RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486388.5

UBP1-210, Transcript of upstream binding protein 1, human

TSL 3

Gene UBP1, Length 928 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBP1-210	ENST00000486388	FANCE	Q9HB96	536 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	APMAP	Q9HDC9	416 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	NT5M	Q9NPB1	228 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	POT1	Q9NUX5	634 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	GPATCH2L	Q9NWQ4	482 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	TAB2	Q9NYJ8	693 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	WHRN	Q9P202	907 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	TNFRSF10D	Q9UBN6	386 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	TBC1D29	Q9UFV1	150 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	CD84	Q9UIB8	345 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	RARRES3	Q9UL19	164 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	KCNK6	Q9Y257	313 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	PPIL1	Q9Y3C6	166 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	TTLL3	Q9Y4R7	772 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	PCDHGA9	Q9Y5G4	932 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	PCDHGA6	Q9Y5G7	932 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	MN1	Q10571	1320 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	NOTCH2	Q04721	2471 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	FLNC	Q14315	2725 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388		A0A0J9YYE9	177 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388		A1L4Q6	167 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	RGSL1	A5PLK6	1076 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	NUDT19	A8MXV4	375 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	TMCO5B	A8MYB1	307 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	OVOL3	O00110	214 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	FFAR3	O14843	346 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	KMO	O15229	486 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	AKAP8	O43823	692 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	MAFK	O60675	156 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	DNAJA2	O60884	412 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	SPAG6	O75602	509 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	TRBC1	P01850	177 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	ATP1A1	P05023	1023 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	ALPP	P05187	535 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	MYBL1	P10243	752 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	GM2A	P17900	193 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	XRCC1	P18887	633 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	IDS	P22304	550 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	PTPN4	P29074	926 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	MIP	P30301	263 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	SSR1	P43307	286 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	UQCRFS1	P47985	274 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	LEPR	P48357	1165 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	CCL11	P51671	97 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	STC1	P52823	247 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	PER3	P56645	1201 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	JAM2	P57087	298 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	GSDMD	P57764	484 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	MAX	P61244	160 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	RPL26	P61254	145 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	UBXN1	Q04323	297 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	PTP4A2	Q12974	167 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	MAMLD1	Q13495	774 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	TUBB3	Q13509	450 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	GTF2H3	Q13889	308 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	KRT81	Q14533	505 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	DPCR1	Q3MIW9	517 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	ZNF569	Q5MCW4	686 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	TMTC4	Q5T4D3	741 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	LYPLAL1	Q5VWZ2	237 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	CCDC70	Q6NSX1	233 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	IRGC	Q6NXR0	463 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	ARHGAP36	Q6ZRI8	547 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	TMEM26	Q6ZUK4	368 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	TECPR1	Q7Z6L1	1165 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	TSPAN33	Q86UF1	283 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	TMEM126B	Q8IUX1	230 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	ARHGAP12	Q8IWW6	846 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	RHOT1	Q8IXI2	618 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	MCOLN2	Q8IZK6	566 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	SLC34A3	Q8N130	599 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	PELI3	Q8N2H9	469 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	ZC3H8	Q8N5P1	291 aa	Known RBP eCLIP	4.63	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	NPW	Q8N729	165 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	BVES	Q8NE79	360 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	OR8K5	Q8NH50	307 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	FNIP1	Q8TF40	1166 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	TM9SF4	Q92544	642 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	HSPH1	Q92598	858 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	COX14	Q96I36	57 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	C5orf34	Q96MH7	638 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	ZNF830	Q96NB3	372 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	AGPAT1	Q99943	283 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	ANP32E	Q9BTT0	268 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	ZSCAN5A	Q9BUG6	496 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	MLPH	Q9BV36	600 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	KLHL25	Q9H0H3	589 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	ING2	Q9H160	280 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	NUP62CL	Q9H1M0	184 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	GAN	Q9H2C0	597 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	ACTL8	Q9H568	366 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	LHX9	Q9NQ69	397 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	SAMSN1	Q9NSI8	373 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	KLC4	Q9NSK0	619 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	STAU2	Q9NUL3	570 aa	Known RBP eCLIP	4.63	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	PRR13	Q9NZ81	148 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	CWC15	Q9P013	229 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	RCOR3	Q9P2K3	495 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	AMACR	Q9UHK6	382 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	SNX7	Q9UNH6	387 aa		4.63	□□□□□ -1.67

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.8 ms