RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445241.5

PTPA-222, Transcript of protein phosphatase 2 phosphatase activator, human

TSL 3

Gene PTPA, Length 949 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPA-222	ENST00000445241	SATB2	Q9UPW6	733 aa		14.24	□□□□□ -0.13
PTPA-222	ENST00000445241	CAPN5	O15484	640 aa	Predicted RBP	14.23	□□□□□ -0.13
PTPA-222	ENST00000445241	NIPSNAP2	O75323	286 aa		14.23	□□□□□ -0.13
PTPA-222	ENST00000445241	VPS26A	O75436	327 aa		14.23	□□□□□ -0.13
PTPA-222	ENST00000445241	HAUS5	O94927	633 aa		14.23	□□□□□ -0.13
PTPA-222	ENST00000445241	ITGB6	P18564	788 aa		14.23	□□□□□ -0.13
PTPA-222	ENST00000445241	RBMS1	P29558	406 aa	Known RBP	14.23	□□□□□ -0.13
PTPA-222	ENST00000445241	CSTF2	P33240	577 aa	Known RBP eCLIP	14.23	□□□□□ -0.13
PTPA-222	ENST00000445241	PRKAA1	Q13131	559 aa		14.23	□□□□□ -0.13
PTPA-222	ENST00000445241	CUL1	Q13616	776 aa		14.23	□□□□□ -0.13
PTPA-222	ENST00000445241	BRD3	Q15059	726 aa		14.23	□□□□□ -0.13
PTPA-222	ENST00000445241	C3orf38	Q5JPI3	329 aa		14.23	□□□□□ -0.13
PTPA-222	ENST00000445241	ARMC6	Q6NXE6	501 aa		14.23	□□□□□ -0.13
PTPA-222	ENST00000445241	DUS1L	Q6P1R4	473 aa	Known RBP	14.23	□□□□□ -0.13
PTPA-222	ENST00000445241	CYB5D1	Q6P9G0	228 aa		14.23	□□□□□ -0.13
PTPA-222	ENST00000445241	TTC23L	Q6PF05	361 aa		14.23	□□□□□ -0.13
PTPA-222	ENST00000445241	KMT5C	Q86Y97	462 aa		14.23	□□□□□ -0.13
PTPA-222	ENST00000445241	MARCH9	Q86YJ5	346 aa		14.23	□□□□□ -0.13
PTPA-222	ENST00000445241	DCUN1D3	Q8IWE4	304 aa		14.23	□□□□□ -0.13
PTPA-222	ENST00000445241	UNC5B	Q8IZJ1	945 aa		14.23	□□□□□ -0.13
PTPA-222	ENST00000445241	LCN9	Q8WX39	176 aa		14.23	□□□□□ -0.13
PTPA-222	ENST00000445241	UBXN4	Q92575	508 aa		14.23	□□□□□ -0.13
PTPA-222	ENST00000445241	RSC1A1	Q92681	617 aa		14.23	□□□□□ -0.13
PTPA-222	ENST00000445241	CDKL2	Q92772	493 aa		14.23	□□□□□ -0.13
PTPA-222	ENST00000445241	INPP5D	Q92835	1189 aa		14.23	□□□□□ -0.13
PTPA-222	ENST00000445241	PRR11	Q96HE9	360 aa	Predicted RBP	14.23	□□□□□ -0.13
PTPA-222	ENST00000445241	TWSG1	Q9GZX9	223 aa		14.23	□□□□□ -0.13
PTPA-222	ENST00000445241	SRMS	Q9H3Y6	488 aa		14.23	□□□□□ -0.13
PTPA-222	ENST00000445241	THSD1	Q9NS62	852 aa		14.23	□□□□□ -0.13
PTPA-222	ENST00000445241	TAS2R13	Q9NYV9	303 aa		14.23	□□□□□ -0.13
PTPA-222	ENST00000445241	OR6C2	Q9NZP2	312 aa		14.23	□□□□□ -0.13
PTPA-222	ENST00000445241	DHRS7	Q9Y394	339 aa		14.23	□□□□□ -0.13
PTPA-222	ENST00000445241	LOXL2	Q9Y4K0	774 aa		14.23	□□□□□ -0.13
PTPA-222	ENST00000445241	PCDHGA7	Q9Y5G6	932 aa		14.23	□□□□□ -0.13
PTPA-222	ENST00000445241	AK5	Q9Y6K8	562 aa		14.23	□□□□□ -0.13
PTPA-222	ENST00000445241	PRAMEF33	A0A0G2JMD5	474 aa		14.22	□□□□□ -0.13
PTPA-222	ENST00000445241		A0A1W2PNU3	283 aa	Predicted RBP	14.22	□□□□□ -0.13
PTPA-222	ENST00000445241	TLCD2	A6NGC4	264 aa		14.22	□□□□□ -0.13
PTPA-222	ENST00000445241	CDRT15L2	A8MXV6	281 aa		14.22	□□□□□ -0.13
PTPA-222	ENST00000445241	C1QTNF9B	B2RNN3	333 aa		14.22	□□□□□ -0.13
PTPA-222	ENST00000445241		B4E171	279 aa		14.22	□□□□□ -0.13
PTPA-222	ENST00000445241	BRINP1	O60477	761 aa		14.22	□□□□□ -0.13
PTPA-222	ENST00000445241	MATN4	O95460	622 aa		14.22	□□□□□ -0.13
PTPA-222	ENST00000445241	AHSG	P02765	367 aa		14.22	□□□□□ -0.13
PTPA-222	ENST00000445241	MPO	P05164	745 aa		14.22	□□□□□ -0.13
PTPA-222	ENST00000445241	C1QTNF9	P0C862	333 aa		14.22	□□□□□ -0.13
PTPA-222	ENST00000445241	JMJD7	P0C870	316 aa		14.22	□□□□□ -0.13
PTPA-222	ENST00000445241	TYRP1	P17643	537 aa		14.22	□□□□□ -0.13
PTPA-222	ENST00000445241	TSPAN7	P41732	249 aa		14.22	□□□□□ -0.13
PTPA-222	ENST00000445241	MAGEA4	P43358	317 aa		14.22	□□□□□ -0.13
PTPA-222	ENST00000445241	CARS	P49589	748 aa	Known RBP	14.22	□□□□□ -0.13
PTPA-222	ENST00000445241	RAB15	P59190	212 aa		14.22	□□□□□ -0.13
PTPA-222	ENST00000445241	MPP1	Q00013	466 aa		14.22	□□□□□ -0.13
PTPA-222	ENST00000445241	CYP4F3	Q08477	520 aa		14.22	□□□□□ -0.13
PTPA-222	ENST00000445241	NAB1	Q13506	487 aa		14.22	□□□□□ -0.13
PTPA-222	ENST00000445241	TBC1D25	Q3MII6	688 aa		14.22	□□□□□ -0.13
PTPA-222	ENST00000445241	HP1BP3	Q5SSJ5	553 aa	Predicted RBP	14.22	□□□□□ -0.13
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF549	Q6P9A3	640 aa		14.22	□□□□□ -0.13
PTPA-222	ENST00000445241	TRMT10B	Q6PF06	316 aa	Known RBP	14.22	□□□□□ -0.13
PTPA-222	ENST00000445241	CNST	Q6PJW8	725 aa		14.22	□□□□□ -0.13
PTPA-222	ENST00000445241	CLEC14A	Q86T13	490 aa		14.22	□□□□□ -0.13
PTPA-222	ENST00000445241	AMIGO1	Q86WK6	493 aa		14.22	□□□□□ -0.13
PTPA-222	ENST00000445241	VRK3	Q8IV63	474 aa		14.22	□□□□□ -0.13
PTPA-222	ENST00000445241	OR52E1	Q8NGJ3	308 aa		14.22	□□□□□ -0.13
PTPA-222	ENST00000445241	OR5AR1	Q8NGP9	310 aa		14.22	□□□□□ -0.13
PTPA-222	ENST00000445241	SNIP1	Q8TAD8	396 aa	Known RBP	14.22	□□□□□ -0.13
PTPA-222	ENST00000445241	HGH1	Q9BTY7	390 aa		14.22	□□□□□ -0.13
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF768	Q9H5H4	540 aa	Known RBP	14.22	□□□□□ -0.13
PTPA-222	ENST00000445241	ASCL3	Q9NQ33	180 aa		14.22	□□□□□ -0.13
PTPA-222	ENST00000445241	HRASLS2	Q9NWW9	162 aa		14.22	□□□□□ -0.13
PTPA-222	ENST00000445241	DMGDH	Q9UI17	866 aa	Known RBP	14.22	□□□□□ -0.13
PTPA-222	ENST00000445241	ACSL6	Q9UKU0	697 aa		14.22	□□□□□ -0.13
PTPA-222	ENST00000445241	MED16	Q9Y2X0	877 aa		14.22	□□□□□ -0.13
PTPA-222	ENST00000445241	AHCTF1	Q8WYP5	2266 aa		14.22	□□□□□ -0.13
PTPA-222	ENST00000445241	URB1	O60287	2271 aa	Known RBP	14.21	□□□□□ -0.13
PTPA-222	ENST00000445241	ESYT3	A0FGR9	886 aa		14.21	□□□□□ -0.13
PTPA-222	ENST00000445241	NVL	O15381	856 aa	Known RBP	14.21	□□□□□ -0.13
PTPA-222	ENST00000445241	MPC1L	P0DKB6	136 aa		14.21	□□□□□ -0.13
PTPA-222	ENST00000445241	CD82	P27701	267 aa		14.21	□□□□□ -0.13
PTPA-222	ENST00000445241	GABRB3	P28472	473 aa		14.21	□□□□□ -0.13
PTPA-222	ENST00000445241	STX2	P32856	288 aa		14.21	□□□□□ -0.13
PTPA-222	ENST00000445241	TUBB4B	P68371	445 aa		14.21	□□□□□ -0.13
PTPA-222	ENST00000445241	C16orf72	Q14CZ0	275 aa		14.21	□□□□□ -0.13
PTPA-222	ENST00000445241	TRADD	Q15628	312 aa		14.21	□□□□□ -0.13
PTPA-222	ENST00000445241	KYNU	Q16719	465 aa		14.21	□□□□□ -0.13
PTPA-222	ENST00000445241	FAM45BP	Q6NSW5	357 aa		14.21	□□□□□ -0.13
PTPA-222	ENST00000445241	NAPRT	Q6XQN6	538 aa		14.21	□□□□□ -0.13
PTPA-222	ENST00000445241	C3orf62	Q6ZUJ4	267 aa		14.21	□□□□□ -0.13
PTPA-222	ENST00000445241	PROSER1	Q86XN7	944 aa		14.21	□□□□□ -0.13
PTPA-222	ENST00000445241	RAB42	Q8N4Z0	105 aa		14.21	□□□□□ -0.13
PTPA-222	ENST00000445241	FBXO15	Q8NCQ5	510 aa	Predicted RBP	14.21	□□□□□ -0.13
PTPA-222	ENST00000445241	FAM45A	Q8TCE6	357 aa		14.21	□□□□□ -0.13
PTPA-222	ENST00000445241	CD200R1	Q8TD46	325 aa		14.21	□□□□□ -0.13
PTPA-222	ENST00000445241	ZCCHC14	Q8WYQ9	949 aa	Known RBP	14.21	□□□□□ -0.13
PTPA-222	ENST00000445241	KLHL6	Q8WZ60	621 aa		14.21	□□□□□ -0.13
PTPA-222	ENST00000445241	RAD51AP1	Q96B01	352 aa		14.21	□□□□□ -0.13
PTPA-222	ENST00000445241	ZPBP	Q9BS86	351 aa		14.21	□□□□□ -0.13
PTPA-222	ENST00000445241	DDA1	Q9BW61	102 aa		14.21	□□□□□ -0.13
PTPA-222	ENST00000445241	TMEM9	Q9P0T7	183 aa		14.21	□□□□□ -0.13
PTPA-222	ENST00000445241	POMT2	Q9UKY4	750 aa		14.21	□□□□□ -0.13

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