RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000239367.6

LRP11-201, Transcript of LDL receptor related protein 11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRP11, Length 3,260 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP11-201ENST00000239367 GDPD3Q7L5L3 318 aa16.08■□□□□ 0.17
LRP11-201ENST00000239367 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa16.08■□□□□ 0.17
LRP11-201ENST00000239367 METTL23Q86XA0 190 aa16.08■□□□□ 0.17
LRP11-201ENST00000239367 TCAIMQ8N3R3 496 aa16.08■□□□□ 0.17
LRP11-201ENST00000239367 TEX26Q8N6G2 289 aa16.08■□□□□ 0.17
LRP11-201ENST00000239367 STAG3L4Q8TBR4 150 aa16.08■□□□□ 0.17
LRP11-201ENST00000239367 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.17
LRP11-201ENST00000239367 RUBCNLQ9H714 662 aa16.08■□□□□ 0.17
LRP11-201ENST00000239367 USE1Q9NZ43 259 aa16.08■□□□□ 0.17
LRP11-201ENST00000239367 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.17
LRP11-201ENST00000239367 BTBD3Q9Y2F9 522 aa16.08■□□□□ 0.17
LRP11-201ENST00000239367 SMIM30A4D0T7 59 aa16.08■□□□□ 0.16
LRP11-201ENST00000239367 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
LRP11-201ENST00000239367 KERAO60938 352 aa16.08■□□□□ 0.16
LRP11-201ENST00000239367 VIPP01282 170 aa16.08■□□□□ 0.16
LRP11-201ENST00000239367 NAT1P18440 290 aa16.08■□□□□ 0.16
LRP11-201ENST00000239367 GADD45AP24522 165 aa16.08■□□□□ 0.16
LRP11-201ENST00000239367 CXCR2P25025 360 aa16.08■□□□□ 0.16
LRP11-201ENST00000239367 DCTP40126 519 aa16.08■□□□□ 0.16
LRP11-201ENST00000239367 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
LRP11-201ENST00000239367 HMGCS1Q01581 520 aa16.08■□□□□ 0.16
LRP11-201ENST00000239367 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa16.08■□□□□ 0.16
LRP11-201ENST00000239367 C6orf136Q5SQH8 315 aa16.08■□□□□ 0.16
LRP11-201ENST00000239367 CYP4Z1Q86W10 505 aa16.08■□□□□ 0.16
LRP11-201ENST00000239367 NLGN4XQ8N0W4 816 aa16.08■□□□□ 0.16
LRP11-201ENST00000239367 SVOPQ8N4V2 548 aa16.08■□□□□ 0.16
LRP11-201ENST00000239367 KIAA1191Q96A73 305 aa16.08■□□□□ 0.16
LRP11-201ENST00000239367 ZNF599Q96NL3 588 aa16.08■□□□□ 0.16
LRP11-201ENST00000239367 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
LRP11-201ENST00000239367 J3KR12 359 aa16.07■□□□□ 0.16
LRP11-201ENST00000239367 M0R129 80 aa16.07■□□□□ 0.16
LRP11-201ENST00000239367 HAS3O00219 553 aa16.07■□□□□ 0.16
LRP11-201ENST00000239367 ZW10O43264 779 aa16.07■□□□□ 0.16
LRP11-201ENST00000239367 CSF2P04141 144 aa16.07■□□□□ 0.16
LRP11-201ENST00000239367 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
LRP11-201ENST00000239367 PSEN2P49810 448 aa16.07■□□□□ 0.16
LRP11-201ENST00000239367 FAM189BP81408 668 aa16.07■□□□□ 0.16
LRP11-201ENST00000239367 SLC10A7Q0GE19 358 aa16.07■□□□□ 0.16
LRP11-201ENST00000239367 GRB14Q14449 540 aa16.07■□□□□ 0.16
LRP11-201ENST00000239367 UPP1Q16831 310 aa16.07■□□□□ 0.16
LRP11-201ENST00000239367 AP5B1Q2VPB7 878 aa16.07■□□□□ 0.16
LRP11-201ENST00000239367 RGMBQ6NW40 437 aa16.07■□□□□ 0.16
LRP11-201ENST00000239367 LYPD8Q6UX82 237 aa16.07■□□□□ 0.16
LRP11-201ENST00000239367 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
LRP11-201ENST00000239367 ADHFE1Q8IWW8 467 aa16.07■□□□□ 0.16
LRP11-201ENST00000239367 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa16.07■□□□□ 0.16
LRP11-201ENST00000239367 PROKR1Q8TCW9 393 aa16.07■□□□□ 0.16
LRP11-201ENST00000239367 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa16.07■□□□□ 0.16
LRP11-201ENST00000239367 CDCA5Q96FF9 252 aa16.07■□□□□ 0.16
LRP11-201ENST00000239367 NEDD4LQ96PU5 975 aa16.07■□□□□ 0.16
LRP11-201ENST00000239367 PKMYT1Q99640 499 aa16.07■□□□□ 0.16
LRP11-201ENST00000239367 IKZF5Q9H5V7 419 aa16.07■□□□□ 0.16
LRP11-201ENST00000239367 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
LRP11-201ENST00000239367 ASB1Q9Y576 335 aa16.07■□□□□ 0.16
LRP11-201ENST00000239367 GRXCR2A6NFK2 248 aa16.07■□□□□ 0.16
LRP11-201ENST00000239367 MOXD2PA6NHM9 499 aa16.07■□□□□ 0.16
LRP11-201ENST00000239367 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa16.07■□□□□ 0.16
LRP11-201ENST00000239367 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
LRP11-201ENST00000239367 ECI2O75521 394 aa16.07■□□□□ 0.16
LRP11-201ENST00000239367 GABARAPO95166 117 aa16.07■□□□□ 0.16
LRP11-201ENST00000239367 LRATO95237 230 aa16.07■□□□□ 0.16
LRP11-201ENST00000239367 B3GALT4O96024 378 aa16.07■□□□□ 0.16
LRP11-201ENST00000239367 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
LRP11-201ENST00000239367 EMX2Q04743 252 aa16.07■□□□□ 0.16
LRP11-201ENST00000239367 SPANXN2Q5MJ10 180 aa16.07■□□□□ 0.16
LRP11-201ENST00000239367 SYTL2Q9HCH5 934 aa16.07■□□□□ 0.16
LRP11-201ENST00000239367 FAM105AQ9NUU6 356 aa16.07■□□□□ 0.16
LRP11-201ENST00000239367 MIOSQ9NXC5 875 aa16.07■□□□□ 0.16
LRP11-201ENST00000239367 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
LRP11-201ENST00000239367 CXCR6O00574 342 aa16.07■□□□□ 0.16
LRP11-201ENST00000239367 MED26O95402 600 aa16.07■□□□□ 0.16
LRP11-201ENST00000239367 CAPN1P07384 714 aa16.07■□□□□ 0.16
LRP11-201ENST00000239367 OGNP20774 298 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
LRP11-201ENST00000239367 GJA5P36382 358 aa16.07■□□□□ 0.16
LRP11-201ENST00000239367 DEFA1P59665 94 aa16.07■□□□□ 0.16
LRP11-201ENST00000239367 DEFA3P59666 94 aa16.07■□□□□ 0.16
LRP11-201ENST00000239367 DMC1Q14565 340 aa16.07■□□□□ 0.16
LRP11-201ENST00000239367 MAPKAPK3Q16644 382 aa16.07■□□□□ 0.16
LRP11-201ENST00000239367 ATAD3CQ5T2N8 411 aa16.07■□□□□ 0.16
LRP11-201ENST00000239367 ARMC4Q5T2S8 1044 aa16.07■□□□□ 0.16
LRP11-201ENST00000239367 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
LRP11-201ENST00000239367 GPR142Q7Z601 462 aa16.07■□□□□ 0.16
LRP11-201ENST00000239367 RIMKLAQ8IXN7 391 aa16.07■□□□□ 0.16
LRP11-201ENST00000239367 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
LRP11-201ENST00000239367 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
LRP11-201ENST00000239367 DERL2Q9GZP9 239 aa16.07■□□□□ 0.16
LRP11-201ENST00000239367 TMLHEQ9NVH6 421 aa16.07■□□□□ 0.16
LRP11-201ENST00000239367 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
LRP11-201ENST00000239367 FAM92AA1XBS5 289 aa16.06■□□□□ 0.16
LRP11-201ENST00000239367 CTDSP2O14595 271 aa16.06■□□□□ 0.16
LRP11-201ENST00000239367 TLR5O60602 858 aa16.06■□□□□ 0.16
LRP11-201ENST00000239367 TULP3O75386 442 aa16.06■□□□□ 0.16
LRP11-201ENST00000239367 AQP1P29972 269 aa16.06■□□□□ 0.16
LRP11-201ENST00000239367 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
LRP11-201ENST00000239367 ARHGDIAP52565 204 aa16.06■□□□□ 0.16
LRP11-201ENST00000239367 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
LRP11-201ENST00000239367 IHHQ14623 411 aa16.06■□□□□ 0.16
LRP11-201ENST00000239367 BCL7AQ4VC05 210 aa16.06■□□□□ 0.16
LRP11-201ENST00000239367 XKR7Q5GH72 579 aa16.06■□□□□ 0.16
LRP11-201ENST00000239367 LAIR1Q6GTX8 287 aa16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.1 ms