RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264010.8

CTCF-201, Transcript of CCCTC-binding factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTCF, Length 3,939 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTCF-201ENST00000264010 LRRC3Q9BY71 257 aa15.97■□□□□ 0.15
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CTCF-201ENST00000264010 QSOX1O00391 747 aa15.97■□□□□ 0.15
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CTCF-201ENST00000264010 SLC22A12Q96S37 553 aa15.95■□□□□ 0.14
CTCF-201ENST00000264010 CD244Q9BZW8 370 aa15.95■□□□□ 0.14
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CTCF-201ENST00000264010 SLC13A3Q8WWT9 602 aa15.95■□□□□ 0.14
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CTCF-201ENST00000264010 IL26Q9NPH9 171 aa15.95■□□□□ 0.14
CTCF-201ENST00000264010 C1orf109Q9NX04 203 aa15.95■□□□□ 0.14
CTCF-201ENST00000264010 C16orf96A6NNT2 1141 aa15.95■□□□□ 0.14
CTCF-201ENST00000264010 CXCL10P02778 98 aa15.95■□□□□ 0.14
CTCF-201ENST00000264010 DPP6P42658 865 aa15.95■□□□□ 0.14
CTCF-201ENST00000264010 CCT3P49368 545 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
CTCF-201ENST00000264010 DEFA1P59665 94 aa15.95■□□□□ 0.14
CTCF-201ENST00000264010 DEFA3P59666 94 aa15.95■□□□□ 0.14
CTCF-201ENST00000264010 ERVPABLB-1P60509 514 aa15.95■□□□□ 0.14
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