RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000089378.4

Sh3bp1-203, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sh3bp1, Length 2,001 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pdia2D3Z6P0 527 aa20.63■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Vmn2r22E9Q7S8 853 aa20.63■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Etv4P28322 485 aa20.63■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ppp3ccP48455 513 aa20.63■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 NficP70255 439 aa20.63■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Fam47cQ14BE7 430 aa20.63■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Trim75Q3UWZ0 467 aa20.63■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ei24Q61070 340 aa20.63■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pfkfb4Q6DTY7 469 aa20.63■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Colgalt2Q6NVG7 625 aa20.63■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Defb14Q7TNV9 67 aa20.63■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Znf423Q80TS5 1292 aa20.63■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Arhgap19Q8BRH3 494 aa20.63■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rbbp5Q8BX09 538 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Treml1Q8K558 317 aa20.63■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Dlg2Q91XM9 852 aa20.63■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tspan1Q99J59 240 aa20.63■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Znf639Q99KZ6 485 aa20.63■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Dpy30Q99LT0 99 aa20.63■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 4921530L21RikQ9CQ47 274 aa20.63■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Idh3aQ9D6R2 366 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Fam43bA2AM80 330 aa20.62■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 FanceB8JJD6 213 aa20.62■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Entpd7Q3TCT4 606 aa20.62■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Fam129aQ3UW53 926 aa20.62■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Paqr3Q6TCG8 311 aa20.62■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cyp2r1Q6VVW9 501 aa20.62■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 MtdhQ80WJ7 579 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Atp6v1g3Q8BMC1 118 aa20.62■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Kctd5Q8VC57 234 aa20.62■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Efhd2Q9D8Y0 240 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr703Q9EPF5 319 aa20.62■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Adam21Q9JI76 729 aa20.62■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Dnajb2Q9QYI5 324 aa20.62■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 KcpQ3U492 1550 aa20.62■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Phf11A6H5X4 337 aa20.61■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Dlgap4B1AZP2 992 aa20.61■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ddx43D3Z6P9 646 aa20.61■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm10477F6SW83 55 aa20.61■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Chrm1P12657 460 aa20.61■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ptpn5P54830 541 aa20.61■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Akr1c6P70694 323 aa20.61■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Lpcat1Q3TFD2 534 aa20.61■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pgap2Q3TQR0 254 aa20.61■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Q6PAC4 1279 aa20.61■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 RimklaQ6PFX8 380 aa20.61■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Dtd2Q8BHA3 168 aa20.61■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Lancl3Q8CD19 420 aa20.61■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mettl22Q8R1C6 393 aa20.61■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ankrd61Q9CQM6 421 aa20.61■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tmbim6Q9D2C7 237 aa20.61■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cyp2c55Q9D816 490 aa20.61■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Aldh7a1Q9DBF1 539 aa20.61■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Fam13cQ9DBR2 601 aa20.61■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Zbtb18Q9WUK6 522 aa20.61■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Clic1Q9Z1Q5 241 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Eml5Q8BQM8 1977 aa20.61■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 IsxA1A546 240 aa20.61■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm16494E9Q2Z4 87 aa20.61■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Speer4cG3UXD1 256 aa20.61■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm10354K7N6A0 256 aa20.61■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Vmn2r112L7N221 857 aa20.61■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pdlim1O70400 327 aa20.61■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gria2P23819 883 aa20.61■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Snrpd1P62315 119 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tuba1cP68373 449 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cep295nlQ497N6 533 aa20.61■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rnf215Q5SPX3 379 aa20.61■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Wdr74Q8VCG3 384 aa20.61■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Elmod3Q91YP6 381 aa20.61■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Zswim1Q9CWV7 455 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ppil1Q9D0W5 166 aa20.61■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ribc2Q9D4Q1 309 aa20.61■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cntd1Q9D995 334 aa20.61■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tuba8Q9JJZ2 449 aa20.61■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 DguokQ9QX60 277 aa20.61■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Kcnk4O88454 398 aa20.6■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Sh3pxd2aO89032 1124 aa20.6■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Klf10O89091 479 aa20.6■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Hoxa4P06798 285 aa20.6■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Surf2P09926 257 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gstm1P10649 218 aa20.6■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Csf2rbP26955 896 aa20.6■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 ClgnP52194 611 aa20.6■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Fitm2P59266 262 aa20.6■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 EpycP70186 322 aa20.6■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Psme2P97372 239 aa20.6■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mmp11Q02853 492 aa20.6■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Naf1Q3UMQ8 489 aa20.6■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 G2e3Q5RJY2 716 aa20.6■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Sox17Q61473 419 aa20.6■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rps9Q6ZWN5 194 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Sdr16c5Q7TQA3 309 aa20.6■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Galnt7Q80VA0 657 aa20.6■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Casp9Q8C3Q9 454 aa20.6■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Nudt13Q8JZU0 352 aa20.6■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pcdhga9Q91XX9 932 aa20.6■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Il23aQ9EQ14 196 aa20.6■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ninj2Q9JL89 143 aa20.6■□□□□ 0.89
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Epb41l1Q9Z2H5 879 aa20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 38.1 ms