RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491659.5

USP39-217, Transcript of ubiquitin specific peptidase 39, humanhuman

TSL 3

Gene USP39, Length 648 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP39-217ENST00000491659 NAPRTQ6XQN6 538 aa14.65□□□□□ -0.06
USP39-217ENST00000491659 LRRC6Q86X45 466 aa14.65□□□□□ -0.06
USP39-217ENST00000491659 D2HGDHQ8N465 521 aa14.65□□□□□ -0.06
USP39-217ENST00000491659 GALNT6Q8NCL4 622 aa14.65□□□□□ -0.06
USP39-217ENST00000491659 OR5AR1Q8NGP9 310 aa14.65□□□□□ -0.06
USP39-217ENST00000491659 OR5K2Q8NHB8 316 aa14.65□□□□□ -0.06
USP39-217ENST00000491659 COG1Q8WTW3 980 aa14.65□□□□□ -0.06
USP39-217ENST00000491659 ASZ1Q8WWH4 475 aa14.65□□□□□ -0.06
USP39-217ENST00000491659 RNF31Q96EP0 1072 aa14.65□□□□□ -0.06
USP39-217ENST00000491659 MFSD3Q96ES6 412 aa14.65□□□□□ -0.06
USP39-217ENST00000491659 SLC45A3Q96JT2 553 aa14.65□□□□□ -0.06
USP39-217ENST00000491659 FCRL4Q96PJ5 515 aa14.65□□□□□ -0.06
USP39-217ENST00000491659 PANX3Q96QZ0 392 aa14.65□□□□□ -0.06
USP39-217ENST00000491659 SLC12A9Q9BXP2 914 aa14.65□□□□□ -0.06
USP39-217ENST00000491659 C1GALT1Q9NS00 363 aa14.65□□□□□ -0.06
USP39-217ENST00000491659 FGF21Q9NSA1 209 aa14.65□□□□□ -0.06
USP39-217ENST00000491659 GNPTGQ9UJJ9 305 aa14.65□□□□□ -0.06
USP39-217ENST00000491659 SNX12Q9UMY4 172 aa14.65□□□□□ -0.06
USP39-217ENST00000491659 BTRCQ9Y297 605 aa14.65□□□□□ -0.06
USP39-217ENST00000491659 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
USP39-217ENST00000491659 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa14.65□□□□□ -0.06
USP39-217ENST00000491659 TMEM63AO94886 807 aa14.64□□□□□ -0.07
USP39-217ENST00000491659 VAPBO95292 243 aa14.64□□□□□ -0.07
USP39-217ENST00000491659 RPN2P04844 631 aa14.64□□□□□ -0.07
USP39-217ENST00000491659 CCNYL3P0C7X3 344 aa14.64□□□□□ -0.07
USP39-217ENST00000491659 MLNP12872 115 aa14.64□□□□□ -0.07
USP39-217ENST00000491659 ACADLP28330 430 aa14.64□□□□□ -0.07
USP39-217ENST00000491659 TUBB4BP68371 445 aa14.64□□□□□ -0.07
USP39-217ENST00000491659 MC1RQ01726 317 aa14.64□□□□□ -0.07
USP39-217ENST00000491659 HSPA14Q0VDF9 509 aa14.64□□□□□ -0.07
USP39-217ENST00000491659 TUBB2AQ13885 445 aa14.64□□□□□ -0.07
USP39-217ENST00000491659 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
USP39-217ENST00000491659 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
USP39-217ENST00000491659 ANKRD22Q5VYY1 191 aa14.64□□□□□ -0.07
USP39-217ENST00000491659 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
USP39-217ENST00000491659 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa14.64□□□□□ -0.07
USP39-217ENST00000491659 CES3Q6UWW8 571 aa14.64□□□□□ -0.07
USP39-217ENST00000491659 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
USP39-217ENST00000491659 HOOK3Q86VS8 718 aa14.64□□□□□ -0.07
USP39-217ENST00000491659 SLC22A15Q8IZD6 547 aa14.64□□□□□ -0.07
USP39-217ENST00000491659 UNC5BQ8IZJ1 945 aa14.64□□□□□ -0.07
USP39-217ENST00000491659 GSDMBQ8TAX9 411 aa14.64□□□□□ -0.07
USP39-217ENST00000491659 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa14.64□□□□□ -0.07
USP39-217ENST00000491659 STARD8Q92502 1023 aa14.64□□□□□ -0.07
USP39-217ENST00000491659 CPT1BQ92523 772 aa14.64□□□□□ -0.07
USP39-217ENST00000491659 EXTL1Q92935 676 aa14.64□□□□□ -0.07
USP39-217ENST00000491659 MED8Q96G25 268 aa14.64□□□□□ -0.07
USP39-217ENST00000491659 TUBB2BQ9BVA1 445 aa14.64□□□□□ -0.07
USP39-217ENST00000491659 XKR8Q9H6D3 395 aa14.64□□□□□ -0.07
USP39-217ENST00000491659 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
USP39-217ENST00000491659 ACTR10Q9NZ32 417 aa14.64□□□□□ -0.07
USP39-217ENST00000491659 ICKQ9UPZ9 632 aa14.64□□□□□ -0.07
USP39-217ENST00000491659 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa14.63□□□□□ -0.07
USP39-217ENST00000491659 IQCF5A8MTL0 148 aa14.63□□□□□ -0.07
USP39-217ENST00000491659 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
USP39-217ENST00000491659 AVILO75366 819 aa14.63□□□□□ -0.07
USP39-217ENST00000491659 C1QL1O75973 258 aa14.63□□□□□ -0.07
USP39-217ENST00000491659 TCP1P17987 556 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
USP39-217ENST00000491659 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP14.63□□□□□ -0.073e-13■■■■□ 26.3
USP39-217ENST00000491659 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
USP39-217ENST00000491659 CCR7P32248 378 aa14.63□□□□□ -0.07
USP39-217ENST00000491659 DLSTP36957 453 aa14.63□□□□□ -0.07
USP39-217ENST00000491659 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
USP39-217ENST00000491659 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
USP39-217ENST00000491659 PPP1R7Q15435 360 aa14.63□□□□□ -0.07
USP39-217ENST00000491659 GPR19Q15760 415 aa14.63□□□□□ -0.07
USP39-217ENST00000491659 TBR1Q16650 682 aa14.63□□□□□ -0.07
USP39-217ENST00000491659 TMEM126BQ8IUX1 230 aa14.63□□□□□ -0.07
USP39-217ENST00000491659 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa14.63□□□□□ -0.07
USP39-217ENST00000491659 KRT222Q8N1A0 295 aa14.63□□□□□ -0.07
USP39-217ENST00000491659 MCUQ8NE86 351 aa14.63□□□□□ -0.07
USP39-217ENST00000491659 OR8K5Q8NH50 307 aa14.63□□□□□ -0.07
USP39-217ENST00000491659 PPM1MQ96MI6 270 aa14.63□□□□□ -0.07
USP39-217ENST00000491659 CATSPER2Q96P56 530 aa14.63□□□□□ -0.07
USP39-217ENST00000491659 P2RY12Q9H244 342 aa14.63□□□□□ -0.07
USP39-217ENST00000491659 SYTL2Q9HCH5 934 aa14.63□□□□□ -0.07
USP39-217ENST00000491659 CROTQ9UKG9 612 aa14.63□□□□□ -0.07
USP39-217ENST00000491659 PIPSLA2A3N6 862 aa14.62□□□□□ -0.07
USP39-217ENST00000491659 GOLGA8MH3BSY2 632 aa14.62□□□□□ -0.07
USP39-217ENST00000491659 KPNA5O15131 536 aa14.62□□□□□ -0.07
USP39-217ENST00000491659 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
USP39-217ENST00000491659 SCRG1O75711 98 aa14.62□□□□□ -0.07
USP39-217ENST00000491659 TIAF1O95411 115 aa14.62□□□□□ -0.07
USP39-217ENST00000491659 OGNP20774 298 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
USP39-217ENST00000491659 ARNTP27540 789 aa14.62□□□□□ -0.07
USP39-217ENST00000491659 AOAHP28039 575 aa14.62□□□□□ -0.07
USP39-217ENST00000491659 CDC20Q12834 499 aa14.62□□□□□ -0.07
USP39-217ENST00000491659 TYSND1Q2T9J0 566 aa14.62□□□□□ -0.07
USP39-217ENST00000491659 LINC00303Q3SY05 128 aa14.62□□□□□ -0.07
USP39-217ENST00000491659 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa14.62□□□□□ -0.07
USP39-217ENST00000491659 BORAQ6PGQ7 559 aa14.62□□□□□ -0.07
USP39-217ENST00000491659 SPESP1Q6UW49 350 aa14.62□□□□□ -0.07
USP39-217ENST00000491659 UNC5DQ6UXZ4 953 aa14.62□□□□□ -0.07
USP39-217ENST00000491659 UNC5AQ6ZN44 842 aa14.62□□□□□ -0.07
USP39-217ENST00000491659 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
USP39-217ENST00000491659 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa14.62□□□□□ -0.07
USP39-217ENST00000491659 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
USP39-217ENST00000491659 SERPINB12Q96P63 405 aa14.62□□□□□ -0.07
USP39-217ENST00000491659 NRTNQ99748 197 aa14.62□□□□□ -0.07
USP39-217ENST00000491659 PITPNM3Q9BZ71 974 aa14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.5 ms