RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000053414.12

Ccdc171-201, Transcript of Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

APPRIS P2 TSL 5 BASIC

Gene Ccdc171, Length 4,525 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Exosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171-201ENSMUST00000053414 Olfr1015Q7TR94 312 aa9□□□□□ -0.97
Ccdc171-201ENSMUST00000053414 FicdQ8BIX9 458 aa9□□□□□ -0.97
Ccdc171-201ENSMUST00000053414 Abhd4Q8VD66 342 aa9□□□□□ -0.97
Ccdc171-201ENSMUST00000053414 Asb6Q91ZU1 418 aa9□□□□□ -0.97
Ccdc171-201ENSMUST00000053414 Tspan11Q9D1D1 253 aa9□□□□□ -0.97
Ccdc171-201ENSMUST00000053414 Stx12Q9ER00 274 aa9□□□□□ -0.97
Ccdc171-201ENSMUST00000053414 Pcdh15Q99PJ1 1943 aa9□□□□□ -0.97
Ccdc171-201ENSMUST00000053414 Zfp973A2BE20 318 aa9□□□□□ -0.97
Ccdc171-201ENSMUST00000053414 Cops5O35864 334 aa9□□□□□ -0.97
Ccdc171-201ENSMUST00000053414 Ldb2O55203 373 aa9□□□□□ -0.97
Ccdc171-201ENSMUST00000053414 Cer1O55233 272 aa9□□□□□ -0.97
Ccdc171-201ENSMUST00000053414 Rpl10lP86048 214 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
Ccdc171-201ENSMUST00000053414 Wbp1P97764 304 aa9□□□□□ -0.97
Ccdc171-201ENSMUST00000053414 FhP97807 507 aa9□□□□□ -0.97
Ccdc171-201ENSMUST00000053414 Mxd4Q60948 209 aa9□□□□□ -0.97
Ccdc171-201ENSMUST00000053414 Dalrd3Q6PJN8 538 aa9□□□□□ -0.97
Ccdc171-201ENSMUST00000053414 PdprQ7TSQ8 878 aa9□□□□□ -0.97
Ccdc171-201ENSMUST00000053414 Timd2Q8R183 305 aa9□□□□□ -0.97
Ccdc171-201ENSMUST00000053414 Q91V76 315 aa9□□□□□ -0.97
Ccdc171-201ENSMUST00000053414 PgcQ9D7R7 392 aa9□□□□□ -0.97
Ccdc171-201ENSMUST00000053414 Jam2Q9JI59 298 aa9□□□□□ -0.97
Ccdc171-201ENSMUST00000053414 Nectin3Q9JLB9 549 aa9□□□□□ -0.97
Ccdc171-201ENSMUST00000053414 Mtmr7Q9Z2C9 660 aa9□□□□□ -0.97
Ccdc171-201ENSMUST00000053414 Olfr288E9Q1P2 318 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc171-201ENSMUST00000053414 H2-T24F8VQG4 363 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc171-201ENSMUST00000053414 Shisa8J3QNX5 399 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc171-201ENSMUST00000053414 Klk1b16P04071 261 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc171-201ENSMUST00000053414 Clcn3P51791 818 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc171-201ENSMUST00000053414 Gbx1P82976 418 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc171-201ENSMUST00000053414 Hp1bp3Q3TEA8 554 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
Ccdc171-201ENSMUST00000053414 Clca4bQ3UW98 925 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc171-201ENSMUST00000053414 Dcdc2Q5DU00 475 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc171-201ENSMUST00000053414 Sohlh1Q6IUP1 357 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc171-201ENSMUST00000053414 Kif18bQ6PFD6 834 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc171-201ENSMUST00000053414 Ubtd2Q6PGH0 234 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc171-201ENSMUST00000053414 Wscd1Q80XH4 572 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc171-201ENSMUST00000053414 Pcid2Q8BFV2 399 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
Ccdc171-201ENSMUST00000053414 Elmo2Q8BHL5 732 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc171-201ENSMUST00000053414 Hmbox1Q8BJA3 419 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc171-201ENSMUST00000053414 Cadm2Q8BLQ9 435 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc171-201ENSMUST00000053414 C1qtnf7Q8BVD7 289 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc171-201ENSMUST00000053414 Ppp4r4Q8C0Y0 875 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc171-201ENSMUST00000053414 Gabarapl1Q8R3R8 117 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc171-201ENSMUST00000053414 Ca9Q8VHB5 437 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc171-201ENSMUST00000053414 Asb7Q91ZU0 318 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc171-201ENSMUST00000053414 Rab30Q923S9 203 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc171-201ENSMUST00000053414 Cacng4Q9JJV4 327 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc171-201ENSMUST00000053414 Obsl1D3YYU8 1804 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
Ccdc171-201ENSMUST00000053414 E2f3O35261 457 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc171-201ENSMUST00000053414 Dsg3O35902 993 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc171-201ENSMUST00000053414 Gtf2h4O70422 463 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
Ccdc171-201ENSMUST00000053414 Eml4Q3UMY5 988 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc171-201ENSMUST00000053414 IspdQ5RJG7 447 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc171-201ENSMUST00000053414 Efr3aQ8BG67 819 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc171-201ENSMUST00000053414 Klhl26Q8BGY4 606 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc171-201ENSMUST00000053414 Lig4Q8BTF7 911 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc171-201ENSMUST00000053414 CcsapQ8QZT2 252 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc171-201ENSMUST00000053414 Ugt2b1Q8R084 529 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc171-201ENSMUST00000053414 Tctn3Q8R2Q6 595 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc171-201ENSMUST00000053414 Olfr850Q8VFF2 315 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc171-201ENSMUST00000053414 AclyQ91V92 1091 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
Ccdc171-201ENSMUST00000053414 Themis3Q9CU24 569 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc171-201ENSMUST00000053414 Pou5f2Q9DAC9 329 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc171-201ENSMUST00000053414 Trpv4Q9EPK8 871 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc171-201ENSMUST00000053414 Cyp2g1Q9WV19 494 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc171-201ENSMUST00000053414 ReckQ9Z0J1 971 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc171-201ENSMUST00000053414 DnpepQ9Z2W0 473 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc171-201ENSMUST00000053414 Xkr6E9Q6C8 638 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc171-201ENSMUST00000053414 Slc9a3G3X939 829 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc171-201ENSMUST00000053414 Znf703P0CL69 594 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc171-201ENSMUST00000053414 Acvr1P37172 509 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc171-201ENSMUST00000053414 FpgsP48760 587 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc171-201ENSMUST00000053414 Pcyt1aP49586 367 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc171-201ENSMUST00000053414 Rplp2P99027 115 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
Ccdc171-201ENSMUST00000053414 Dact3Q0PHV7 610 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc171-201ENSMUST00000053414 Pnpla5Q32LZ8 432 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc171-201ENSMUST00000053414 Tmem253Q3UNB8 204 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc171-201ENSMUST00000053414 Zfp868Q3UTQ6 422 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc171-201ENSMUST00000053414 Krt76Q3UV17 594 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
Ccdc171-201ENSMUST00000053414 Rcn3Q8BH97 328 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc171-201ENSMUST00000053414 Olfr330Q8VGD9 315 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc171-201ENSMUST00000053414 Pcdhb17Q91VD8 799 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc171-201ENSMUST00000053414 Tsc22d3Q9Z2S7 137 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc171-201ENSMUST00000053414 PtprdQ64487 1912 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc171-201ENSMUST00000053414 1700025B11RikA0A087WNZ6 93 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc171-201ENSMUST00000053414 Itga8A2ARA8 1062 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc171-201ENSMUST00000053414 Tgm7A2ART8 616 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc171-201ENSMUST00000053414 PotegA5H0M4 473 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc171-201ENSMUST00000053414 Pnldc1B2RXZ1 531 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc171-201ENSMUST00000053414 Zfp938E9Q9G3 579 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc171-201ENSMUST00000053414 Gm3138K7N754 218 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc171-201ENSMUST00000053414 Cst3P21460 140 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc171-201ENSMUST00000053414 Crybb2P62696 205 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc171-201ENSMUST00000053414 PrkczQ02956 592 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc171-201ENSMUST00000053414 Slc6a3Q61327 619 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc171-201ENSMUST00000053414 Rftn1Q6A0D4 554 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc171-201ENSMUST00000053414 Rpf1Q7TND5 349 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
Ccdc171-201ENSMUST00000053414 Slc6a15Q8BG16 729 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc171-201ENSMUST00000053414 Lrrc8dQ8BGR2 859 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc171-201ENSMUST00000053414 Gm4922Q8C0N0 497 aa8.99□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 34.7 ms