RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455157.6

SSUH2-208, Transcript of ssu-2 homolog (C. elegans), human

TSL 2

Gene SSUH2, Length 3,219 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSUH2-208	ENST00000455157	DNMT3L	Q9UJW3	386 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	PCDHB3	Q9Y5E6	796 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	PCDHA9	Q9Y5H5	950 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	RLF	Q13129	1914 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157		A0A1W2PQ72	361 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	C17orf102	A2RUQ5	167 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	MEN1	O00255	615 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	PDHX	O00330	501 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	NDUFS2	O75306	463 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	ZNF682	O95780	498 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	SERPINF2	P08697	491 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	FOSL1	P15407	271 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	AGXT	P21549	392 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	ALDH7A1	P49419	539 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	PGF	P49763	221 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	C10orf120	Q5SQS8	335 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	AGAP6	Q5VW22	663 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	LRRC8D	Q7L1W4	858 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	GLT6D1	Q7Z4J2	308 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	SPRED1	Q7Z699	444 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	SYVN1	Q86TM6	617 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	PLD3	Q8IV08	490 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	HID1	Q8IV36	788 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	CFAP52	Q8N1V2	620 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	TMEM199	Q8N511	208 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	ITCH	Q96J02	903 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	AGAP4	Q96P64	663 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	UGT2B28	Q9BY64	529 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	ZYG11B	Q9C0D3	744 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	ST3GAL5	Q9UNP4	418 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	NIPSNAP2	O75323	286 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	UPK1B	O75841	260 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	RAP2A	P10114	183 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	G6PD	P11413	515 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	ICAM2	P13598	275 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	PSEN2	P49810	448 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	EEFSEC	P57772	596 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	ZNF33A	Q06730	810 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	HIST2H2AC	Q16777	129 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	AP5B1	Q2VPB7	878 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	ZFP69	Q49AA0	526 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	SLC39A12	Q504Y0	691 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	KANK2	Q63ZY3	851 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	ZNF549	Q6P9A3	640 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	KDELC1	Q6UW63	502 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	EFL1	Q7Z2Z2	1120 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	BNIPL	Q7Z465	357 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	LGI2	Q8N0V4	545 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	EID3	Q8N140	333 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	DTWD1	Q8N5C7	304 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	SIDT2	Q8NBJ9	832 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	PSMA8	Q8TAA3	256 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	LINGO1	Q96FE5	620 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	IMP4	Q96G21	291 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	SERPINB11	Q96P15	392 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	C8orf4	Q9NR00	106 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	AASS	Q9UDR5	926 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	INVS	Q9Y283	1065 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	GPR45	Q9Y5Y3	372 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	LAMA3	Q16787	3333 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	TEX51	A0A1B0GUA7	166 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	ARL5C	A6NH57	179 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	RPP40	O75818	363 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	INMT	O95050	263 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	TCF3	P15923	654 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	SERPINB10	P48595	397 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	PPP5C	P53041	499 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	TARDBP	Q13148	414 aa	Known RBP eCLIP	11.16	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	KCNAB2	Q13303	367 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	COL19A1	Q14993	1142 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	ZNF792	Q3KQV3	632 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	IRAK1BP1	Q5VVH5	260 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	ANKRD34A	Q69YU3	496 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	TRAF7	Q6Q0C0	670 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	MICU2	Q8IYU8	434 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	POC5	Q8NA72	575 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	PSD4	Q8NDX1	1056 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	PIK3C3	Q8NEB9	887 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	OR52B6	Q8NGF0	335 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	SKA2	Q8WVK7	121 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	ULK4	Q96C45	1275 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	MTFMT	Q96DP5	389 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	ZFYVE19	Q96K21	471 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	ACAT2	Q9BWD1	397 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	C1QTNF7	Q9BXJ2	289 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	ACTR8	Q9H981	624 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	NMUR1	Q9HB89	426 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	ABCB10	Q9NRK6	738 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	CENPX	A8MT69	81 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	GPR182	O15218	404 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	UROS	P10746	265 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	AKT1	P31749	480 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	HTR2B	P41595	481 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	CLK1	P49759	484 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	CSRP3	P50461	194 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	CRYBB1	P53674	252 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	ERVK-8	P63133	956 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	CTF1	Q16619	201 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	MAPKAPK3	Q16644	382 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	YIF1B	Q5BJH7	314 aa		11.16	□□□□□ -0.62

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