RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538616.1

CD27-AS1-208, CD27 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene CD27-AS1, Length 657 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27-AS1-208ENST00000538616 C4orf22Q6V702 233 aa18.75■□□□□ 0.59
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CD27-AS1-208ENST00000538616 SHANK1Q9Y566 2161 aa18.74■□□□□ 0.59
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CD27-AS1-208ENST00000538616 OR1I1O60431 355 aa18.73■□□□□ 0.59
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CD27-AS1-208ENST00000538616 SLC35G4P0C7Q5 338 aa18.73■□□□□ 0.59
CD27-AS1-208ENST00000538616 MGAT1P26572 445 aa18.73■□□□□ 0.59
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CD27-AS1-208ENST00000538616 PPP1CAP62136 330 aa18.73■□□□□ 0.59
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CD27-AS1-208ENST00000538616 LAMB3Q13751 1172 aa18.73■□□□□ 0.59
CD27-AS1-208ENST00000538616 SEMA3AQ14563 771 aa18.73■□□□□ 0.59
CD27-AS1-208ENST00000538616 IL11RAQ14626 422 aa18.73■□□□□ 0.59
CD27-AS1-208ENST00000538616 NADK2Q4G0N4 442 aa18.73■□□□□ 0.59
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CD27-AS1-208ENST00000538616 AFTPHQ6ULP2 937 aa18.73■□□□□ 0.59
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CD27-AS1-208ENST00000538616 CYP1B1Q16678 543 aa18.72■□□□□ 0.59
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CD27-AS1-208ENST00000538616 PCID2Q5JVF3 399 aa18.72■□□□□ 0.59
CD27-AS1-208ENST00000538616 ANKRD22Q5VYY1 191 aa18.72■□□□□ 0.59
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CD27-AS1-208ENST00000538616 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
CD27-AS1-208ENST00000538616 TMEM135Q86UB9 458 aa18.72■□□□□ 0.59
CD27-AS1-208ENST00000538616 GALNT6Q8NCL4 622 aa18.72■□□□□ 0.59
CD27-AS1-208ENST00000538616 OR4L1Q8NH43 312 aa18.72■□□□□ 0.59
CD27-AS1-208ENST00000538616 C9orf72Q96LT7 481 aa18.72■□□□□ 0.59
CD27-AS1-208ENST00000538616 MLXIPLQ9NP71 852 aa18.72■□□□□ 0.59
CD27-AS1-208ENST00000538616 SYBUQ9NX95 663 aa18.72■□□□□ 0.59
CD27-AS1-208ENST00000538616 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
CD27-AS1-208ENST00000538616 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa18.72■□□□□ 0.59
CD27-AS1-208ENST00000538616 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa18.71■□□□□ 0.59
CD27-AS1-208ENST00000538616 KLHL33A6NCF5 533 aa18.71■□□□□ 0.59
CD27-AS1-208ENST00000538616 C21orf140B9A014 251 aa18.71■□□□□ 0.59
CD27-AS1-208ENST00000538616 AVILO75366 819 aa18.71■□□□□ 0.59
CD27-AS1-208ENST00000538616 DNAJB5O75953 348 aa18.71■□□□□ 0.59
CD27-AS1-208ENST00000538616 MT-ND3P03897 115 aa18.71■□□□□ 0.59
CD27-AS1-208ENST00000538616 NSG1P42857 185 aa18.71■□□□□ 0.59
CD27-AS1-208ENST00000538616 NPY2RP49146 381 aa18.71■□□□□ 0.59
CD27-AS1-208ENST00000538616 SEPHS1P49903 392 aa18.71■□□□□ 0.59
CD27-AS1-208ENST00000538616 ITIH4Q14624 930 aa18.71■□□□□ 0.59
CD27-AS1-208ENST00000538616 KCNJ11Q14654 390 aa18.71■□□□□ 0.59
CD27-AS1-208ENST00000538616 BRD3Q15059 726 aa18.71■□□□□ 0.59
CD27-AS1-208ENST00000538616 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP18.71■□□□□ 0.59
CD27-AS1-208ENST00000538616 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP18.71■□□□□ 0.59
CD27-AS1-208ENST00000538616 IRGCQ6NXR0 463 aa18.71■□□□□ 0.59
CD27-AS1-208ENST00000538616 LRRC8BQ6P9F7 803 aa18.71■□□□□ 0.59
CD27-AS1-208ENST00000538616 FAM92BQ6ZTR7 304 aa18.71■□□□□ 0.59
CD27-AS1-208ENST00000538616 NLRP9Q7RTR0 991 aa18.71■□□□□ 0.59
CD27-AS1-208ENST00000538616 ACTRT1Q8TDG2 376 aa18.71■□□□□ 0.59
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