RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366686.1

CCSAP-202, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CCSAP, Length 4,399 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-202ENST00000366686 CASP1P29466 404 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 NTSR1P30989 418 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 SLC16A2P36021 539 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 KCNJ1P48048 391 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 COMPP49747 757 aaPredicted RBP2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 PEX5P50542 639 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 SCNN1GP51170 649 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 ITGA1P56199 1179 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 TFAP4Q01664 338 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 GUCY2DQ02846 1103 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 SPP2Q13103 211 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 TDGQ13569 410 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 CBFBQ13951 182 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 UBXN2BQ14CS0 331 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 STX12Q86Y82 276 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 PSD4Q8NDX1 1056 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 OSCP1Q8WVF1 389 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 RAD54LQ92698 747 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 LPPQ93052 612 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 CCDC51Q96ER9 411 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 SGF29Q96ES7 293 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF583Q96ND8 569 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 KLHL5Q96PQ7 755 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 PACSIN1Q9BY11 444 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 ADAMTS10Q9H324 1103 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 RIBC2Q9H4K1 309 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 CENPMQ9NSP4 180 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 ERAP1Q9NZ08 941 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 SORCS3Q9UPU3 1222 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 SHOC2Q9UQ13 582 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 UBN2Q6ZU65 1347 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 ARHGEF10O15013 1369 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 SCN9AQ15858 1988 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 KANSL1LA0AUZ9 987 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 CTAGE9A4FU28 777 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 HIP1O00291 1037 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 ARHGEF9O43307 516 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 AGFG2O95081 481 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 IFNA14P01570 189 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 ITGB1P05556 798 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 MMP2P08253 660 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 CYC1P08574 325 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 OR52Z1P0C646 297 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 CTAGE8P0CG41 777 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 AREGP15514 252 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 GNAZP19086 355 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 THBS4P35443 961 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 ADCY8P40145 1251 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF84P51523 738 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 LILRA4P59901 499 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 SRP54P61011 504 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 GNG11P61952 73 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 RPL19P84098 196 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 ACSM1Q08AH1 577 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 MESP2Q0VG99 397 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 TMED2Q15363 201 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 CEBPEQ15744 281 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 ZSWIM7Q19AV6 140 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 PTPN20Q4JDL3 420 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 TRIM69Q86WT6 500 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 CTAGE4Q8IX94 777 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 PDZD8Q8NEN9 1154 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 NEK11Q8NG66 645 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 GORASP1Q9BQQ3 440 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 SYTL2Q9HCH5 934 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 QPCTLQ9NXS2 382 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 TPRP12270 2363 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 KIF7Q2M1P5 1343 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 TRIM77I1YAP6 450 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 PEX1O43933 1283 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 PSPNO60542 156 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 ZWINTO95229 277 aa2.45□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 CRYGCP07315 174 aa2.45□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.8 ms