RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 TREX1Q9NSU2 369 aa23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1-216ENST00000628306 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1-216ENST00000628306 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1-216ENST00000628306 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1-216ENST00000628306 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1-216ENST00000628306 MROH6A6NGR9 719 aa23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-216ENST00000628306 A8MU76 341 aa23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-216ENST00000628306 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-216ENST00000628306 KRT38O76015 456 aa23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-216ENST00000628306 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-216ENST00000628306 GP1BBP13224 206 aa23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-216ENST00000628306 PAMP19021 973 aa23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-216ENST00000628306 PSMA3P25788 255 aa23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-216ENST00000628306 RPL26P61254 145 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-216ENST00000628306 PCSK7Q16549 785 aa23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-216ENST00000628306 SIRPB2Q5JXA9 342 aa23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-216ENST00000628306 SNAP47Q5SQN1 464 aa23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-216ENST00000628306 ARMC12Q5T9G4 340 aa23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-216ENST00000628306 TIFABQ6ZNK6 161 aa23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-216ENST00000628306 CTAGE3PQ8IX95 158 aa23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-216ENST00000628306 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-216ENST00000628306 OR10G6Q8NH81 332 aa23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC38A3Q99624 504 aa23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-216ENST00000628306 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-216ENST00000628306 ADGRE3Q9BY15 652 aa23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-216ENST00000628306 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-216ENST00000628306 TBC1D29Q9UFV1 150 aa23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-216ENST00000628306 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-216ENST00000628306 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-216ENST00000628306 KRT15P19012 456 aa23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-216ENST00000628306 F8A1P23610 371 aa23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-216ENST00000628306 STC1P52823 247 aa23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-216ENST00000628306 ABHD18Q0P651 414 aa23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-216ENST00000628306 LRP8Q14114 963 aa23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-216ENST00000628306 TMED2Q15363 201 aa23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-216ENST00000628306 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-216ENST00000628306 USP45Q70EL2 814 aa23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-216ENST00000628306 BRSK1Q8TDC3 778 aa23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-216ENST00000628306 MFSD3Q96ES6 412 aa23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-216ENST00000628306 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-216ENST00000628306 C19orf43Q9BQ61 176 aa23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-216ENST00000628306 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-216ENST00000628306 TBK1Q9UHD2 729 aa23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-216ENST00000628306 PRKAB1Q9Y478 270 aa23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-216ENST00000628306 STK17BO94768 372 aa23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-216ENST00000628306 PRLP01236 227 aa23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-216ENST00000628306 CHRNA4P43681 627 aa23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-216ENST00000628306 HHEXQ03014 270 aa23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-216ENST00000628306 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP23.62■■□□□ 1.374e-8■■■■■ 41.9
CAPNS1-216ENST00000628306 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-216ENST00000628306 GRTP1Q5TC63 336 aa23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-216ENST00000628306 IYDQ6PHW0 289 aa23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-216ENST00000628306 GALNT13Q8IUC8 556 aa23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-216ENST00000628306 CNTN4Q8IWV2 1026 aa23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-216ENST00000628306 LMNTD2Q8IXW0 634 aa23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-216ENST00000628306 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-216ENST00000628306 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-216ENST00000628306 CPNE1Q99829 537 aa23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-216ENST00000628306 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-216ENST00000628306 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-216ENST00000628306 A0A0J9YYE9 177 aa23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-216ENST00000628306 K7EM74 188 aa23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-216ENST00000628306 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP23.61■■□□□ 1.375e-9■□□□□ 8.4
CAPNS1-216ENST00000628306 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-216ENST00000628306 TRBC1P01850 177 aa23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-216ENST00000628306 NMBRP28336 390 aa23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-216ENST00000628306 HPDP32754 393 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-216ENST00000628306 MDH1P40925 334 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-216ENST00000628306 STAT5AP42229 794 aa23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-216ENST00000628306 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-216ENST00000628306 GYS2P54840 703 aa23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-216ENST00000628306 ACVR1Q04771 509 aa23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-216ENST00000628306 POU6F1Q14863 301 aa23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-216ENST00000628306 DEFB109BQ30KR1 87 aa23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-216ENST00000628306 TSTD2Q5T7W7 516 aa23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-216ENST00000628306 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-216ENST00000628306 CEACAM20Q6UY09 585 aa23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-216ENST00000628306 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-216ENST00000628306 STARD8Q92502 1023 aa23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-216ENST00000628306 MIB2Q96AX9 1013 aa23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-216ENST00000628306 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-216ENST00000628306 ZPBPQ9BS86 351 aa23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-216ENST00000628306 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-216ENST00000628306 ZFATQ9P243 1243 aa23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-216ENST00000628306 INPP4BO15327 924 aa23.6■■□□□ 1.37
CAPNS1-216ENST00000628306 BRAFP15056 766 aa23.6■■□□□ 1.37
CAPNS1-216ENST00000628306 NFKBIAP25963 317 aa23.6■■□□□ 1.37
CAPNS1-216ENST00000628306 GP5P40197 560 aa23.6■■□□□ 1.37
CAPNS1-216ENST00000628306 NFATC2Q13469 925 aa23.6■■□□□ 1.37
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC25A41Q8N5S1 370 aa23.6■■□□□ 1.37
CAPNS1-216ENST00000628306 NCSTNQ92542 709 aa23.6■■□□□ 1.37
CAPNS1-216ENST00000628306 SMC6Q96SB8 1091 aa23.6■■□□□ 1.37
CAPNS1-216ENST00000628306 CAPS2Q9BXY5 557 aa23.6■■□□□ 1.37
CAPNS1-216ENST00000628306 TRABDQ9H4I3 376 aa23.6■■□□□ 1.37
CAPNS1-216ENST00000628306 HACD3Q9P035 362 aa23.6■■□□□ 1.37
CAPNS1-216ENST00000628306 MT-ND3P03897 115 aa23.59■■□□□ 1.37
CAPNS1-216ENST00000628306 NTRK1P04629 796 aa23.59■■□□□ 1.37
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF30P17039 623 aa23.59■■□□□ 1.37
CAPNS1-216ENST00000628306 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
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