Protein–RNA interactions for Protein: O89091

Klf10, Krueppel-like factor 10, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf10O89091 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Klf10O89091 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
Klf10O89091 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
Klf10O89091 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Klf10O89091 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
Klf10O89091 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Klf10O89091 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Klf10O89091 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Klf10O89091 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Klf10O89091 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Klf10O89091 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Klf10O89091 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Klf10O89091 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Klf10O89091 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Klf10O89091 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Klf10O89091 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Klf10O89091 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Klf10O89091 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Klf10O89091 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Klf10O89091 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Klf10O89091 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Klf10O89091 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Klf10O89091 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Klf10O89091 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Klf10O89091 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Klf10O89091 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Klf10O89091 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Klf10O89091 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Klf10O89091 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Klf10O89091 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Klf10O89091 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Klf10O89091 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Klf10O89091 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Klf10O89091 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Klf10O89091 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Klf10O89091 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Klf10O89091 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Klf10O89091 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Klf10O89091 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Klf10O89091 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Klf10O89091 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Klf10O89091 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Klf10O89091 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Klf10O89091 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Klf10O89091 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Klf10O89091 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Klf10O89091 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Klf10O89091 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Klf10O89091 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Klf10O89091 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Klf10O89091 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Klf10O89091 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Klf10O89091 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Klf10O89091 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Klf10O89091 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Klf10O89091 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Klf10O89091 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Klf10O89091 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Klf10O89091 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Klf10O89091 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Klf10O89091 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Klf10O89091 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Klf10O89091 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Klf10O89091 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Klf10O89091 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Klf10O89091 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Klf10O89091 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Klf10O89091 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Klf10O89091 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Klf10O89091 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Klf10O89091 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Klf10O89091 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Klf10O89091 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Klf10O89091 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Klf10O89091 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Klf10O89091 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Klf10O89091 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Klf10O89091 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Klf10O89091 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Klf10O89091 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Klf10O89091 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Klf10O89091 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Klf10O89091 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Klf10O89091 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Klf10O89091 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Klf10O89091 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Klf10O89091 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Klf10O89091 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Klf10O89091 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Klf10O89091 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Klf10O89091 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Klf10O89091 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Klf10O89091 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Klf10O89091 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Klf10O89091 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Klf10O89091 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Klf10O89091 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Klf10O89091 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Klf10O89091 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Klf10O89091 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.9 ms