RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444916.5

SH3BP4-205, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene SH3BP4, Length 570 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-205ENST00000444916 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP13.74□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 GOLGA8MH3BSY2 632 aa13.74□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 EFSO43281 561 aa13.74□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 RAD1O60671 282 aa13.74□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 NDUFS3O75489 264 aa13.74□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 STK17BO94768 372 aa13.74□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 APOA4P06727 396 aa13.74□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 ITGB6P18564 788 aa13.74□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 PAMP19021 973 aa13.74□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP13.74□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP13.74□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 CCR7P32248 378 aa13.74□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 MAGEA3P43357 314 aa13.74□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP13.74□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP13.74□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 TYSND1Q2T9J0 566 aa13.74□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP13.74□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP13.74□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP13.74□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP13.74□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 CREG2Q8IUH2 290 aa13.74□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 PPIL6Q8IXY8 311 aa13.74□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 SLC22A15Q8IZD6 547 aa13.74□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa13.74□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 EXD3Q8N9H8 876 aa13.74□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 OR52E1Q8NGJ3 308 aa13.74□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 OR5AR1Q8NGP9 310 aa13.74□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 ASZ1Q8WWH4 475 aa13.74□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 CAPZA3Q96KX2 299 aa13.74□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 PANX3Q96QZ0 392 aa13.74□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 OR6C1Q96RD1 312 aa13.74□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 P2RY12Q9H244 342 aa13.74□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP13.74□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 ASIC3Q9UHC3 531 aa13.74□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 PCYOX1Q9UHG3 505 aa13.74□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 POMT2Q9UKY4 750 aa13.74□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 ASF1AQ9Y294 204 aa13.74□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 SAR1BQ9Y6B6 198 aa13.74□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 GSAPA4D1B5 854 aa13.73□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 CTAGE9A4FU28 777 aa13.73□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 BTN3A1O00481 513 aa13.73□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 PFDN6O15212 129 aa13.73□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 GPC4O75487 556 aa13.73□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP13.73□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 FGF5P12034 268 aa13.73□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 AOAHP28039 575 aa13.73□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 HSD11B2P80365 405 aa13.73□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 NFKB2Q00653 900 aa13.73□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP13.73□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 HSPA14Q0VDF9 509 aa13.73□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 NFATC3Q12968 1075 aa13.73□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 PRKG2Q13237 762 aa13.73□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 PTK6Q13882 451 aa13.73□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 TMED2Q15363 201 aa13.73□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa13.73□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 AMIGO1Q86WK6 493 aa13.73□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 TBC1D21Q8IYX1 336 aa13.73□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 NLGN4XQ8N0W4 816 aa13.73□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 KRT222Q8N1A0 295 aa13.73□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 D2HGDHQ8N465 521 aa13.73□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 IL22RA1Q8N6P7 574 aa13.73□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP13.73□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 OR5K2Q8NHB8 316 aa13.73□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP13.73□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 TCF12Q99081 682 aa13.73□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 POLG2Q9UHN1 485 aa13.73□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 ICKQ9UPZ9 632 aa13.73□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 CDYLQ9Y232 598 aa13.73□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa13.73□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 GOLGA8KD6RF30 607 aa13.72□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 GOLGA8TH3BQL2 631 aa13.72□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 BTN3A3O00478 584 aa13.72□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP13.72□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 SLCO2B1O94956 709 aa13.72□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 DLGAP3O95886 979 aa13.72□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 EBLN1P0CF75 366 aa13.72□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 FOLR1P15328 257 aa13.72□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 OGNP20774 298 aaKnown RBP13.72□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP13.72□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 SHMT2P34897 504 aa13.72□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 ARL4DP49703 201 aa13.72□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 CSRP3P50461 194 aa13.72□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 ADARP55265 1226 aaKnown RBP13.72□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 ACY1Q03154 408 aa13.72□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 TUBB3Q13509 450 aa13.72□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 MAP7Q14244 749 aa13.72□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 KCNAB1Q14722 419 aa13.72□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP13.72□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP13.72□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 PCGF5Q86SE9 256 aa13.72□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 TMEM135Q86UB9 458 aa13.72□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 PPP1R3BQ86XI6 285 aa13.72□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 LURAP1LQ8IV03 231 aa13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.9 ms