RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000037117.5

Gtf3c4-201, Transcript of General transcription factor 3C polypeptide 4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gtf3c4, Length 6,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 DiabloQ9JIQ3 237 aa11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Ube2ql1A0PJN4 161 aa11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Klrk1O54709 232 aa11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 JunP05627 334 aa11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 DcnP28654 354 aa11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Psen1P49769 467 aa11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Fbxo31Q3TQF0 507 aa11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Nr1d2Q60674 576 aa11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Znf821Q6PD05 413 aa11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Carns1Q6ZPS2 827 aa11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 AasdhQ80WC9 1100 aa11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Mup21Q80YX8 181 aa11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Slc15a5Q8CBB2 566 aa11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 McatQ8R3F5 381 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Slc44a3Q921V7 656 aa11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Ssxb1Q9CPU1 170 aa11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Cnot11Q9CWN7 505 aa11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Mgat4dQ9D4R2 373 aa11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 HemgnQ9ERZ0 503 aa11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Zfp605E9QAH2 694 aa11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Hax1O35387 280 aa11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Gdf6P43028 454 aa11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Commd4Q9CQ02 199 aa11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Gm43518A0A0G2JGB6 165 aa11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Klhl15A2AAX3 604 aa11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 4931406B18RikA2RSL7 367 aa11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Mid1O70583 680 aa11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 ProcP33587 460 aa11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Acss3Q14DH7 682 aa11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Tmem102Q3UPR7 509 aa11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Gas6Q61592 674 aa11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 FukQ7TMC8 1090 aa11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Kctd9Q80UN1 339 aa11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Sox30Q8CGW4 782 aa11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Mcoln2Q8K595 566 aa11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Rab4bQ91ZR1 213 aa11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Cryl1Q99KP3 319 aa11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Spatc1lQ9D9W0 342 aa11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 PpigA2AR02 752 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Kansl3A2RSY1 903 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Clca3bE9PUL3 1044 aa11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 2610021A01RikE9Q0Q3 834 aa11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Hmox2O70252 315 aa11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Rab17P35292 214 aa11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Zdhhc9P59268 364 aa11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Fv1P70213 459 aa11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Cnep1r1Q3UJ81 125 aa11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Rdh12Q8BYK4 316 aa11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Olfr1346Q8VGH6 313 aa11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Cypt12Q9DAR6 119 aa11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Atp6v1g2Q9WTT4 118 aa11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 CluhQ5SW19 1315 aa11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Pik3c2bE9QAN8 1632 aa11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Ms4a4aA0A087WRT7 236 aa11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Gm4756A0A140LIS8 335 aa11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Cd4P06332 457 aa11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Irf2P23906 349 aa11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 BC100530Q497J0 97 aa11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 R3hdm4Q4VBF2 262 aa11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Orm1Q60590 207 aa11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Pik3c3Q6PF93 887 aa11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 EndovQ8C9A2 338 aa11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 KmoQ91WN4 479 aa11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Mospd2Q9CWP6 518 aa11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Tvp23bQ9D8T4 205 aa11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Wnt8bQ9WUD6 350 aa11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Hsbp1l1B2RXB2 72 aa11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Gm10036E9PYL9 178 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Gm42421F6X8D5 166 aa11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Dhx15O35286 795 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Rc3h2P0C090 1187 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Q3UUX7 111 aa11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Taar7dQ5QD10 358 aa11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Lrrc1Q80VQ1 524 aa11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Ints6lQ8BND4 861 aa11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Sh3rf3Q8C120 878 aa11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 MmaaQ8C7H1 415 aa11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Ugt3a2Q8JZZ0 523 aa11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Asb15Q8VHS6 583 aa11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Tmem150aQ91WN2 271 aa11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Hint2Q9D0S9 163 aa11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Lcn9Q9D267 178 aa11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Tmem43Q9DBS1 400 aa11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Pard6gQ9JK84 382 aa11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 GakQ99KY4 1305 aa11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Vmn2r85G3UW56 850 aa11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Gm6526G3X9Q9 198 aa11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 ChrneP20782 493 aa11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Gcm1P70348 436 aa11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Xlr4cQ3TKR2 215 aa11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Als2clQ60I26 952 aa11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Papd7Q6PB75 542 aa11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 JamlQ80UL9 379 aa11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Cyp20a1Q8BKE6 462 aa11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Chrnb3Q8BMN3 464 aa11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Tmed4Q8R1V4 227 aa11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Tmem203Q8R235 136 aa11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Gkn2Q9CQS6 184 aa11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Xlr4bQ9JJQ7 215 aa11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 Cry2Q9R194 592 aa11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 30.2 ms