RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516877.1

RNU6-1234P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1234, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-1234P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1234P-201ENST00000516877 CATSPERDQ86XM0 798 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1234P-201ENST00000516877 TMEM139Q8IV31 216 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1234P-201ENST00000516877 TMEM57Q8N5G2 664 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1234P-201ENST00000516877 TTC8Q8TAM2 541 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1234P-201ENST00000516877 HM13Q8TCT9 377 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1234P-201ENST00000516877 RNF138Q8WVD3 245 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1234P-201ENST00000516877 STAMQ92783 540 aa0.45□□□□□ -2.34
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RNU6-1234P-201ENST00000516877 TMEM39BQ9GZU3 492 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1234P-201ENST00000516877 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1234P-201ENST00000516877 CLEC5AQ9NY25 188 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1234P-201ENST00000516877 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1234P-201ENST00000516877 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa0.45□□□□□ -2.34
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RNU6-1234P-201ENST00000516877 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP0.45□□□□□ -2.34
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RNU6-1234P-201ENST00000516877 COL1A2P08123 1366 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1234P-201ENST00000516877 TENM3Q9P273 2699 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1234P-201ENST00000516877 OR2M5A3KFT3 312 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1234P-201ENST00000516877 PINLYPA6NC86 204 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1234P-201ENST00000516877 VWA3AA6NCI4 1184 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1234P-201ENST00000516877 USP17L23D6RBM5 183 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1234P-201ENST00000516877 PDXKO00764 312 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1234P-201ENST00000516877 APAF1O14727 1248 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1234P-201ENST00000516877 EPHB6O15197 1021 aa0.44□□□□□ -2.34
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RNU6-1234P-201ENST00000516877 SEC24AO95486 1093 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1234P-201ENST00000516877 CD5P06127 495 aa0.44□□□□□ -2.34
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RNU6-1234P-201ENST00000516877 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP0.44□□□□□ -2.34
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RNU6-1234P-201ENST00000516877 HRH2P25021 359 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1234P-201ENST00000516877 PTPN3P26045 913 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1234P-201ENST00000516877 CST5P28325 142 aaPredicted RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1234P-201ENST00000516877 ELK3P41970 407 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1234P-201ENST00000516877 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1234P-201ENST00000516877 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1234P-201ENST00000516877 COL28A1Q2UY09 1125 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1234P-201ENST00000516877 RRM2BQ7LG56 351 aa0.44□□□□□ -2.34
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RNU6-1234P-201ENST00000516877 PLD5Q8N7P1 536 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1234P-201ENST00000516877 TPRX1Q8N7U7 411 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1234P-201ENST00000516877 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1234P-201ENST00000516877 C4orf32Q8N8J7 132 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1234P-201ENST00000516877 SLC38A9Q8NBW4 561 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1234P-201ENST00000516877 OR14L1PQ8NHC6 308 aa0.44□□□□□ -2.34
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RNU6-1234P-201ENST00000516877 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP0.44□□□□□ -2.34
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RNU6-1234P-201ENST00000516877 UMPSP11172 480 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1234P-201ENST00000516877 PPM1AP35813 382 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1234P-201ENST00000516877 TM4SF4P48230 202 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1234P-201ENST00000516877 ZBED6P86452 979 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1234P-201ENST00000516877 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP0.43□□□□□ -2.34
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RNU6-1234P-201ENST00000516877 SQLEQ14534 574 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1234P-201ENST00000516877 TIGD6Q17RP2 521 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1234P-201ENST00000516877 LINC00242Q5T6M2 205 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1234P-201ENST00000516877 TMEM207Q6UWW9 146 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1234P-201ENST00000516877 CCDC190Q86UF4 302 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1234P-201ENST00000516877 HIPK1Q86Z02 1210 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1234P-201ENST00000516877 RNF175Q8N4F7 328 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1234P-201ENST00000516877 ZNF540Q8NDQ6 660 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1234P-201ENST00000516877 OR2L5Q8NG80 312 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1234P-201ENST00000516877 LINC01006Q8NI28 216 aa0.43□□□□□ -2.34
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