RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000099538.5

Sumo3-202, Transcript of Small ubiquitin-related modifier 3, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sumo3, Length 1,874 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumo3-202ENSMUST00000099538 Zfp964B2RR88 472 aa14.6□□□□□ -0.07
Sumo3-202ENSMUST00000099538 Ankrd34aB2RW11 495 aa14.6□□□□□ -0.07
Sumo3-202ENSMUST00000099538 FanceB8JJD6 213 aa14.6□□□□□ -0.07
Sumo3-202ENSMUST00000099538 GmlE9PX31 176 aa14.6□□□□□ -0.07
Sumo3-202ENSMUST00000099538 Lrrc31F6VYM1 502 aa14.6□□□□□ -0.07
Sumo3-202ENSMUST00000099538 Il1rl1P14719 567 aa14.6□□□□□ -0.07
Sumo3-202ENSMUST00000099538 Gli1P47806 1111 aa14.6□□□□□ -0.07
Sumo3-202ENSMUST00000099538 Ddx6P54823 483 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
Sumo3-202ENSMUST00000099538 Cdh5P55284 784 aa14.6□□□□□ -0.07
Sumo3-202ENSMUST00000099538 NficP70255 439 aa14.6□□□□□ -0.07
Sumo3-202ENSMUST00000099538 ChatQ03059 641 aa14.6□□□□□ -0.07
Sumo3-202ENSMUST00000099538 Krt2Q3TTY5 707 aa14.6□□□□□ -0.07
Sumo3-202ENSMUST00000099538 Armc7Q3UJZ3 198 aa14.6□□□□□ -0.07
Sumo3-202ENSMUST00000099538 Rap1gap2Q5SVL6 712 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
Sumo3-202ENSMUST00000099538 FaddQ61160 205 aa14.6□□□□□ -0.07
Sumo3-202ENSMUST00000099538 Ddx51Q6P9R1 639 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
Sumo3-202ENSMUST00000099538 Proser3Q7TSA6 634 aa14.6□□□□□ -0.07
Sumo3-202ENSMUST00000099538 Teddm1aQ810U2 305 aa14.6□□□□□ -0.07
Sumo3-202ENSMUST00000099538 Zfp438Q8BFX2 798 aa14.6□□□□□ -0.07
Sumo3-202ENSMUST00000099538 Ifi44Q8BV66 422 aa14.6□□□□□ -0.07
Sumo3-202ENSMUST00000099538 Gpr22Q8BZL4 432 aa14.6□□□□□ -0.07
Sumo3-202ENSMUST00000099538 Rab36Q8CAM5 267 aa14.6□□□□□ -0.07
Sumo3-202ENSMUST00000099538 C1rbQ8CFG9 706 aa14.6□□□□□ -0.07
Sumo3-202ENSMUST00000099538 Mrps33Q9D2R8 106 aa14.6□□□□□ -0.07
Sumo3-202ENSMUST00000099538 Hm13Q9D8V0 378 aa14.6□□□□□ -0.07
Sumo3-202ENSMUST00000099538 Cyp4f14Q9EP75 524 aa14.6□□□□□ -0.07
Sumo3-202ENSMUST00000099538 Tas2r119Q9JKT2 335 aa14.6□□□□□ -0.07
Sumo3-202ENSMUST00000099538 RgrQ9Z2B3 291 aa14.6□□□□□ -0.07
Sumo3-202ENSMUST00000099538 Osbpl10S4R1M9 766 aa14.6□□□□□ -0.07
Sumo3-202ENSMUST00000099538 Gm28363A0A087WQW2 129 aa14.59□□□□□ -0.07
Sumo3-202ENSMUST00000099538 Olfr1480A0A140LIR8 359 aa14.59□□□□□ -0.07
Sumo3-202ENSMUST00000099538 L3mbtl1A2A5N8 826 aa14.59□□□□□ -0.07
Sumo3-202ENSMUST00000099538 Tcte1A6H639 498 aa14.59□□□□□ -0.07
Sumo3-202ENSMUST00000099538 Nipsnap3aB1AWZ3 247 aa14.59□□□□□ -0.07
Sumo3-202ENSMUST00000099538 Fam71f2B2RXB0 297 aa14.59□□□□□ -0.07
Sumo3-202ENSMUST00000099538 Kcnk4O88454 398 aa14.59□□□□□ -0.07
Sumo3-202ENSMUST00000099538 ZfrO88532 1074 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
Sumo3-202ENSMUST00000099538 Krt1P04104 637 aa14.59□□□□□ -0.07
Sumo3-202ENSMUST00000099538 Cdh1P09803 884 aa14.59□□□□□ -0.07
Sumo3-202ENSMUST00000099538 St14P56677 855 aa14.59□□□□□ -0.07
Sumo3-202ENSMUST00000099538 CdonQ32MD9 1250 aa14.59□□□□□ -0.07
Sumo3-202ENSMUST00000099538 Itga2Q62469 1178 aa14.59□□□□□ -0.07
Sumo3-202ENSMUST00000099538 Runx3Q64131 409 aa14.59□□□□□ -0.07
Sumo3-202ENSMUST00000099538 Fam167aQ6P1G6 215 aa14.59□□□□□ -0.07
Sumo3-202ENSMUST00000099538 Plekha6Q7TQG1 1173 aa14.59□□□□□ -0.07
Sumo3-202ENSMUST00000099538 Sec22cQ8BXT9 303 aa14.59□□□□□ -0.07
Sumo3-202ENSMUST00000099538 Eif3lQ8QZY1 564 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
Sumo3-202ENSMUST00000099538 Gramd1aQ8VEF1 722 aa14.59□□□□□ -0.07
Sumo3-202ENSMUST00000099538 Zswim1Q9CWV7 455 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
Sumo3-202ENSMUST00000099538 CutalQ9D1U5 156 aa14.59□□□□□ -0.07
Sumo3-202ENSMUST00000099538 Glipr1l1Q9DAG6 236 aa14.59□□□□□ -0.07
Sumo3-202ENSMUST00000099538 RpgrQ9R0X5 1001 aa14.59□□□□□ -0.07
Sumo3-202ENSMUST00000099538 Rfc2Q9WUK4 349 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
Sumo3-202ENSMUST00000099538 Mcm3apQ9WUU9 1971 aa14.59□□□□□ -0.07
Sumo3-202ENSMUST00000099538 Nt5c1aA3KFX0 365 aa14.59□□□□□ -0.07
Sumo3-202ENSMUST00000099538 Ccl26F8VQM2 93 aa14.59□□□□□ -0.07
Sumo3-202ENSMUST00000099538 Slc32a1O35633 525 aa14.59□□□□□ -0.07
Sumo3-202ENSMUST00000099538 AcrP23578 436 aa14.59□□□□□ -0.07
Sumo3-202ENSMUST00000099538 Pabpc1P29341 636 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
Sumo3-202ENSMUST00000099538 Akt1P31750 480 aa14.59□□□□□ -0.07
Sumo3-202ENSMUST00000099538 Nanos3P60324 178 aa14.59□□□□□ -0.07
Sumo3-202ENSMUST00000099538 EpycP70186 322 aa14.59□□□□□ -0.07
Sumo3-202ENSMUST00000099538 PamP97467 979 aa14.59□□□□□ -0.07
Sumo3-202ENSMUST00000099538 Aqp1Q02013 269 aa14.59□□□□□ -0.07
Sumo3-202ENSMUST00000099538 HdxQ14B70 692 aa14.59□□□□□ -0.07
Sumo3-202ENSMUST00000099538 Ermp1Q3UVK0 898 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
Sumo3-202ENSMUST00000099538 Cpa6Q5U901 438 aa14.59□□□□□ -0.07
Sumo3-202ENSMUST00000099538 Znf280cQ6P3Y5 742 aa14.59□□□□□ -0.07
Sumo3-202ENSMUST00000099538 Dcaf13Q6PAC3 445 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
Sumo3-202ENSMUST00000099538 Tas2r131Q7M708 310 aa14.59□□□□□ -0.07
Sumo3-202ENSMUST00000099538 CpmQ80V42 443 aa14.59□□□□□ -0.07
Sumo3-202ENSMUST00000099538 MtdhQ80WJ7 579 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
Sumo3-202ENSMUST00000099538 Sh3rf2Q8BZT2 735 aa14.59□□□□□ -0.07
Sumo3-202ENSMUST00000099538 Agbl3Q8CDP0 1006 aa14.59□□□□□ -0.07
Sumo3-202ENSMUST00000099538 Tbc1d14Q8CGA2 694 aa14.59□□□□□ -0.07
Sumo3-202ENSMUST00000099538 Coq6Q8R1S0 476 aa14.59□□□□□ -0.07
Sumo3-202ENSMUST00000099538 Znf639Q99KZ6 485 aa14.59□□□□□ -0.07
Sumo3-202ENSMUST00000099538 Dpy30Q99LT0 99 aa14.59□□□□□ -0.07
Sumo3-202ENSMUST00000099538 Haus5Q9D786 619 aa14.59□□□□□ -0.07
Sumo3-202ENSMUST00000099538 Rgs3Q9DC04 966 aa14.59□□□□□ -0.07
Sumo3-202ENSMUST00000099538 Olfr1153A2AVC0 318 aa14.58□□□□□ -0.08
Sumo3-202ENSMUST00000099538 Dlgap4B1AZP2 992 aa14.58□□□□□ -0.08
Sumo3-202ENSMUST00000099538 Gm4871D3Z0W7 314 aa14.58□□□□□ -0.08
Sumo3-202ENSMUST00000099538 Gm10718D3Z1I7 227 aa14.58□□□□□ -0.08
Sumo3-202ENSMUST00000099538 Ces2hF6Z9B9 558 aa14.58□□□□□ -0.08
Sumo3-202ENSMUST00000099538 Sypl1O09117 261 aa14.58□□□□□ -0.08
Sumo3-202ENSMUST00000099538 Dnmt3aO88508 908 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
Sumo3-202ENSMUST00000099538 Gnpda1O88958 289 aa14.58□□□□□ -0.08
Sumo3-202ENSMUST00000099538 Ckmt1P30275 418 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
Sumo3-202ENSMUST00000099538 Entpd1P55772 510 aa14.58□□□□□ -0.08
Sumo3-202ENSMUST00000099538 Rab33aP97950 237 aa14.58□□□□□ -0.08
Sumo3-202ENSMUST00000099538 DmwdQ08274 665 aa14.58□□□□□ -0.08
Sumo3-202ENSMUST00000099538 Zmym5Q3U2E2 627 aa14.58□□□□□ -0.08
Sumo3-202ENSMUST00000099538 MthfsdQ3URQ7 372 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
Sumo3-202ENSMUST00000099538 Usp22Q5DU02 525 aa14.58□□□□□ -0.08
Sumo3-202ENSMUST00000099538 Tfap2cQ61312 449 aa14.58□□□□□ -0.08
Sumo3-202ENSMUST00000099538 Ablim3Q69ZX8 682 aa14.58□□□□□ -0.08
Sumo3-202ENSMUST00000099538 Pfkfb4Q6DTY7 469 aa14.58□□□□□ -0.08
Sumo3-202ENSMUST00000099538 Atg16l2Q6KAU8 623 aa14.58□□□□□ -0.08
Sumo3-202ENSMUST00000099538 Amer3Q6NS69 780 aa14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 24.6 ms