RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602495.1

XIST-208, X inactive specific transcript, humanhuman

TSL 4

Gene XIST, Length 827 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIST-208ENST00000602495 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa7.13□□□□□ -1.27
XIST-208ENST00000602495 HEXDCQ8WVB3 486 aa7.13□□□□□ -1.27
XIST-208ENST00000602495 LCN9Q8WX39 176 aa7.13□□□□□ -1.27
XIST-208ENST00000602495 CPT1BQ92523 772 aa7.13□□□□□ -1.27
XIST-208ENST00000602495 ULK4Q96C45 1275 aa7.13□□□□□ -1.27
XIST-208ENST00000602495 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
XIST-208ENST00000602495 COPS8Q99627 209 aa7.13□□□□□ -1.27
XIST-208ENST00000602495 NRTNQ99748 197 aa7.13□□□□□ -1.27
XIST-208ENST00000602495 C19orf43Q9BQ61 176 aa7.13□□□□□ -1.27
XIST-208ENST00000602495 APOL2Q9BQE5 337 aa7.13□□□□□ -1.27
XIST-208ENST00000602495 SLC25A23Q9BV35 468 aa7.13□□□□□ -1.27
XIST-208ENST00000602495 FSD1LQ9BXM9 530 aa7.13□□□□□ -1.27
XIST-208ENST00000602495 NLNQ9BYT8 704 aa7.13□□□□□ -1.27
XIST-208ENST00000602495 GBA3Q9H227 469 aa7.13□□□□□ -1.27
XIST-208ENST00000602495 SRMSQ9H3Y6 488 aa7.13□□□□□ -1.27
XIST-208ENST00000602495 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
XIST-208ENST00000602495 ZFAND3Q9H8U3 227 aa7.13□□□□□ -1.27
XIST-208ENST00000602495 ARNT2Q9HBZ2 717 aa7.13□□□□□ -1.27
XIST-208ENST00000602495 SYTL2Q9HCH5 934 aa7.13□□□□□ -1.27
XIST-208ENST00000602495 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa7.13□□□□□ -1.27
XIST-208ENST00000602495 ACSS2Q9NR19 701 aa7.13□□□□□ -1.27
XIST-208ENST00000602495 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa7.13□□□□□ -1.27
XIST-208ENST00000602495 FAM8A1Q9UBU6 413 aa7.13□□□□□ -1.27
XIST-208ENST00000602495 SERTAD3Q9UJW9 196 aa7.13□□□□□ -1.27
XIST-208ENST00000602495 POMT2Q9UKY4 750 aa7.13□□□□□ -1.27
XIST-208ENST00000602495 TCFL5Q9UL49 500 aa7.13□□□□□ -1.27
XIST-208ENST00000602495 VPS4AQ9UN37 437 aa7.13□□□□□ -1.27
XIST-208ENST00000602495 EFR3BQ9Y2G0 817 aa7.13□□□□□ -1.27
XIST-208ENST00000602495 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP7.13□□□□□ -1.27
XIST-208ENST00000602495 HRH3Q9Y5N1 445 aa7.13□□□□□ -1.27
XIST-208ENST00000602495 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa7.13□□□□□ -1.27
XIST-208ENST00000602495 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa7.12□□□□□ -1.27
XIST-208ENST00000602495 CDK2AP1O14519 115 aa7.12□□□□□ -1.27
XIST-208ENST00000602495 ZNF185O15231 689 aa7.12□□□□□ -1.27
XIST-208ENST00000602495 KCNN4O15554 427 aa7.12□□□□□ -1.27
XIST-208ENST00000602495 LDB2O43679 373 aa7.12□□□□□ -1.27
XIST-208ENST00000602495 ICMTO60725 284 aa7.12□□□□□ -1.27
XIST-208ENST00000602495 SLC35G4P0C7Q5 338 aa7.12□□□□□ -1.27
XIST-208ENST00000602495 MSL3P1P0C860 447 aa7.12□□□□□ -1.27
XIST-208ENST00000602495 RBP3P10745 1247 aa7.12□□□□□ -1.27
XIST-208ENST00000602495 ST6GAL1P15907 406 aa7.12□□□□□ -1.27
XIST-208ENST00000602495 PTMSP20962 102 aa7.12□□□□□ -1.27
XIST-208ENST00000602495 CDH3P22223 829 aa7.12□□□□□ -1.27
XIST-208ENST00000602495 GNLYP22749 145 aa7.12□□□□□ -1.27
XIST-208ENST00000602495 PSMB4P28070 264 aa7.12□□□□□ -1.27
XIST-208ENST00000602495 PDHA2P29803 388 aa7.12□□□□□ -1.27
XIST-208ENST00000602495 HADHAP40939 763 aa7.12□□□□□ -1.27
XIST-208ENST00000602495 PREPP48147 710 aa7.12□□□□□ -1.27
XIST-208ENST00000602495 PRLHRP49683 370 aa7.12□□□□□ -1.27
XIST-208ENST00000602495 ITGA1P56199 1179 aa7.12□□□□□ -1.27
XIST-208ENST00000602495 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
XIST-208ENST00000602495 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
XIST-208ENST00000602495 CHAF1BQ13112 559 aa7.12□□□□□ -1.27
XIST-208ENST00000602495 PRKG2Q13237 762 aa7.12□□□□□ -1.27
XIST-208ENST00000602495 GPR33Q49SQ1 333 aa7.12□□□□□ -1.27
XIST-208ENST00000602495 ZNF789Q5FWF6 425 aa7.12□□□□□ -1.27
XIST-208ENST00000602495 CCDC181Q5TID7 509 aa7.12□□□□□ -1.27
XIST-208ENST00000602495 FAM69BQ5VUD6 431 aa7.12□□□□□ -1.27
XIST-208ENST00000602495 CPZQ66K79 652 aa7.12□□□□□ -1.27
XIST-208ENST00000602495 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
XIST-208ENST00000602495 SERPINA9Q86WD7 417 aa7.12□□□□□ -1.27
XIST-208ENST00000602495 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa7.12□□□□□ -1.27
XIST-208ENST00000602495 CCDC170Q8IYT3 715 aa7.12□□□□□ -1.27
XIST-208ENST00000602495 NXPE1Q8N323 547 aa7.12□□□□□ -1.27
XIST-208ENST00000602495 ZBTB2Q8N680 514 aa7.12□□□□□ -1.27
XIST-208ENST00000602495 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
XIST-208ENST00000602495 TC2NQ8N9U0 490 aa7.12□□□□□ -1.27
XIST-208ENST00000602495 GLIS1Q8NBF1 620 aa7.12□□□□□ -1.27
XIST-208ENST00000602495 GALNT11Q8NCW6 608 aa7.12□□□□□ -1.27
XIST-208ENST00000602495 RNF214Q8ND24 703 aa7.12□□□□□ -1.27
XIST-208ENST00000602495 CCDC110Q8TBZ0 833 aa7.12□□□□□ -1.27
XIST-208ENST00000602495 CPT1CQ8TCG5 803 aa7.12□□□□□ -1.27
XIST-208ENST00000602495 HM13Q8TCT9 377 aa7.12□□□□□ -1.27
XIST-208ENST00000602495 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
XIST-208ENST00000602495 CLIP3Q96DZ5 547 aa7.12□□□□□ -1.27
XIST-208ENST00000602495 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa7.12□□□□□ -1.27
XIST-208ENST00000602495 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa7.12□□□□□ -1.27
XIST-208ENST00000602495 FERMT1Q9BQL6 677 aa7.12□□□□□ -1.27
XIST-208ENST00000602495 TLR10Q9BXR5 811 aa7.12□□□□□ -1.27
XIST-208ENST00000602495 OSBPL8Q9BZF1 889 aa7.12□□□□□ -1.27
XIST-208ENST00000602495 OR52A5Q9H2C5 316 aa7.12□□□□□ -1.27
XIST-208ENST00000602495 MVB12BQ9H7P6 319 aa7.12□□□□□ -1.27
XIST-208ENST00000602495 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
XIST-208ENST00000602495 PCMTD2Q9NV79 361 aa7.12□□□□□ -1.27
XIST-208ENST00000602495 SOHLH2Q9NX45 425 aa7.12□□□□□ -1.27
XIST-208ENST00000602495 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
XIST-208ENST00000602495 CRLS1Q9UJA2 301 aa7.12□□□□□ -1.27
XIST-208ENST00000602495 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa7.12□□□□□ -1.27
XIST-208ENST00000602495 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa7.12□□□□□ -1.27
XIST-208ENST00000602495 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
XIST-208ENST00000602495 DUSP10Q9Y6W6 482 aa7.12□□□□□ -1.27
XIST-208ENST00000602495 NOTCH2Q04721 2471 aa7.12□□□□□ -1.27
XIST-208ENST00000602495 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
XIST-208ENST00000602495 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa7.11□□□□□ -1.27
XIST-208ENST00000602495 GSAPA4D1B5 854 aa7.11□□□□□ -1.27
XIST-208ENST00000602495 A6NL46 340 aa7.11□□□□□ -1.27
XIST-208ENST00000602495 H7C0S8 307 aa7.11□□□□□ -1.27
XIST-208ENST00000602495 MATN2O00339 956 aa7.11□□□□□ -1.27
XIST-208ENST00000602495 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
XIST-208ENST00000602495 BTN3A1O00481 513 aa7.11□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.5 ms