RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511807.1

UBE2B-208, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

TSL 3

Gene UBE2B, Length 818 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-208ENST00000511807 C9orf172C9J069 976 aa11.11□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 H3BMM5 538 aa11.11□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 ZW10O43264 779 aa11.11□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 ATP8B1O43520 1251 aa11.11□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 VEGFDO43915 354 aa11.11□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 CDH16O75309 829 aa11.11□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 PIAS1O75925 651 aa11.11□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 HAUS5O94927 633 aa11.11□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 AP2A2O94973 939 aa11.11□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 ASMTLO95671 621 aa11.11□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 PRSS56P0CW18 603 aa11.11□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 CCL4P13236 92 aa11.11□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP11.11□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 ADARP55265 1226 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 MPP1Q00013 466 aa11.11□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 CTBSQ01459 385 aa11.11□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 GTF2H3Q13889 308 aa11.11□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 SEMA3AQ14563 771 aa11.11□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP11.11□□□□□ -0.639e-7■■□□□ 13.8
UBE2B-208ENST00000511807 RASA2Q15283 850 aa11.11□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 LINC00303Q3SY05 128 aa11.11□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 KRT71Q3SY84 523 aa11.11□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 TMEM164Q5U3C3 297 aa11.11□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 ADGRD1Q6QNK2 874 aa11.11□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 TDRPQ86YL5 185 aa11.11□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 EXD3Q8N9H8 876 aa11.11□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa11.11□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 RCBTB1Q8NDN9 531 aa11.11□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 OR2W6PQ8NHA6 318 aa11.11□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 COX14Q96I36 57 aa11.11□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 CCDC74BQ96LY2 380 aa11.11□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 ZIM3Q96PE6 472 aa11.11□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 RBBP8Q99708 897 aa11.11□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 DHRS4Q9BTZ2 278 aa11.11□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 FAM117AQ9C073 453 aa11.11□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 ZMYND15Q9H091 742 aa11.11□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 RHOJQ9H4E5 214 aa11.11□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 GNPTGQ9UJJ9 305 aa11.11□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa11.11□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 CRYL1Q9Y2S2 319 aa11.11□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa11.11□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 PSAT1Q9Y617 370 aa11.11□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 NFS1Q9Y697 457 aa11.11□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa11.11□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa11.1□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa11.1□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 GPR89AB7ZAQ6 455 aa11.1□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 GPR39O43194 453 aa11.1□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 KALRNO60229 2985 aa11.1□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 CDK14O94921 469 aa11.1□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 ESR1P03372 595 aa11.1□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 OR56A5P0C7T3 313 aa11.1□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 GPR89BP0CG08 455 aa11.1□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 FMO4P31512 558 aa11.1□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 ACTR1BP42025 376 aa11.1□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 LIMK2P53671 638 aa11.1□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 SLC12A2P55011 1212 aa11.1□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 ACTR1AP61163 376 aa11.1□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 CEP85LQ5SZL2 805 aa11.1□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 NKAIN2Q5VXU1 208 aa11.1□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 CNSTQ6PJW8 725 aa11.1□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF438Q7Z4V0 828 aa11.1□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 TRIM74Q86UV6 250 aa11.1□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 NAGSQ8N159 534 aa11.1□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 DCAKDQ8WVC6 231 aa11.1□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 LPGAT1Q92604 370 aa11.1□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 MTBPQ96DY7 904 aa11.1□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 VPS39Q96JC1 886 aa11.1□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 TSSK1BQ9BXA7 367 aa11.1□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 RMI1Q9H9A7 625 aa11.1□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 SLC17A6Q9P2U8 582 aa11.1□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa11.1□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa11.1□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa11.1□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 ST14Q9Y5Y6 855 aa11.1□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 RP1P56715 2156 aa11.09□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa11.09□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 SMIM23A6NLE4 172 aa11.09□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 MAP2K7O14733 419 aa11.09□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 HGSO14964 777 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 PPM1DO15297 605 aa11.09□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 OR1I1O60431 355 aa11.09□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 FAM155BO75949 473 aa11.09□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 ITGB2P05107 769 aa11.09□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 FAM87AP0C7U9 286 aa11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.7 ms