O94779 1100 aa14.76□□□□□ -0.05
NPHP4-201ENST00000378156 ALPIP09923 528 aa14.76□□□□□ -0.05
NPHP4-201ENST00000378156 PRPS2P11908 318 aa14.76□□□□□ -0.05
NPHP4-201ENST00000378156 BMP7P18075 431 aa14.76□□□□□ -0.05
NPHP4-201ENST00000378156 SEC13P55735 322 aa14.76□□□□□ -0.05
NPHP4-201ENST00000378156 SERINC3Q13530 473 aa14.76□□□□□ -0.05
NPHP4-201ENST00000378156 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
NPHP4-201ENST00000378156 ERICH5Q6P6B1 374 aa14.76□□□□□ -0.05
NPHP4-201ENST00000378156 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa14.76□□□□□ -0.05
NPHP4-201ENST00000378156 GPR135Q8IZ08 494 aa14.76□□□□□ -0.05
NPHP4-201ENST00000378156 HM13Q8TCT9 377 aa14.76□□□□□ -0.05
NPHP4-201ENST00000378156 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
NPHP4-201ENST00000378156 CHD4Q14839 1912 aa14.76□□□□□ -0.05
NPHP4-201ENST00000378156 GPR32O75388 356 aa14.75□□□□□ -0.05
NPHP4-201ENST00000378156 IQCF3P0C7M6 154 aa14.75□□□□□ -0.05
NPHP4-201ENST00000378156 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
NPHP4-201ENST00000378156 SYN1P17600 705 aa14.75□□□□□ -0.05
NPHP4-201ENST00000378156 MYL9P24844 172 aa14.75□□□□□ -0.05
NPHP4-201ENST00000378156 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
NPHP4-201ENST00000378156 AKR1D1P51857 326 aa14.75□□□□□ -0.05
NPHP4-201ENST00000378156 CCNIQ14094 377 aa14.75□□□□□ -0.05
NPHP4-201ENST00000378156 PDGFRLQ15198 375 aa14.75□□□□□ -0.05
NPHP4-201ENST00000378156 POMGNT2Q8NAT1 580 aa14.75□□□□□ -0.05
NPHP4-201ENST00000378156 MOCS1Q9NZB8 636 aa14.75□□□□□ -0.05
NPHP4-201ENST00000378156 ELOVL7A1L3X0 281 aa14.75□□□□□ -0.05
NPHP4-201ENST00000378156 LSM1O15116 133 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
NPHP4-201ENST00000378156 FGF18O76093 207 aa14.75□□□□□ -0.05
NPHP4-201ENST00000378156 HIST1H2ABP04908 130 aa14.75□□□□□ -0.05
NPHP4-201ENST00000378156 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
NPHP4-201ENST00000378156 RFC2P35250 354 aa14.75□□□□□ -0.05
NPHP4-201ENST00000378156 CCNFP41002 786 aa14.75□□□□□ -0.05
NPHP4-201ENST00000378156 GATMP50440 423 aa14.75□□□□□ -0.05
NPHP4-201ENST00000378156 SMYD5Q6GMV2 418 aa14.75□□□□□ -0.05
NPHP4-201ENST00000378156 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa14.75□□□□□ -0.05
NPHP4-201ENST00000378156 XAGE5Q8WWM1 108 aa14.75□□□□□ -0.05
NPHP4-201ENST00000378156 HIST1H2ACQ93077 130 aa14.75□□□□□ -0.05
NPHP4-201ENST00000378156 ASB9Q96DX5 294 aa14.75□□□□□ -0.05
NPHP4-201ENST00000378156 TMEM138Q9NPI0 162 aa14.75□□□□□ -0.05
NPHP4-201ENST00000378156 CCNYL3P0C7X3 344 aa14.75□□□□□ -0.05
NPHP4-201ENST00000378156 RPS6KA3P51812 740 aa14.75□□□□□ -0.05
NPHP4-201ENST00000378156 MTPNP58546 118 aa14.75□□□□□ -0.05
NPHP4-201ENST00000378156 MTAPQ13126 283 aa14.75□□□□□ -0.05
NPHP4-201ENST00000378156 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa14.75□□□□□ -0.05
NPHP4-201ENST00000378156 SFT2D3Q587I9 215 aa14.75□□□□□ -0.05
NPHP4-201ENST00000378156 ARSIQ5FYB1 569 aa14.75□□□□□ -0.05
NPHP4-201ENST00000378156 TP53INP2Q8IXH6 220 aa14.75□□□□□ -0.05
NPHP4-201ENST00000378156 OR10A6Q8NH74 314 aa14.75□□□□□ -0.05
NPHP4-201ENST00000378156 ADAMTS15Q8TE58 950 aa14.75□□□□□ -0.05
NPHP4-201ENST00000378156 IGSF21Q96ID5 467 aa14.75□□□□□ -0.05
NPHP4-201ENST00000378156 CDK15Q96Q40 435 aa14.75□□□□□ -0.05
NPHP4-201ENST00000378156 C1orf109Q9NX04 203 aa14.75□□□□□ -0.05
NPHP4-201ENST00000378156 TAF1P21675 1872 aa14.75□□□□□ -0.05
NPHP4-201ENST00000378156 FPGTO14772 594 aa14.75□□□□□ -0.05
NPHP4-201ENST00000378156 PI15O43692 258 aa14.75□□□□□ -0.05
NPHP4-201ENST00000378156 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP14.75□□□□□ -0.05
NPHP4-201ENST00000378156 APLP1P51693 650 aa14.75□□□□□ -0.05
NPHP4-201ENST00000378156 PNLIPRP1P54315 467 aa14.75□□□□□ -0.05
NPHP4-201ENST00000378156 UGT2B15P54855 530 aa14.75□□□□□ -0.05
NPHP4-201ENST00000378156 CYP4F3Q08477 520 aa14.75□□□□□ -0.05
NPHP4-201ENST00000378156 DDI2Q5TDH0 399 aa14.75□□□□□ -0.05
NPHP4-201ENST00000378156 DEF8Q6ZN54 512 aa14.75□□□□□ -0.05
NPHP4-201ENST00000378156 ASRGL1Q7L266 308 aa14.75□□□□□ -0.05
NPHP4-201ENST00000378156 ANKRD46Q86W74 232 aa14.75□□□□□ -0.05
NPHP4-201ENST00000378156 LCN9Q8WX39 176 aa14.75□□□□□ -0.05
NPHP4-201ENST00000378156 PKP2Q99959 881 aa14.75□□□□□ -0.05
NPHP4-201ENST00000378156 CCDC106Q9BWC9 280 aa14.75□□□□□ -0.05
NPHP4-201ENST00000378156 RACGAP1Q9H0H5 632 aa14.75□□□□□ -0.05
NPHP4-201ENST00000378156 OR2AG1Q9H205 316 aa14.75□□□□□ -0.05
NPHP4-201ENST00000378156 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
NPHP4-201ENST00000378156 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
NPHP4-201ENST00000378156 CLDN25C9JDP6 229 aa14.74□□□□□ -0.05
NPHP4-201ENST00000378156 K7EPI3 171 aa14.74□□□□□ -0.05
NPHP4-201ENST00000378156 FFAR2O15552 330 aa14.74□□□□□ -0.05
NPHP4-201ENST00000378156 THRBP10828 461 aa14.74□□□□□ -0.05
NPHP4-201ENST00000378156 SLC7A1P30825 629 aa14.74□□□□□ -0.05
NPHP4-201ENST00000378156 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
NPHP4-201ENST00000378156 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa14.74□□□□□ -0.05
NPHP4-201ENST00000378156 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa14.74□□□□□ -0.05
NPHP4-201ENST00000378156 FAR1Q8WVX9 515 aa14.74□□□□□ -0.05
NPHP4-201ENST00000378156 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
NPHP4-201ENST00000378156 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa14.74□□□□□ -0.05
NPHP4-201ENST00000378156 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa14.74□□□□□ -0.05
NPHP4-201ENST00000378156 MYH7BA7E2Y1 1941 aa14.74□□□□□ -0.05
NPHP4-201ENST00000378156 PROZP22891 400 aa14.74□□□□□ -0.05
NPHP4-201ENST00000378156 MAPK12P53778 367 aa14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.3 ms