RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492545.1

CTDSP1-211, Transcript of CTD small phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDSP1, Length 634 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1-211ENST00000492545 TCN2P20062 427 aa22.97■■□□□ 1.27
CTDSP1-211ENST00000492545 SHMT2P34897 504 aa22.97■■□□□ 1.27
CTDSP1-211ENST00000492545 DLSTP36957 453 aa22.97■■□□□ 1.27
CTDSP1-211ENST00000492545 MICALCLQ6ZW33 695 aa22.97■■□□□ 1.27
CTDSP1-211ENST00000492545 RASGEF1CQ8N431 466 aa22.97■■□□□ 1.27
CTDSP1-211ENST00000492545 LHX9Q9NQ69 397 aa22.97■■□□□ 1.27
CTDSP1-211ENST00000492545 SOHLH2Q9NX45 425 aa22.97■■□□□ 1.27
CTDSP1-211ENST00000492545 TUBD1Q9UJT1 453 aa22.97■■□□□ 1.27
CTDSP1-211ENST00000492545 CROTQ9UKG9 612 aa22.97■■□□□ 1.27
CTDSP1-211ENST00000492545 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa22.97■■□□□ 1.27
CTDSP1-211ENST00000492545 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
CTDSP1-211ENST00000492545 BTN3A3O00478 584 aa22.96■■□□□ 1.27
CTDSP1-211ENST00000492545 BTN3A1O00481 513 aa22.96■■□□□ 1.27
CTDSP1-211ENST00000492545 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
CTDSP1-211ENST00000492545 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
CTDSP1-211ENST00000492545 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
CTDSP1-211ENST00000492545 CDC20Q12834 499 aa22.96■■□□□ 1.27
CTDSP1-211ENST00000492545 PRKG2Q13237 762 aa22.96■■□□□ 1.27
CTDSP1-211ENST00000492545 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
CTDSP1-211ENST00000492545 LRRC6Q86X45 466 aa22.96■■□□□ 1.27
CTDSP1-211ENST00000492545 OR5K2Q8NHB8 316 aa22.96■■□□□ 1.27
CTDSP1-211ENST00000492545 HGH1Q9BTY7 390 aa22.96■■□□□ 1.27
CTDSP1-211ENST00000492545 KIFC1Q9BW19 673 aa22.96■■□□□ 1.27
CTDSP1-211ENST00000492545 STARD5Q9NSY2 213 aa22.96■■□□□ 1.27
CTDSP1-211ENST00000492545 OR6C2Q9NZP2 312 aa22.96■■□□□ 1.27
CTDSP1-211ENST00000492545 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
CTDSP1-211ENST00000492545 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa22.95■■□□□ 1.26
CTDSP1-211ENST00000492545 TERTO14746 1132 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
CTDSP1-211ENST00000492545 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
CTDSP1-211ENST00000492545 RPN2P04844 631 aa22.95■■□□□ 1.26
CTDSP1-211ENST00000492545 MAGEA6P43360 314 aa22.95■■□□□ 1.26
CTDSP1-211ENST00000492545 SLC22A15Q8IZD6 547 aa22.95■■□□□ 1.26
CTDSP1-211ENST00000492545 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa22.95■■□□□ 1.26
CTDSP1-211ENST00000492545 OR5AR1Q8NGP9 310 aa22.95■■□□□ 1.26
CTDSP1-211ENST00000492545 SEC14L1Q92503 715 aa22.95■■□□□ 1.26
CTDSP1-211ENST00000492545 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
CTDSP1-211ENST00000492545 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
CTDSP1-211ENST00000492545 LRFN5Q96NI6 719 aa22.95■■□□□ 1.26
CTDSP1-211ENST00000492545 GPR87Q9BY21 358 aa22.95■■□□□ 1.26
CTDSP1-211ENST00000492545 GRPEL1Q9HAV7 217 aa22.95■■□□□ 1.26
CTDSP1-211ENST00000492545 ACTR10Q9NZ32 417 aa22.95■■□□□ 1.26
CTDSP1-211ENST00000492545 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa22.95■■□□□ 1.26
CTDSP1-211ENST00000492545 KPNA5O15131 536 aa22.94■■□□□ 1.26
CTDSP1-211ENST00000492545 PFDN6O15212 129 aa22.94■■□□□ 1.26
CTDSP1-211ENST00000492545 ZSCAN12O43309 604 aa22.94■■□□□ 1.26
CTDSP1-211ENST00000492545 SCRG1O75711 98 aa22.94■■□□□ 1.26
CTDSP1-211ENST00000492545 TIAF1O95411 115 aa22.94■■□□□ 1.26
CTDSP1-211ENST00000492545 APOA4P06727 396 aa22.94■■□□□ 1.26
CTDSP1-211ENST00000492545 ITGB6P18564 788 aa22.94■■□□□ 1.26
CTDSP1-211ENST00000492545 CCR7P32248 378 aa22.94■■□□□ 1.26
CTDSP1-211ENST00000492545 BRD3Q15059 726 aa22.94■■□□□ 1.26
CTDSP1-211ENST00000492545 HOOK3Q86VS8 718 aa22.94■■□□□ 1.26
CTDSP1-211ENST00000492545 TMEM126BQ8IUX1 230 aa22.94■■□□□ 1.26
CTDSP1-211ENST00000492545 PANX3Q96QZ0 392 aa22.94■■□□□ 1.26
CTDSP1-211ENST00000492545 ICKQ9UPZ9 632 aa22.94■■□□□ 1.26
CTDSP1-211ENST00000492545 PIPSLA2A3N6 862 aa22.93■■□□□ 1.26
CTDSP1-211ENST00000492545 GPC4O75487 556 aa22.93■■□□□ 1.26
CTDSP1-211ENST00000492545 NTRK1P04629 796 aa22.93■■□□□ 1.26
CTDSP1-211ENST00000492545 PRKAR1AP10644 381 aa22.93■■□□□ 1.26
CTDSP1-211ENST00000492545 PLA2G2AP14555 144 aa22.93■■□□□ 1.26
CTDSP1-211ENST00000492545 F8A1P23610 371 aa22.93■■□□□ 1.26
CTDSP1-211ENST00000492545 CRADDP78560 199 aa22.93■■□□□ 1.26
CTDSP1-211ENST00000492545 HSPA14Q0VDF9 509 aa22.93■■□□□ 1.26
CTDSP1-211ENST00000492545 SEMA3AQ14563 771 aa22.93■■□□□ 1.26
CTDSP1-211ENST00000492545 TMED2Q15363 201 aa22.93■■□□□ 1.26
CTDSP1-211ENST00000492545 GPR19Q15760 415 aa22.93■■□□□ 1.26
CTDSP1-211ENST00000492545 MRNIPQ6NTE8 343 aa22.93■■□□□ 1.26
CTDSP1-211ENST00000492545 UNC5AQ6ZN44 842 aa22.93■■□□□ 1.26
CTDSP1-211ENST00000492545 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
CTDSP1-211ENST00000492545 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
CTDSP1-211ENST00000492545 PPM1MQ96MI6 270 aa22.93■■□□□ 1.26
CTDSP1-211ENST00000492545 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa22.93■■□□□ 1.26
CTDSP1-211ENST00000492545 TCF12Q99081 682 aa22.93■■□□□ 1.26
CTDSP1-211ENST00000492545 AP1M1Q9BXS5 423 aa22.93■■□□□ 1.26
CTDSP1-211ENST00000492545 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa22.93■■□□□ 1.26
CTDSP1-211ENST00000492545 SLC25A18Q9H1K4 315 aa22.93■■□□□ 1.26
CTDSP1-211ENST00000492545 XKR8Q9H6D3 395 aa22.93■■□□□ 1.26
CTDSP1-211ENST00000492545 GNPTGQ9UJJ9 305 aa22.93■■□□□ 1.26
CTDSP1-211ENST00000492545 SERTAD3Q9UJW9 196 aa22.93■■□□□ 1.26
CTDSP1-211ENST00000492545 SOX13Q9UN79 622 aa22.93■■□□□ 1.26
CTDSP1-211ENST00000492545 MAGEB16A2A368 324 aa22.92■■□□□ 1.26
CTDSP1-211ENST00000492545 NDUFS3O75489 264 aa22.92■■□□□ 1.26
CTDSP1-211ENST00000492545 SLCO2B1O94956 709 aa22.92■■□□□ 1.26
CTDSP1-211ENST00000492545 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
CTDSP1-211ENST00000492545 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP22.92■■□□□ 1.26
CTDSP1-211ENST00000492545 MGAT1P26572 445 aa22.92■■□□□ 1.26
CTDSP1-211ENST00000492545 NMBRP28336 390 aa22.92■■□□□ 1.26
CTDSP1-211ENST00000492545 POLE2P56282 527 aa22.92■■□□□ 1.26
CTDSP1-211ENST00000492545 GPS1Q13098 491 aa22.92■■□□□ 1.26
CTDSP1-211ENST00000492545 DNASE1L3Q13609 305 aa22.92■■□□□ 1.26
CTDSP1-211ENST00000492545 CYP1B1Q16678 543 aa22.92■■□□□ 1.26
CTDSP1-211ENST00000492545 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
CTDSP1-211ENST00000492545 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
CTDSP1-211ENST00000492545 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa22.92■■□□□ 1.26
CTDSP1-211ENST00000492545 SPESP1Q6UW49 350 aa22.92■■□□□ 1.26
CTDSP1-211ENST00000492545 CPT1BQ92523 772 aa22.92■■□□□ 1.26
CTDSP1-211ENST00000492545 TWSG1Q9GZX9 223 aa22.92■■□□□ 1.26
CTDSP1-211ENST00000492545 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
CTDSP1-211ENST00000492545 KATNA1O75449 491 aa22.91■■□□□ 1.26
CTDSP1-211ENST00000492545 CREG1O75629 220 aa22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.3 ms